Odpowiednie pobranie nasienia ma bardzo ważne znaczenie zarówno dla oceny płodności ogiera jak i użycie do inseminacji.
Nasienie pobrane przy pomocy sztucznej pochwy zamkniętej od zdrowych ogierów zawsze zawiera liczne bakterie.
Bakterie pochodzą głównie z napletka i żołędzi prącia.
Mycie prącia nie zmniejsza zanieczyszczeń nasienia, gdyż bakterie znajdują się w uchyłkach i kryptach żołędzi prącia.