3784504067

SYLABUS PRZEDMIOTU NA STUDIACH WYŻSZYCH

Lp.	Elementy składowe sylabusu	Opis
1.	Nazwa przedmiotu	Molekularne podstawy ewolucji qenomów
2.	Nazwa jednostki prowadzącej przedmiot	Wydział Biotechnologii
3.	Kod przedmiotu	MolPodEwGenl
4.	Język wykładowy	Polski
5.	Grupa treści kształcenia, w ramach której przedmiot jest realizowany	-    grupa treści kierunkowych, -    grupa treści kształcenia do wyboru
6.	Typ przedmiotu	- obowiązkowy do ukończenia całego toku studiów
7.	Rok studiów, semestr	Studia II stopnia, semestr I
8.	Imią i nazwisko osoby (osób) prowadzącej przedmiot	dr hab. Paweł Mackiewicz -wykład prof. dr hab. Hanna Jańska, dr Sabina Janicka - ćwiczenia
9.	Metody dydaktyczne	Wykład i ćwiczenia
10.	Wymagania wstępne	Zaliczony kurs informatyki (obsługi komputera). Podstawowe informacje i zaliczone kursy z genetyki i biologii molekularnej oraz dobra znajomość języka anqielskieqo.
11.	Liczba godzin zajęć dydaktycznych	30/30
12.	Liczba punktów ECTS przypisana przedmiotowi	3/2 ECTS
13.	Założenie i cele przedmiotu	Umiejętność rozwiązywania różnych problemów z dziedziny biologii molekularnej, genomiki i ewolucji molekularnej w oparciu o narzędzia bioinformatyczne; nabycie umiejętności korzystania z różnych baz danych i posługiwania się programami i narzędziami do tworzenia przyrównać sekwencji i poszukiwania sekwencji podobnych w bazach; poznanie procedur analiz filogenetycznych - tworzenia drzew i ich oceny; nauczenie się analiz w skali całego genomu i wnioskowania o na tej podstawie o ich ewolucji; projektowanie i interpretacja eksperymentów dotyczących mechanizmów powstawania mutacji.
14.	Forma i warunki zaliczenia przedmiotu, w tym zasady dopuszczenia do egzaminu, zaliczenia z przedmiotu	Zajęcia praktyczne przy komputerze oraz kolokwia ustne (4-5); ocena prac dotyczących przedstawianych rozwiązań zadań problemowych oraz prezentacji przeczytanych artykułów. W końcowej ocenie uwzględniana jest również frekwencja na zajęciach.
15.	Treści merytoryczne przedmiotu oraz sposób ich realizacji	Podstawowe zagadnienia z dziedziny genomiki, bioinformatyki, filogenetyki i ewolucji molekularnej; rodzaje genomowych i bioinformatycznych baz danych; programy i narzędzia do przyrównania par i wielu sekwencji oraz poszukiwania sekwencji podobnych w bazach danych przy pomocy różnych algorytmów; programy i metody konstrukcji i oceny drzew filogenetycznych; narzędzia do analiz genomowych; zasady przekazywania, ekspresji i ewolucji informacji genetycznej i jej przekształcania w układ współpracujących ze sobą cząsteczek.
16.	Wykaz literatury podstawowej	1.    P.G. Higgs, T.K. Attwood. Bioinformatyka i ewolucja molekularna, PWN, 2008 2.    D. Graur, W.-H. Li. Fundamentals of Molecular Evolution (2nd edn). Sinauer Associates Inc., Sunderland, MA. 2000 3.    R.D.M. Page, E.C. Holmes. Molecular Evolution. A Phylogenetic Approach. Blackwell Science Ltd. 2000 4.    B. Hall. Łatwe drzewa filogenetyczne. WUW, 2008