• mniej więcej połowa nukleotydów tRNA jest sparowana i tworzy dwuniciowe helisy
• 4 lub 5 grup nieparujących się zasad: koniec CC A, 3 pętle: antykodonu, dihydrouracylu (zawiera kilka cząsteczek DHU) pętla T^C oraz ramię dodatkowe o zmiennej liczbie nukleotydów.
• pętla antykodonu zawiera 7 zasad
• 10 - 25% nukleotydów w poszczególnych tRNA ulega modyfikacjom
• znanych jest ok. 80 różnych modyfikacji nukleotydów w tRNA