3870137075

ZASTOSOWANIE SPEKTROSKOPII JĄDROWEGO REZONANSU MAGNETYCZNEGO 11

struktury o największych populacjach kompleksu TPT: DNA. dla modelu wielo kon-formacyjnego.

Lakton

Karboksylan

R¹ = H, R² = H    kamptotecyna - CPT

R¹ = OH, R² = CH₂N(CH3)₂ topotekan - TPT

Rysunek 5 Badane inhibitor} topoizomeraz} I, kamptotecyna (CPT) i topotekan (TPT) stosowany w lecznictwie klinicznym Równowaga lakton-karboksylanjest obserwowana w roztworach fizjologicznych

Formą aktywną biologicznie jest lakton

Rysunek 6 Dwie najbardziej prawdopodobne struktury w modelu wielokonformacyjnym kompleksu TPT DNA (przedstawiono tylko zewnętrzną parę GC z dupleksu oktameru d(GCGATCGC),)

Powiązanie zaawansowanych obliczeń dynamiki molekularnej ze spektroskopią NMR pozwoliło Bocianowi i wsp. [ 18 j precyzyjnie wy znaczyć strukturę slabozwią-zanego kompleksu TPT:DNA dla dekameru DNA z przerwaną nicią (patrz Rys. 7). By ło to możliwe nawet w obecności silmch efektów dynamicznych w widmach NMR, zw iązanych z odwracalnością procesu kompleksówania. Efekty te wywołah silne poszerzenie, a często w konsekwencji brak lub też znaczne zafałszowanie objętości wielu istotnych sygnałów NMR, co uniemożliwia wyznaczenie struktury takiego kompleksu metodami klasycznymi