Ćwiczenie nr 2
Skład chemiczny komórek
Wszystkie pierwiastki występujące w komórce można posegregować w trzy kategorie
Podstawowe - ich zawartość waha się od 2 do 60% (tlen, węgiel, wodór i azot
Śladowe (makroelementy) - od 0,02 do 2% (wapń, siarka, fosfor, sód, potas, chlor i magnez
Mikroelementy - w ilości mniejszej od 0,01% (bor, chrom, cynk, cyna, fluor, jod, kobalt, krzem, miedź, mangan, molibden, nikiel, selen, wanad, żelazo)
Składniki mineralne wchodzą w skład struktur organizmu lub uczestniczą w różnych procesach metabolicznych. Można je podzielić na trzy grupy ze względu na pełnioną funkcję.
Makroelementy to związki mineralne, które tworzą elementy strukturalne kości i innych tkanek, należą do nich związki wapnia, fosforu i siarki oraz pierwiastki biorące udział w utrzymaniu równowagi kwasowo-zasadowej krwi i tkanek, oraz utrzymania potencjału spoczynkowego błon komórkowych. Należą do nich: sód, potas, magnez, wapń, chlor, fosfor i siarka.
Najliczniejszą grupę stanowią mikroelementy, niezbędne w tworzeniu enzymów, hormonów i białek transportowych oraz przebiegu procesów metabolicznych. Należą do nich pierwiastki; żelazo, miedź, jod, cynk, mangan, kobalt, molibden, nikiel, chrom, cyna, fluor, wanad, selen, krzem i bor. W śladowych ilościach występuje w organizmie człowieka glin i kadm, pierwiastki, których funkcja nie jest jeszcze dobrze wyjaśniona.
Biopierwiastki występują w organizmie w postaci kwasów, zasad lub soli. Rozpuszczone w wodzie dysocjują na jony dodatnie - kationy i jony ujemne - aniony.
PIERWIASTEK |
ROLA |
WYSTĘPOWANIE |
TLEN (O) |
pierwiastek chem. podstawowy - w organizmie człowieka (70 kg) jest ok. 45 kg t. w postaci podstawowych dla życia związków: wody, węglowodanów, tłuszczów, białek, kwasów nukleinowych, witamin i in.; pierwiastek najbardziej rozpowszechniony w przyrodzie. |
|
WĘGIEL ( C ) |
Pierwiastek podstawowy - w organizmie człowieka (70 kg) jest ok. 13 kg w. wchodzącego w skład podstawowych dla życia związków: węglowodanów, tłuszczów, białek, kwasów nukleinowych, witamin . |
|
WODÓR (H) |
Pierwiastek podstawowy- w organizmie człowieka (70 kg) jest ok. 7 kg w. (składnik podstawowych dla życia związków: wody, węglowodanów, tłuszczów |
|
AZOT (N) |
Pierwiastek podstawowy - 5,1% masy, występuje zawsze w aminokwasach (budujących białka) i zasadach azotowych, wchodzących w skład DNA i RNA. Azot znajduje się też w witaminach: B1, B2, B6, B12 i PP |
|
MAKROELEMENTY |
||
WAPŃ (Ca) |
1,4% masy, w postaci fosforanu wapnia buduje kości i zęby Poza tym, pełni ważną rolę w odbiorze sygnału płynącego do komórki z zewnątrz (np. sygnału do skurczu mięśnia, przewodnictwie bodźców nerwowych), kofaktor wielu enzymów, Rola w przepuszczalności błon komórkowych, regulacji pobudliwości nerwów, krzepliwości krwi, |
|
FOSFOR (P) |
0,63% masy, występuje w ATP - uniwersalnym nośniku energii komórki, w DNA, RNA, fosfocukrach, ufosforylowanych białkach i w fosfolipidach - integralnych składnikach błon komórkowych. Fosforan wapnia to główny budulec kości składnik kości i zębów, kwasów nukleinowych, tkanki mózgowej, błon komórkowych, związków wysokoenergetycznych, koenzymów, główny anion wewnątrzkomórkowy, udział w reakcjach fosforylacji, utrzymaniu pH krwi (składnik buforów) |
|
MAGNEZ (Mg) |
składnik kości i zębów, tkanek miękkich; bierze udział w przewodnictwie nerwowym, kurczliwości mięsni (antagonista wapnia), syntezie kwasów nukleinowych i białka, metabolizmie lipidów, termoregulacji, aktywator enzymów (głównie kinaz). |
proszek kakaowy, |
SÓD (Na) |
główny kation płynu zewnątrzkomórkowego, występuje w soku trzustkowym i jelitowym, kościach; składnik Na+/K+ ATP-azy, reguluje gospodarkę wodną (objętość osocza, ciśnienie osmotyczne płynów pozakomórkowych), wpływa na równowagę kwasowo-zasadową, bierze udział w kurczliwości mięśni i przewodnictwie nerwowym, transporcie aminokwasów, cukrów itp. W ostatnich latach stwierdzono niekorzystne działanie nadmiaru spożywanego sodu objawiające się powstawaniem nadciśnienia tętniczego krwi, szczególnie u osób mających genetycznie uwarunkowane skłonności do tej choroby. Nadmiar sodu zwiększa też ryzyko powstawania raka żołądka i udarów mózgu. |
sól kuchenna, ryby solone |
PIERWIASTEK |
ROLA |
WYSTĘPOWANIE |
POTAS (K) |
główny kation płynu wewnątrzkomórkowego, występuje w sokach trawiennych i kościach, składnik Na+/K+ ATP-azy, reguluje gospodarkę wodną (objętość komórek, ciśnienie osmotyczne wewnątrzkomórkowe), wpływa na równowagę kwasowo-zasadową, reguluje czynności mięśni i nerwów (potencjał błon komórkowych), zwiększa przepuszczalność błon komórkowych (antagonista Ca) |
Rośliny strączkowe, |
CHLOR (Cl) |
główny anion płynów pozakomórkowych, występuje w soku żołądkowym i ślinie (aktywuje amylazę), uczestniczy w regulacji gospodarki wodnej i równowagi kwasowo-zasadowej |
sól kuchenna, wędliny, |
SIARKA (S) |
składnik bułek, mukopolisacharydów i sulfolipidów (włosy, skóra, paznokcie, chrząstki), składnik ważnych biologicznie związków: koenzymu A, tiaminy, biotyny, kwasu liponowego, hormonów przedniego płata przysadki, insuliny, glutationu, bierze udział w detoksykacji |
sery podpuszczkowe |
MIKROELEMENTY |
||
ŻELAZO (Fe) |
składnik hemoglobiny, mioglobiny i wielu enzymów, niezbędny do transportu i magazynowania tlenu, transportu elektronów (cytochromy), desaturacji kwasów tłuszczowych, rozkładu nadtlenku wodoru (katalaza), jodowania tyrozyny (peroksydaza tarczycowa), biosyntezy prostaglandyn, katabolizmu tryptofanu, detoksykacji związków obcych (cytochrom P-450) |
Wątroba, rośliny |
CYNK (Zn) |
niezbędny dla ponad 200 enzymów, m.in. polimeraz DNA i RNA, dysmutazy ponadtlenkowej, anhydrazy węglanowej, niezbędny do syntezy białka i kwasów nukleinowych, ochrony przed wolnymi rodnikami, stabilności błon komórkowych, odporności humoralnej i komórkowej, syntezy białka wiążącego wit A, produkcji i/lub sekrecji hormonów (testosteron, insulina, tyroksyna), odczuwania smaku i zapachu, metabolizmu alkoholu |
Mięso, |
PIERWIASTEK |
ROLA |
WYSTĘPOWANIE |
MIEDŹ (Cu) |
składnik wielu enzymów, niezbędna do transportu Fe (ceruloplazmina), dekompozycji wolnych rodników (dysmutaza ponadtlenkowa), syntezy noradrenaliny (hydrolaza dopaminy), tworzenia wiązań krzyżowych w kolagenie i elastynie (oksydaza lizylowa), syntezy melaminy (tyrozynaza), utrzymania struktury keratyny (oksydaza tiolowa) |
Orzechy, |
MANGAN (Mn) |
składnik metaloenzymów, niezbędny do przemiany pirogronianu w szczawiooctan (karboksylaza pirogronianowa), dekompozycji wolnych rodników (dysmutaza ponadtlenkowa), syntezy mocznika (arginaza), aktywator wielu enzymów m in glikozylotransferazy, syntetazy glutamimanowej, ważny dla tworzenia tkanki łącznej i kości, funkcji mózgu i trzustki |
Orzechy, produkty |
FLUOR (F) |
składnik kości i zębowy przeciwdziała próchnicy, zwiększa gęstość kości |
Ryby, soja, wątroba |
MOLIBDEN (Md) |
składnik enzymów, niezbędny do utleniania aldehydów (oksydaza aldehydowa), metabolizmu puryn i pirymidyn (oksydaza ksantynowa), detoksykacji siarczynów (oksydaza siarczynowa). |
Rośliny strączkowe, wątroba, |
JOD (I) |
wchodzi w skład hormonów tarczycy, zapobiega powstawaniu wola endemicznego |
Sól kuchenna jodowana, ryby |
SELEN (Se) |
składnik peroksydazy glutationowej (rozkład nadtlenku wodoru i nadtlenków lipidowych), niezbędny do przemiany hormonów tarczycy (dejodynaza), chroni przed stresem oksydacyjnym |
Nerki, ryby, kukurydza, |
CHROM (Cr) |
składnik czynnika tolerancji glukozy, obniża stężenie cholesterolu w surowicy |
drożdże piwne, wątroba wołowa, |
KOBALT (Co) |
wchodzi w skład witaminy B12 (4%), w formie nieorganicznej działa korzystnie na erytropoezę. |
fasola, cebula, smalec, wątroba, |
Woda i płyny ustrojowe
Woda stanowi około 70% masy komórek a większość wewnątrzkomórkowych reakcji przebiega w środowisku wodnym. Tylko woda może swobodnie przechodzić przez błonę komórkową (barierę oddzielającą wnętrze komórki od środowiska zewnętrznego). W wodzie rozpuszczonych jest szereg substancji organicznych i nieorganicznych. Taki płyn składający się z wody i substancji w niej rozpuszczonych nazywamy płynem ustrojowym. W zależności od lokalizacji tego płynu możemy wyróżnić:
Płyn wypełniający wnętrze komórki - płyn śródkomórkowy stanowi aż 2/3 wody organizmu
Płyn wypełniający przestrzenie pozakomórkowe ale nie naczynia krwionośne - płyn śródmiąższowy (= pozakomórkowy pozanaczyniowy)
Płyn wypełniający łożysko naczyniowe - osocze
Skład elektrolitowy płynu śródkomórkowego różni się istotnie od składu płynu pozakomórkowego. Głównym kationem płynu śródkomórkowego jest potas a anionami fosforany i białczany natomiast w płynie zewnątrzkomórkowym (śródmiąższowy i osocze) dominują sód (kation) oraz chlor i wodorowęglany (aniony). Niezależnie od tego z jakim płynem ustrojowym mamy do czynienia stosuje się on do prawa elektroobojętności czyli suma kationów zawsze równa się sumie anionów.
Cząsteczki chemiczne w komórkach
Poza wodą prawie wszystkie cząsteczki w komórkach są związkami węgla. Cechą wyróżniającą węgiel od innych pierwiastków jest jego zdolność do tworzenia cząsteczek . Cząsteczki węgla łączą się ze sobą silnym wiązaniem kowalencyjnym tworząc łańcuchy lub pierścienie. Takie związki węgla nazywamy organicznymi.
Małe cząsteczki organiczne występujące w komórce są związkami węgla o masie cząsteczkowej i zawierają do 30 atomów węgla. Zwykle występują jako wolne cząsteczki w roztworze cytoplazmy. Część z nich jest wykorzystywana do budowy większych cząsteczek (makrocząsteczek) czyli białek, kwasów nukleinowych lub polisacharydów. Pozostałe służą jako źródło energii ulegając przekształceniu w mniejsze cząsteczki w wewnątrzkomórkowych szlakach metabolicznych.
Ogólnie komórki zawierają cztery główne rodziny małocząsteczkowych związków organicznych:
Cukry
Kwasy tłuszczowe
Aminokwasy
Nukleotydy
Cukry
Cukry i cząsteczki z nich utworzone często nazywa się węglowodanami. Węglowodany są aldehydami lub ketonami zawierającymi wiele grup hydroksylowych. Funkcje węglowodanów:
stanowią materiał zapasowy
są paliwem energetycznym dla komórki
są intermadiatami w szlakach metabolicznych
tworzą szkielet dla kwasów nukleinowych (ryboza i deoksyryboza)
są elementami strukturalnymi ścian komórkowych bakterii i roślin
odgrywają rolę w procesach rozpoznawania międzykomórkowego (wiązanie plemnika z komórka jajową, adhezja leukocytów do powierzchni zaktywowanego śródbłonka naczyń)
a. glukoza - główne źródło energii
Wszystkie tkanki wymagają pewnej minimalnej podaży glukozy a dla niektórych tkanek jest to wymóg zasadniczy (komórki mózgu, erytrocyty). Glikoliza jest głównym szlakiem katabolizmu glukozy i przebiega we wszystkich komórkach. Szlak ten może przebiegać zarówno w warunkach tlenowych jak i beztlenowych (anaerobowych). Glikoliza służy do wytwarzania acetylo-CoA, ATP (głównego nośnika energii) oraz stanowi główny szlak metabolizmu fruktozy i galaktozy pochodzenia pokarmowego. W zależności od rodzaju tkanki komórki mogą lepiej lub gorzej wykorzystywać glukozę w procesie glikolizy np. komórki mięśni szkieletowych wykazującą wysoka aktywność glikolityczną co pozwala komórka na przetrwanie w warunkach niedostatecznej podaży tlenu. Z kolei komórki mięśnia sercowego cechują się słaba aktywnością glikolityczną i zarazem słabą zdolnością do przetrwania w warunkach niedotlenienia. Upośledzenie szlaku glikolizy może prowadzić do szeregu chorób min. niedokrwistości hemolitycznej wynikającej z braku lub nieprawidłowego działania jednego z enzymów biorącego udział w procesie glikolizy
b. glikogen - materiał zapasowy komórek zwierzęcych
Jest główna formą zmagazynowania węglowodanów u zwierząt i jest odpowiednikiem skrobi u roślin. Występuje głównie w wątrobie (do 6%) oraz w mięśniach (do 1%). Glikogen jest rozgałęzionym polimerem glukozy. Glikogen komórek mięśni jest łatwo dostępnym źródłem heksoz wykorzystywanych w glikolizie w trakcie pracy mięśnia. Glikogen zmagazynowany w komórkach wątroby głównie służy jako magazyn i dostawca heksoz w celu utrzymania fizjologicznego stężenia glukozy we krwi zwłaszcza między posiłkami.
c. pentozy - dostawcy rybozy do syntezy kwasów nukleinowych
Szlak pentozofosforanowy nie generuje ATP ale służy do wytwarzania NADPH (wykorzystywany min w biosyntezie kwasów tłuszczowych i steroidów) oraz dostarcza rybozy do biosyntezy kwasów nukleinowych.
Kwasy tłuszczowe
Służą komórce jako skondensowane zapasy pokarmowe: ich rozpad dostarcza komórce około 6 razy więcej energii niż taka samo wagowo ilość glukozy. W cytoplazmie wielu komórek są one przechowywane w formie triacylogliceroli których cząsteczka składa się z trzech kwasów tłuszczowych związanych z cząsteczką glicerolu. Gdy komórka potrzebuje energii uwalnia kwasy tłuszczowe z triacylogliceroli i rozkłada na jednostki dwuwęglowe. Są one identyczne z jednostkami pochodzącymi z rozkładu glukozy i wchodzą w takie same szlaki metaboliczne uwalniające energię.
Najważniejszą funkcja kwasów tłuszczowych jest ich udział w budowie błon komórkowych. Błony zbudowane są głównie z fosfolipidów (glicerol połączony z dwoma łańcuchami kwasów tłuszczowych, trzecie miejsce w glicerolu połączone jest z resztą fosforanową do której przyłączony jest mały związek hydrofilowy np. cholina. Każda cząsteczka fosfolipidy zawiera hydrofobowy ogon oraz hydrofilową głowę. Jest to tzw. amfipatyczny charakter fosfolipidów.
Nukleotydy - jednostki budujące DNA i RNA
Nukleozydem jest cząsteczka zbudowana z zasady azotowej połączonej z pięciowęglowym cukrem którym może być ryboza lub deoksyryboza.
Nukleozyd z przyłączonym do jego cukru grupą fosforanową nazywany jest nukleotydem. Nukleotydy w skład których wchodzi ryboza nazywane są rybonukleotydami a zawierające deoksyrybozę - deoksyrybonukleotydami.
Nukleotydy w zależności od zasad w nich zawartych możemy podzielić na puryny (adenina i guanina) oraz pirymidyny (cytozyna tymina oraz uracyl).
Nukleotydy mogą funkcjonować jako krótkotrwałe nośniki energii chemicznej np. ATP (trifosforan adenozyny).
Najbardziej podstawową funkcją nukleotydów w komórkach jest magazynowanie i przekazywanie informacji biologicznej. Nukleotydy służą bowiem jako elementy do konstruowania kwasów nukleinowych DNA i RNA. W skład RNA wchodzą adenina, guanina, cytozyna i uracyl; w skład DNA adenina, guanina, cytozyna tymina.
Aminokwasy jako składniki białek
Są klasą różnorodnych cząsteczek ale mają cechę wspólną wszystkie zawierają grupę karboksylową oraz grupę aminową. Chemiczna różnorodność wynika z łańcuchów bocznych.
Aminokwasy odgrywają istotna rolę w komórce gdyż służą do wytwarzania białek. Białka są długimi łańcuchowymi polimerami aminokwasów pofałdowanymi w strukturę przestrzenną, unikatową dla każdego typu białka. Powszechnie w białkach występuje 20 różnych aminokwasów Poza budulcem dla białek istnieje znamienna liczba aminokwasów które nie występują w białkach ale spełniają istotną rolę w metabolizmie ssaków:
Homocysteina - związek pośredni w metabolizmie metioniny. Nadmiar jej w komórce działa degradujaco
3-monojodotyrozyna - prekursor dla hormonów tarczycy
Dopa (3,4-dihydroksyfenyloalanina) - prekursor w syntezie melaniny
Funkcje białek:
Kataliza enzymatyczna
Transport i magazynowanie (hemoglobina, mioglobina, transferyna, ferrytyna)
Ruch (mięśnie, chromosomy, plemniki)
Funkcje mechaniczno-strukturalne
Ochrona immunologiczna
Wytwarzanie i przekazywanie impulsów nerwowych
Kontrola wzrostu i różnicowania