Organ zarządzający 90rgan zarządzający prowadzi sprawy SCE na własną odpowiedzialność oraz reprezentuje ją w stosunkach z osobami trzecimi oraz przed sądami. Państwo członkowskie może postanowić, że dyrektor wykonawczy prowadzi sprawy bieżące związane z zarządzaniem na własną odpowiedzialność, na tych samych zasadach, jakie są przewidziane w przypadku spółdzielni mających statutową siedzibę na terytorium tego państwa członkowskiego (art. 37 ust. 1 rozporządzenia). Na gruncie polskiego prawa krajowego, zgodnie z art. 13 ustawy
0 SCE, zarząd może powierzyć członkowi zarządu prowadzenie spraw związanych
z kierowaniem bieżącą działalnością gospodarczą SCE lub jej wyodrębnionej organizacyjnie
1 gospodarczo jednostki (dyrektor wykonawczy).
Członek lub członkowie organu zarządzającego są powoływani i odwoływani przez organ nadzorczy. Jednakże państwo członkowskie może wymagać lub zezwolić na określenie w statucie, aby członek lub członkowie organu zarządzającego byli powoływani i odwoływani przez walne zgromadzenie na tych samych warunkach, które przewidziane są w spółdzielniach mających statutową siedzibę na terytorium tego państwa członkowskiego (art. 37 ust 2 rozporządzenia). W świetle art. 15 ustawy o SCE członek zarządu może być odwołany przez walne zgromadzenie na zasadach określonych w art. 49 § 4 Prawa spółdzielczego, niezależnie od kompetencji przysługujących w tym zakresie radzie nadzorczej, a ponadto statut SCE może przewidywać, że członków zarządu powołuje lub odwołuje walne zgromadzenie.
9Nie można być jednocześnie członkiem organu zarządzającego i nadzorczego tej samej SCE. Jednakże organ nadzorczy może wyznaczyć jednego ze swych członków do wykonywania obowiązków członka organu zarządzającego, jeżeli funkcja ta jest nieobsadzona. W tym okresie funkcje tej osoby jako członka organu nadzorczego ulegają zawieszeniu. Państwo członkowskie może przewidzieć ograniczenie czasowe (art. 37 ust. 3 rozporządzenia). Na mocy art. 16 ustawy o SCE członek rady nadzorczej wyznaczony do czasowego wykonywania obowiązków członka zarządu może pełnić te obowiązki przez okres nie dłuższy niż trzy miesiące.
Liczbę członków organu zarządzającego lub zasady jej wyznaczania określa statut SCE, przy czym państwa członkowskie mogą określić maksymalną lub minimalną liczbę członków tego organu (art. 37 ust. 4 rozporządzenia).
Organ zarządzający wybiera przewodniczącego spośród swoicłi członków, zgodnie ze statutem. Przewodniczący zwołuje posiedzenie organu zarządzającego, na zasadach przewidzianych w statucie, z własnej inicjatywy lub na wniosek któregokolwiek z członków. Wniosek taki musi podawać powody zwołania posiedzenia. Jeżeli nie uwzględniono wniosku w terminie 15 dni, posiedzenie organu zarządzającego może być zwołane przez członka, względnie członków, którzy złożyli wniosek (art. 38 rozporządzenia).