i
• TFIIF, który wiąże się z polimerazą RNA II i odgrywa rolę w jej przyłączeniu się do kompleksu preinicjacyjnego, oraz wspomaga elongację transkrypcji;
• TFUH, ma aktywność helikazy, jest niezbędny do rozsunięcia nici DNA na obszarze promotora i do rozpoczęcia elongacji. Związana z nim kinaza (TFIIK) może fosforylować domenę na C-końcu największej podjednostki polimerazy RNA II
Po przyłączeniu polimerazy RNA na skutek rozerwania wiązań łączących pary zasad wewnątrz krótkiego fragmentu podwójnej helisy DNA, następuje przekształcenie zamkniętego kompleksu promotorowego w kompleks otwarty. Rozpoczyna się synteza RNA.
W przypadku genów transkrybowanych przez polimerazę RNA II, najpierw z promotorem łączy się TFI1D, jeden z podstawowych czynników transkrypcyjnych. Jest to kompleks białkowy, w skład którego wchodzi białko wiążące sekwencję TATA oraz przynajmniej 12 białek oddziałujących z TBP. TBP jest białkiem wiążącym się ze specyficzną sekwencją DNA poprzez nietypową domenę TBP, która oddziałuje z DNA w mniejszym rowku w rejonie sekwencji TATA. Tworzy się platforma, do której przyłączają się pozostałe elementy kompleksu inicjacyjnego.
Po przyłączeniu TFIID do promotora podstawowego tworzy się kompleks preinicjacyjny. Po aktywacji kompleksu inicjacyjnego niezbędna jest także fosforylacja domeny C-końcowej, największej podjednostki polimerazy RNA II. Po tej fosforylacji polimeraza może odłączyć się od kompleksu preinicjacynego i rozpocząć syntezę RNA.
W skład kompleksu inicjacyjnego polimerazy RNA I wchodzi sama polimeraza i 4 dodatkowe kompleksy białkowe, dwa z nich to:
• UBF - dimer składający się z dwóch identycznych białek oddziałujących zarówno z promotorem podstawowym, jak i z położonym powyżej kompleksem kontrolnym UCE
• SL1 ( u człowieka) - w jego skład wchodzi TBP. Razem z UBF kompleks ten umożliwia wiązanie się z promotorem polimerazy RNA I i pozostałych dwóch kompleksów ( TIF - IA iTIF-IC).
l3.Charaktervstka białek wiążących specyficznie DNA. Rola białek wiążących iednoniciowy DNA (SSB) w procesie replikacj DNA
• SSB wiążą się z niesparowanymi, jednoniciowymi polinukleotydami, powstałymi w wyniku działania helikazy w celu zapobiegania ponownemu łączeniu się łańcuchów w struktury dwuniciowe lub ich degradacji przez nukleazy hydrolizujące jednoniciowy DNA
• Struktura eukariotycznego SSB o nazwie RPA. Białko ma strukturę harmonijki (3, tworzącą kanał, w którym DNA ulega przyłączeniu
Białko pośredniczące RNP - białko odpowiadające za uwalnianie białek, które wiążą jednoniciowy DNA w czasie replikacji
Czynnik replikacyjny C (RFC) - zbudowane z wielu podjednostek białko pomocnicze, biorące udział w replikacji genomów eukariotycznych - spełnia kontrolę nad dołączaniem i odłączaniem się enzymu z matrycy nici opóźnionej
Domena typu helisa - skręt - helisa - pierwsza zidentyfikowana struktuta wiążąca DNA. Jest zbudowana z dwóch helis a oddzielonych skrętem w łańcuchu białkowym. Struktura skrętu nie
28