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Paa = p2 = 0.651249,

PAa = 2pq = 0.311502,

Paa = q2 = 0.037249.

- La statistiąue du test du x2 vaut :

2 _ (0.652 - 0.651249)2    (0.310 - 0.311502)2    (0.038 - 0.037249)2

X “    0.651249    +    0.311502    +    0.037249

= 0.000023249745.

Puisąue le seuil theoriąue du test est Xo.o5,<w/=i = 3*84, nous avons x2 ^ Xo.06,ddi=n on conclut que la population est en eąuilibre de Hardy-Weinberg.

1.1.7 Deseąuilibre de liaison

Le deseąuilibre de liaison (notę DL) (Lewontin,1964) est defini comme une associa-tion non aleatoire entre les alleles de deux loci (ou plus) proches l’un de 1’autre. A l’inverse, deux loci eloignśs tendent a etre en śąuilibre de liaison. Le DL joue un role central dans les ćtudes d’association des maladies complexes (Weiss et Clark, 2002; Nordborg et Tavare, 2002) puisąue les marąueurs testes sont supposes etre en deseąuilibre de liaison avec le locus de la maladie.

Par exemple, considerons une paire de SNPs ayant les alleles A/a et B/b. Notons Pa, Pa) Pb et Pb 1 es freąuences alleliąues correspondantes. Les haplotypes possibles sont ABy Aby aB et ab. Soient pAB, PAb) PaB et pab leurs freąuences haplotypiąues pour differentes combinaisons possibles des alleles. Si un individu a le genotype >4>4



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