Dalsze wydłużanie łańcucha może zachodzić jedynie pod warunkiem przeniesienia reszty maJonylowej na grupę -SH 4’- fbsfopantoteiny, która zajęta jest przez nasyconą grupę acyiową. Dlatego w końcowym etapie tych przemian dochodzi do połączenia reszty małonytowej do grupy -SH 4’-fosfopantoteiny z jednoczesnym wyparciem reszty aeyfowej na wolną grupę -SH cysteiny.
Reszta kwasu palmitynowego jest uwalniana z kompleksu syntetazy kw. Puszczowych działaniem tioesterazy.