Struktura przestrzenna DNA obejmuje 4 poziomy: pierwszorzędowe DNA - kolejność nukleotydów (sekwencja) w łańcuchu polinukleotydowym,
drugorzędowe DNA - dwa heliksowo zwinięte łańcuchy,
trzeciorzędowe DNA - specyficzna konfiguracja w przestrzeni wielkocząsteczkowego podwójnego heliksu DNA,
czwartorzędowe DNA - być może oddziaływanie wzajemne cząsteczek DNA mających swoje określone struktury 1,11,111-rzędowe.