Autoreferat dr Tomasz Gosiewski
Field Gel Electrophoresis: Methods and Protocols” pod redakcją Kieran Jordan i Marion Dalmasso wydawanym przez wydawnictwo Springer. Tytuł rozdziału to: „The use of PFGE method in genotyping of selected bacteria species of the Lactobacillus genus.” Podręcznik ukaże się w drugiej połowie 2015 roku.
Jestem współautorem 57 doniesień konferencyjnych na zjazdach krajowych (26 doniesień) oraz zagranicznych (31 doniesień).
Przytoczone wyżej wskaźniki bibliometryczne są odzwierciedleniem mojej pracy naukowej zawierające się w czterech szerszych tematach badawczych, którymi się zajmuję. Pierwszy z nich dotyczy diagnostyki molekularnej sepsy, jako alternatywy dla klasycznej diagnostyki opartej na posiewie i hodowli. Pierwsze kroki w ramach tego zagadnienia stawiałem jeszcze podczas przygotowywania mojej pracy magisterskiej w 2003 roku. Udało się wykazać że możliwe jest wykrycie bakterii (bez ich różnicowania) przy pomocy klasycznego PCR w próbkach krwi. W latach 2010-2014 wróciłem do tego tematu i udało mi się znacznie rozwinąć metodykę diagnostyczną patentując nowatorską metodę izolacji DNA drobnoustrojów z krwi (nr prawa wyłącznego 219490). Co więcej, opracowałem również metodę detekcji bakterii i grzybów przy wykorzystaniu techniki nested-multipleks-PCR w czasie rzeczywistym (nmPCR), która została zgłoszona do ochrony patentowej w trybie krajowym i międzynarodowym (procedury w toku). Owocem prac było także pięć artykułów naukowych z listy JCR, które wraz z patentem stanowią podstawę do ubiegania się o stopień naukowy doktora habilitowanego.
Kolejnym tematem badawczym którym się zajmuję, jest badanie flory przewodu pokarmowego człowieka w przebiegu nieswoistych zapaleń jelit (te badania prowadziłem pod kierunkiem Pani dr hab. Magdaleny Struś) oraz cukrzycy i otyłości (jestem kierownikiem projektu finansowanego przez NCN). Rezultatem tych badań jest do tej pory sześć artykułów w czasopismach z listy JCR posiadających wskaźnik IF.
Równocześnie prowadzę prace badawcze dotyczące nowych technik diagnostyki molekularnej stosowanych w bakteriologii. Do tej pory zajmowałem się opracowaniem metodyki PFGE (Pulsed-field Gradient Gel Electrophoresis) oraz techniki FISH (Fluorescent In Situ Hybridization) dla kilku gatunków bakterii probiotycznych. Poza tym, opracowałem technikę multipleks-PCR służącą wykrywaniu siedmiu różnych markerów genetycznych bakterii Streptococcus agalactiae, która jest użyteczna w diagnostyce zakażeń wywołanych przez tę bakterię. Wynikiem tych prac są dwie publikacje w czasopismach w EF.
Kraków, 2015
5