91114

Wydłużanie nici 5' do 3' wolnego końca - energia pochodzi z hydrolizy wiązania fosfodiestrowego

BIAŁKA BIORĄCE UDZIAŁ W REPLIKACJI DNA U BAKTERII

BIAŁKO - SUBSTRAT - FUNKGE

ssBs (wiążące) - ssDNA - utrzymuje separację nici

topoizomerazy (giraza) - dsDNA; ATP - wprowadzenie superhelisy stan wysokoenergetyczny primaza (polimeraza RNA DNA-zależna) - ssDNA; rNTP (rybonukleotydy) - synteza polimeru RNA (primer)

DNA polimeraza II - brak (polimeraza DNA II nie jest konieczna do normalnego wzrostu) -replikacja (odpowiedź SOS; przestawienie metabolizmu bakterii)

Helikazy - dsDNA - rozwijanie nici DNA w widełkach replikacyjnych (odpowiedzialne za rozpad wiązań wodorowych, te nici stabilizuje ssBs)

DNA-polimeraza III

1.    Syntetaza - 3'-OH-koniec primera RNA dNTP - synteza nowej nici DNA

2.    Egzonukleaza - błędnie sparowane zasady - naprawa DNA DNA-polimeraza I

1.    RNA egzonulkeaza - RNA-primer - usuwa

2.    DNA egzonukleaza - błędnie sparowane zasady - usuwa błędy

3.    Syntetaza - ssDNA - zastępuje RNA primer przez DNA DNA ligaza - ssDNA-fragmenty - łączenie

REPLIKACJA

Synteza nici opóźniającej

Inicjacja - RNA primer wydłużenie 5' do 3' primera RNA; oddysocjowanie primerazy -> przyłączanie dNTP do primera polimeraza DNA III polimeraza DNA I - uzupełnia luki degraduje primer -> kompletowanie DNA - polimeraza DNA I -> ligaza DNA - łączy wolne końce

Widełki replikacyjne - helikazy - ssBs - primaza na nici opóźniającej; fragm. Okazaki -polimeraza DNA III na nici wiodącej

NAPRAWA DNA

Przyłączenie nieprawidłowego (energia z nukleotydu w postaci trójfosforanu) i usunięcie go

MODEL TOCZĄCEGO SIĘ KOŁA - umożliwia genetyczne transfery między bakteriami Zachodzi najczęściej w elementach genetycznych dodatkowych, np. plazmidach Wolny koniec 3' - nacięcie jednej nici -> polimeraza DNA - addycja dNTP do wolnego 3'-OH nić, która została zastąpiona ssDNA

Ta wolna nić od 5' końca może być przekazywana do drugiej komórki bakterynej - na niej też może zajść proces replikacji, ale już w drugiej komórce - powstała nić jednak nie będzie replikacją ciągłą, tylko za pomocą fragm. Okazaki - w rezultacie komórka zyska fragment genetyczny w postaci podwójnej helisy

Komórka, która była dawcą zachowa podwójną helisę, a druga komórka zyska takie pozachromosomalne DNA