H
formamid
Wolna para elektronów atomu azotu jest sprzężona z elektronami TC funkcji karbonylowej i przez to atom ten nie tylko traci właściwości zasadowe (powinowactwo do protonu) ale rónież wiązanie C-N częściowo nabiera charakteru wiązania podwójnego i obrót wokół niego wymaga pokonania większego oporu niż wokół większości pojedynczych wiązań.
h3c" "NRR-
Silne kwasy są wstanie utworzyć sól z amidami, jednak proton w nich w większym stopniu związany jest z atomem tlenu niż azotu.
h3c'
-c.
nh2 h3c^Cvnh,
W wyniku zahamowania swobodnego obrotu wokół wiązania C-N w amidach podstawionych obserwuje się efekt tworzenia konformerów cis/trans. Zjawisko to często występujące w peptydach i białkach, szczególnie często w miejscu, którego komponentem jest prolina.
a /H |
°v / |
/C-N, - |
C-N / \ trans |
R R' |
R H |
konformery podstawionych amidów
Występowanie
Amidy w postaci peptydów i białek są bardzo rozpowszechnione w przyrodzie. Są to związki, w których wiązanie amidowe, zwane wiązaniami peptydowymi utworzone są pomiędzy grupą aminową jednego aminokwasu i grupą karboksylową drugiego aminokwasu. W skład białek mogą wchodzić reszty od 1 (X) do wielu tysięcy reszt aminokwasów, w peptydach od 2-100.
|nh-ch-$-nh-ch-$-nh-ch-$-^-fragment peptydu lub białka (megapeptydu l
Amidami są dwa kodowane aminokwasy - asparagina i glutamina.
((lula mina