Analiza Zmian na Poziomie Chromati Cyklu Komórkowym 13
Membran PVDF można używać kilkakrotnie - po ich wywołaniu, można odplukać przeciwciała I i II-rzędowe, a następnie powtórnie zablokować w mleku i powtórzyć inkubację z innymi przeciwciałami I-, a następnie II-rzędowymi.
Blokowanie membran
Po transferze wolne miejsca wiązania białek na membranie są blokowane, aby zapobiec niespecyficznej adsorpcji przeciwciał. Do blokowania membran najczęściej używa się odtłuszczonego mleka lub albuminy z surowicy cielęcej.
Wiązanie przeciwciał
Antygeny będące przedmiotem badań identyfikuje się przy użyciu wyznakowanych przeciwciał, bądź przeciwciał niewyznakowanych a identyfikowanych poprzez wyznakowane przeciwciała drugorzędowe specyficzne dla pierwszorzędowych. W końcu następuje detekcja, której sposób zależy od rodzaju użytych przeciwciał.
Detekcja
Metoda detekcji białek w technice western biot zależy od rodzaju znacznika, jaki dołączony jest do przeciwciał. Najczęściej stosowane są alkaliczna fosfataza lub peroksydaza chrzanowa. Wizualizacja tych enzymatycznych znaczników może być przeprowadzona kolorymetrycznie (alkaliczna fosfataza, w miejscu związania przeciwciał do białka na membranie powstaje barwny produkt) lub chemiluminescencyjnie (peroksydaza, enzym przeprowadza reakcję z wytworzeniem światła, które naświetla kliszę fotograficzną).
ECL
W trakcie ćwiczeń wykorzystujemy metodę chemiluminescencyjną (ECL - ehanced chemiluminescence). Chemiluminescencja polega na wydzieleniu energii powstałej w wyniku reakcji chemicznej w postaci światła. Peroksydaza (sprzężona z przeciwciałami II-rzędowymi) w obecności naddenku wodoru utlenia luminol, a produktem tej reakcji jest związek o niższym stanie energetycznym. Nadmiar energii uwalniany jest w postaci fotonów światła.
Cel doświadczenia
Celem ćwiczenia jest porównanie poziomu fosforylacji histonu H3 w dzielących się komórkach tytoniu (BY-2) i komórkach zatrzymanych w fazie G0 cyklu komórkowego.
Przejście zawiesiny do G„ uzyskuje się w przypadku komórek TBY-2 poprzez 30-krotne obniżenie zawartości sacharozy w pożywce.
Schemat doświadczenia:
- Izolacja białek histonowych z komórek tytoniu (BY-2).
- Ocena ilości wyizolowanych białek za pomocą SDS-PAGE.
- Rozdział elektroforetyczny wyizolowanych białek i transfer na membranę PVDF metodą pół-suchą.
- Detekcja fosforylowanego histonu H3 za pomocą specyficznych przeciwciał.
- Uwidocznienie związanych przeciwciał metodą ECL
- Analiza densytometryczna ilości wykrytego białka