2) Białka złożone - klasyfikuje się ze względu na rodzaj zawartej w białku substancji innej niż aminokwas, czyli w zależności od grupy prostetycznej. Wyróżnia się:
Fosforoproteidy - zawierające fosfor Glikoproteidy - zawierające węglowodany (glikogen) Hromoproteidy - zawierające substancje barwne o różnym charakterze
Metaloproteidy - zawierające jony metali Lipoproteidy - zawierające lipidy tłuszczowe Nukleoproteidy - są to białka zawierające jako grupę prostetyczną kwasy nukleinowe.