•dihydroorotan + NAD+ utleniany do orotanu
•orołan zostaje związany z rybozą z 5-fosforybozylo- 1-pirofosporanu (PRPP) - aktywowana forma rybozy zdolna do przyłączania zasad nukleotydowych, powstaje z rybozo - 5 fosforanu > utworzenie nukleotydu pirymidynowego orotydylan katalizowany przez fosforybozylotransferazę pirymidynową
•orotydylan dekarboksylacja do urydynalu (UMP) - prekursor RNA - katalizowany przez
dckarboksylazę orotydylanową
cytydyna:
•nnkleozydy monofosforanowe przekształcone w di fosforany, enzym - kinaza nuklezymonofosforanowa - wykorzystanie ATP jako źródło grup fosforanowych •di i tri fosforany nukleozydów ulegają wzajemnym przemianom
•trifosforan cytydyny powstaje z trifosforanu urydyny przez wymianę tlenu gntpy karbonylowej na grupę aminową (wymaga ATP oraz glutaminy); CTP do syntezy RNA zasady purynowe:
•wymiana pirofosforanu na grupę aminową, powstaje 5-fosforybozylo-1-amina (grupa aminowa w konfiguracji beta), enzym - fosforybozyloaminotrasferaza glutaminowa budowa enzymu: dwie domeny: pierwsza homologiczna do fosforybozylotransfcraz. druga odpowiedzialna za pozyskiwanie jonów amonowych z hydrolizy glutaminy; konfiguracja aktywna tylko przy związaniu PRPP i glutaminy, jony amonowe przenoszone tunelowo na PRPP
•złożenie pierścienia purynowego:
a) glicyna związana do gnipy aminowej fosforybozyloamin, gnipa karboksylaza glicyny aktywowana przez fosforylację i przyłączenie do gnipy aminowej fosforybozyloaminy
b) N 10-formylotetrahydrofolian przenosi gmpę fonnylową na grupę aminową glicyny, aktywacja mrówczanu i jego przyłączenie do gnipy aminowej glicyny prowadzi do powstania rybonuklcotydu fonnyloglicynoamidowego, dwa enzymy: 1 dostarcza grupę fonnylową z N20-fonnylotetrahydrofohanu, 2. aktywuje mrówczan do fonnylofosforanu, który zostaje dołączony do grupy aminowej glicyny
c) przeniesienie atomu azotu z glicyny, podstawienie tlenu karbonylowego gnipą NH prowadzi do powitania rybonukleotydu formyloglicynoamidynowego, atom N pochodzi z bocznego łańcucha glicyny z udziałem ATP
d) powstanie 5 sklądnikowego pierścienia imidazolowego, produkt: rybonukleotyd formyloglicyloamidynowy cyklizuje sie w wieloskładnikowy pierścień imidazolowy, 1ATP zużyta do zablokowania odwracalności reakcji, gnipa fosforanowa ATP aktywuje tlen gnipy karbonylowej, które zostaje zamieniony na N przyłączony bezpośrednio do rybozy
e) przyłączenie wodorowęglanu do egzocyklicznej gnipy aminowej i do atomu C pierścienia liuidazolu, jon wodorowęglanowy zostaje aktywowany przez fosforylację, następnie atakowany pizez egzocykliczną grupę aminową, później przeniesienie gnipy karbosylowej na pierścień (bez ATP)
f) grupa karbosylowa imidazolu ulega fosforylacji, po której gnipa fosforanowa podstawiona jest gnipą aminową z asparagimanu
etapy te są homologiczne, każdy etap składa się z aktywacji tlenu związanego z atomem C (gr karbonylowa) na drodze fosfory lacji, po której następuje wymiana grupy fosforanow ej na jon amonowy lub grupę aminową działające jak nukleofile
g) usunięcie fumaranu Fumaran ulega eliminacji pozostawiając atom N przyłączony do pierścienia.