Genetyka regulacja funkcji genow

background image

Regulacja funkcji genów pod wpływem

Regulacja funkcji genów pod wpływem

temperatury. Regulacja ekspresji genów

temperatury. Regulacja ekspresji genów

przez hormony steroidowe

przez hormony steroidowe

background image

Komórki eukariotyczne odowiadają na

Komórki eukariotyczne odowiadają na

nieznaczne podwyższenie temperatury

nieznaczne podwyższenie temperatury

(10% ponad wartość fizjologiczną),

(10% ponad wartość fizjologiczną),

wzmożoną syntezą grupy polipeptydów

wzmożoną syntezą grupy polipeptydów

zwanych

zwanych

BIAŁKAMI SZOKU

BIAŁKAMI SZOKU

TERMICZNEGO HSP (

TERMICZNEGO HSP (

heat shock proteins).

heat shock proteins).

Do syntezy HSP dochodzi w wyniku

Do syntezy HSP dochodzi w wyniku

działania czynników stresowych tj:

działania czynników stresowych tj:

-infekcje wirusowe,

-infekcje wirusowe,

-czynniki uszkadzające DNA,

-czynniki uszkadzające DNA,

-analogi aminokwasów,

-analogi aminokwasów,

-zmiana pH środowiska

-zmiana pH środowiska

-obecność etanolu.

-obecność etanolu.

background image
background image

Odpowiedź szoku termicznego jest

Odpowiedź szoku termicznego jest

charakterystyczna dla wszystkich

charakterystyczna dla wszystkich

organizmów, a wzrost stężenia HSP

organizmów, a wzrost stężenia HSP

zachodzi w wyniku podwyższenia

zachodzi w wyniku podwyższenia

transkrypcji genów szoku termicznego.

transkrypcji genów szoku termicznego.

Niektóre z genów szoku termicznego

Niektóre z genów szoku termicznego

mogą być aktywowane podczas

mogą być aktywowane podczas

normalnego wzrostu i rozwoju organizmu.

normalnego wzrostu i rozwoju organizmu.

HSP charakteryzują się:

HSP charakteryzują się:

- wysokim stopniem homologii zarówno na

- wysokim stopniem homologii zarówno na

poziomie sekwencji aminokwasowej jak i

poziomie sekwencji aminokwasowej jak i

struktury.

struktury.

Wiele z tych protein np.: GroEl, Gro Es,

Wiele z tych protein np.: GroEl, Gro Es,

DnaK, DnaJ, GrpE, ClpX, to białka klasy

DnaK, DnaJ, GrpE, ClpX, to białka klasy

białek opiekuńczych. Inne, liczne białka

białek opiekuńczych. Inne, liczne białka

szoku termicznego to proteazy lub białka

szoku termicznego to proteazy lub białka

z nimi współpracujące, np..: Lon, ClpP,

z nimi współpracujące, np..: Lon, ClpP,

ClpA, ClpX, hlfX.

ClpA, ClpX, hlfX.

background image

W komórkach eukariotycznych

W komórkach eukariotycznych

odpowiedź na szok termiczny

odpowiedź na szok termiczny

regulowana jest na etapie inicjacji

regulowana jest na etapie inicjacji

transkrypcji przez uaktywnienie

transkrypcji przez uaktywnienie

specjalnego czynnika transkrypcyjnego,

specjalnego czynnika transkrypcyjnego,

zwanego czynnikiem szoku cieplnego,

zwanego czynnikiem szoku cieplnego,

HSF ( Heat Shock Factor). W komórkach

HSF ( Heat Shock Factor). W komórkach

drożdży czynnik ten związany jest z

drożdży czynnik ten związany jest z

DNA, a jego aktywacja jest wynikiem

DNA, a jego aktywacja jest wynikiem

fosforylacji. W komórkach wyższych

fosforylacji. W komórkach wyższych

organizmów eukariotycznych aktywacja

organizmów eukariotycznych aktywacja

transkrypcji następuje w wyniku

transkrypcji następuje w wyniku

wiązania HSF d sekwencji DNA, zwanej

wiązania HSF d sekwencji DNA, zwanej

HSE zlokalizowanej w odległości ok. 80-

HSE zlokalizowanej w odległości ok. 80-

200 par zasad od miejsca początku

200 par zasad od miejsca początku

transkrypcji mRNA. Sekwencje HSE

transkrypcji mRNA. Sekwencje HSE

wiążą HSF- patrz ryc. 5.23 i 5.24

wiążą HSF- patrz ryc. 5.23 i 5.24

background image
background image

W komórkach drożdży i muszki owocowej

W komórkach drożdży i muszki owocowej

zidentyfikowano tylko jeden czynnik szoku

zidentyfikowano tylko jeden czynnik szoku

termicznego (HSF). W komórkach organizmów

termicznego (HSF). W komórkach organizmów

eukariotycznych zidentyfikowano ich przynajmniej

eukariotycznych zidentyfikowano ich przynajmniej

dwa (mysz, człowiek –HSF1, HSF2) lub trzy (pomidor,

dwa (mysz, człowiek –HSF1, HSF2) lub trzy (pomidor,

kura- HSF1, HSF2, HSF3).

kura- HSF1, HSF2, HSF3).

Czynniki szoku termicznego różnią się funkcjonalnie:

Czynniki szoku termicznego różnią się funkcjonalnie:

- czynnik HSF1- odpowiada za indukcję odpowiedzi

- czynnik HSF1- odpowiada za indukcję odpowiedzi

szoku termicznego w wyniku podwyższenia

szoku termicznego w wyniku podwyższenia

temperatury lub innych czynników stresowych,

temperatury lub innych czynników stresowych,

- czynnik HSF2- do jego aktywacji dochodzi podczas

- czynnik HSF2- do jego aktywacji dochodzi podczas

specyficznych etapów rozwoju i różnicowania

specyficznych etapów rozwoju i różnicowania

komórek.

komórek.

W warunkach fizjologicznych HSF1 występuje w

W warunkach fizjologicznych HSF1 występuje w

cytoplazmie i jądrze komórkowym jako monomer.

cytoplazmie i jądrze komórkowym jako monomer.

Natomiast warunki stresowe doprowadzają do

Natomiast warunki stresowe doprowadzają do

oligomeryzacji cytoplazmatycznego HSF1, tworząc

oligomeryzacji cytoplazmatycznego HSF1, tworząc

trimer (HSF1)3 i fosforylacji oraz transportu tego

trimer (HSF1)3 i fosforylacji oraz transportu tego

trimeru do jądra komórkowego.Trimeryczna forma

trimeru do jądra komórkowego.Trimeryczna forma

HSF1 jest formą aktywną, która przez wiązanie do

HSF1 jest formą aktywną, która przez wiązanie do

sekwencji HSE aktywuje transkrypcję genów szoku

sekwencji HSE aktywuje transkrypcję genów szoku

termicznego.

termicznego.

background image

Wszystkie znane czynniki szoku termicznego, pomimo

Wszystkie znane czynniki szoku termicznego, pomimo

znacznych różnic w wielkości i tylko ok..40% homologii,

znacznych różnic w wielkości i tylko ok..40% homologii,

posaidają dwie charakterystyczne domeny. Pierwsza,

posaidają dwie charakterystyczne domeny. Pierwsza,

obejmująca ok.. 100 N-końcowych aminokwasów, jest

obejmująca ok.. 100 N-końcowych aminokwasów, jest

homologiczna z bakteryjnymi czynnikami i odpowiada za

homologiczna z bakteryjnymi czynnikami i odpowiada za

wiązanie do DNA. Druga, leżąca centralnie w białku HSF,

wiązanie do DNA. Druga, leżąca centralnie w białku HSF,

zawiera hydrofobowe aminokwasy tworzące strukturę

zawiera hydrofobowe aminokwasy tworzące strukturę

suwaka leucynowego i odpowiada za tworzenie aktywnych

suwaka leucynowego i odpowiada za tworzenie aktywnych

trimerów białka HSF.

trimerów białka HSF.

Aktywacja genów szoku termicznego jest jedną ze zmian

Aktywacja genów szoku termicznego jest jedną ze zmian

zachodzących w komórce w odpowiedzi na stres.

zachodzących w komórce w odpowiedzi na stres.

Modyfikacje dotyczą również jej aktywności metabolicznej i

Modyfikacje dotyczą również jej aktywności metabolicznej i

czasu półtrwania organelli komórkowych. Aktywność

czasu półtrwania organelli komórkowych. Aktywność

metaboliczna jądra komórkowego należy do najbardziej

metaboliczna jądra komórkowego należy do najbardziej

wrażliwych na stres. Proces syntezy DNA ulega

wrażliwych na stres. Proces syntezy DNA ulega

spowolnieniu, kumulują się prekursory rRNA i zahamowane

spowolnieniu, kumulują się prekursory rRNA i zahamowane

zostaje usuwanie intronów z hnRNA. Histony ulegają

zostaje usuwanie intronów z hnRNA. Histony ulegają

modyfikacji przez fosforylację. Po krótkim lecz silnym szoku

modyfikacji przez fosforylację. Po krótkim lecz silnym szoku

termicznym następuje natychmiastowa dysocjacja

termicznym następuje natychmiastowa dysocjacja

polisomów. W komórce zmienia się przebieg procesów

polisomów. W komórce zmienia się przebieg procesów

glikolizy i kumuluje się kwas mlekowy.

glikolizy i kumuluje się kwas mlekowy.

background image

Znaczącą rolę w regulacji ekspresji genów

Znaczącą rolę w regulacji ekspresji genów

odgrywają hormony steroidowe, które wpływają na

odgrywają hormony steroidowe, które wpływają na

wzrost i różnicowanie się komórek wyższych

wzrost i różnicowanie się komórek wyższych

Eukaryota.

Eukaryota.

Sygnał hormonalny (ligand) przekazywany jest do

Sygnał hormonalny (ligand) przekazywany jest do

genu docelowego przez receptory

genu docelowego przez receptory

wewnątrzkomórkowe. Wiązanie liganda do

wewnątrzkomórkowe. Wiązanie liganda do

odpowiedniego receptora uruchamia interakcje tak

odpowiedniego receptora uruchamia interakcje tak

powstałego kompleksu z charakterystyczną

powstałego kompleksu z charakterystyczną

regulatorową sekwencją DNA w genie docelowym,

regulatorową sekwencją DNA w genie docelowym,

zwaną elementem odpowiedzi hormonalnej.

zwaną elementem odpowiedzi hormonalnej.

Receptor związany z ligandem ułatwia tworzenie

Receptor związany z ligandem ułatwia tworzenie

się kompleksu z innymi czynnikami

się kompleksu z innymi czynnikami

transkrypcyjnymi i stymuluje transkrypcję

transkrypcyjnymi i stymuluje transkrypcję

.

.

Nadrodzina receptorów hormonów steroidowych

Nadrodzina receptorów hormonów steroidowych

należy do grupy receptorów jądrowych. Grupa ta

należy do grupy receptorów jądrowych. Grupa ta

zawiera receptory dla estradiolu, progesteronu,

zawiera receptory dla estradiolu, progesteronu,

androgenów, glikokortykoidów,

androgenów, glikokortykoidów,

mineralokortykoidów, hormonu tarczycy, witaminy

mineralokortykoidów, hormonu tarczycy, witaminy

(D3), kwasu retinowego, a także niektórych

(D3), kwasu retinowego, a także niektórych

ankogenów.

ankogenów.

background image

Wszystkie one posiadają identyczną strukturę ogólną, na

Wszystkie one posiadają identyczną strukturę ogólną, na

którą składają się:

którą składają się:

-         koniec NH2- terminalny o różnej długości, nie

-         koniec NH2- terminalny o różnej długości, nie

konserwatywny specyficzny dla receptora. Rola

konserwatywny specyficzny dla receptora. Rola

funkcjonalna tej domeny nie jest znana,

funkcjonalna tej domeny nie jest znana,

region składający się z ok. 65 aminokwasów, bardzo

region składający się z ok. 65 aminokwasów, bardzo

konserwatywny. Ta domena genu oddziałuje z DNA.

konserwatywny. Ta domena genu oddziałuje z DNA.

Odnajdujemy w niej dwa motywy „palców cynkowych” ,

Odnajdujemy w niej dwa motywy „palców cynkowych” ,

lepiej zachowany pozostaje pierwszy z nich, gdzie jon

lepiej zachowany pozostaje pierwszy z nich, gdzie jon

cynku związany jest przez 4 cysteiny łańcucha bocznego.

cynku związany jest przez 4 cysteiny łańcucha bocznego.

Każde z ugrupowań cynkowych kodowane jest przez

Każde z ugrupowań cynkowych kodowane jest przez

oddzielny ekson genu receptora;

oddzielny ekson genu receptora;

-         region nie konserwatywny o zmiennej długości

-         region nie konserwatywny o zmiennej długości

-         receptor kończy się domeną o zmiennej długości,

-         receptor kończy się domeną o zmiennej długości,

do której wiąże się hormon.

do której wiąże się hormon.

Mimo że hormony mogą posiadać skrajnie różną

Mimo że hormony mogą posiadać skrajnie różną

strukturę, homologia tego regionu mieści się w granicach

strukturę, homologia tego regionu mieści się w granicach

15 – 75%.

15 – 75%.

Ze względu na strukturę i funkcję receptory hormonów

Ze względu na strukturę i funkcję receptory hormonów

steroidowych można podzielić na dwie grupy:

steroidowych można podzielić na dwie grupy:

      

      

background image

-

-

jedną zawierającą receptory glikokortykoidów

jedną zawierającą receptory glikokortykoidów

(GR), progesteronu (PR), androgenów (AR),

(GR), progesteronu (PR), androgenów (AR),

mineralokortykoidów (MR),

mineralokortykoidów (MR),

-         drugą zawierającą receptory estrogenów

-         drugą zawierającą receptory estrogenów

(ER), hormony tarczycy (TR), kwasu retinowego

(ER), hormony tarczycy (TR), kwasu retinowego

(RAR), witaminyD3 (D3R).

(RAR), witaminyD3 (D3R).

W pierwszej grupie między dwoma cysteinami w

W pierwszej grupie między dwoma cysteinami w

C końcowej części pierwszego ugrupowania

C końcowej części pierwszego ugrupowania

cynkowego występuje zawsze sekwencja Gly-

cynkowego występuje zawsze sekwencja Gly-

Ser, natomiast w drugiej Glu-Gly.

Ser, natomiast w drugiej Glu-Gly.

background image
background image
background image

Element odpowiedzi hormonalnej (HRE).

Element odpowiedzi hormonalnej (HRE).

Zaktywowane receptory hormonów steroidowych wiążą się ze

Zaktywowane receptory hormonów steroidowych wiążą się ze

specyficznymi sekwencjami DNA, tzw. Elementami odpowiedzi

specyficznymi sekwencjami DNA, tzw. Elementami odpowiedzi

hormonalnej (HRE).

hormonalnej (HRE).

Elementy odpowiedzi na hormon regulują ekspresję

Elementy odpowiedzi na hormon regulują ekspresję

sąsiadujących genów oraz inne miejsca kontroli transkrypcji.

sąsiadujących genów oraz inne miejsca kontroli transkrypcji.

Badania nad HRE pozwoliły na odkrycie palindromowych

Badania nad HRE pozwoliły na odkrycie palindromowych

sekwencji 15 par zasad, mogących znajdować się w odległości

sekwencji 15 par zasad, mogących znajdować się w odległości

od 100 do kilku tysięcy par zasad od miejsca startu

od 100 do kilku tysięcy par zasad od miejsca startu

transkrypcji (kodon AUG).

transkrypcji (kodon AUG).

HRE dzieli się na 4 klasy:

HRE dzieli się na 4 klasy:

-         GRE – element odpowiedzi glikokortykoidów, wiąże się

-         GRE – element odpowiedzi glikokortykoidów, wiąże się

on też receptory AR, PR, MR.

on też receptory AR, PR, MR.

-         ERE – element odpowiedzi estradiolu,

-         ERE – element odpowiedzi estradiolu,

-         TRE – element odpowiedzi hormonu tarczycy, do którego

-         TRE – element odpowiedzi hormonu tarczycy, do którego

przyłącza się również receptor RAR,

przyłącza się również receptor RAR,

-         DRE – ostatnią grupę stanowi sekwencja, która wiąże

-         DRE – ostatnią grupę stanowi sekwencja, która wiąże

„ receptory sieroce”.

„ receptory sieroce”.

Receptory steroidowe występują w kompleksach o masie 8-10

Receptory steroidowe występują w kompleksach o masie 8-10

S, związane z kilkoma niereceptorowymi białkami szoku

S, związane z kilkoma niereceptorowymi białkami szoku

cieplnego, jak Hsp 90, Hsp 70, Hsp 56 i Hsp90-59.

cieplnego, jak Hsp 90, Hsp 70, Hsp 56 i Hsp90-59.

W tych wysokocząsteczkowych kompleksach receptor jest

W tych wysokocząsteczkowych kompleksach receptor jest

funkcjonalnie nieaktywny.

funkcjonalnie nieaktywny.

background image

Ligandy decydują o aktywacji genów regulowanych

Ligandy decydują o aktywacji genów regulowanych

przez receptory hormonów

przez receptory hormonów

steroidowych. Hormon

steroidowych. Hormon

indukuje niewielkie zmiany w kinetyce wiązania i

indukuje niewielkie zmiany w kinetyce wiązania i

powinowactwie receptora do HRE. Wiązania liganda

powinowactwie receptora do HRE. Wiązania liganda

wywołuje zmianę allosteryczną receptora, w skutek

wywołuje zmianę allosteryczną receptora, w skutek

czego umożliwia dostęp innym czynnikom

czego umożliwia dostęp innym czynnikom

transkrypcyjnym lub polimerze RNA do rejonu

transkrypcyjnym lub polimerze RNA do rejonu

aktywacji transkrypcji w receptorze.

aktywacji transkrypcji w receptorze.

To oddziaływanie białko-białko może dać sygnał do

To oddziaływanie białko-białko może dać sygnał do

rozpoczęcia transkrypcji.

rozpoczęcia transkrypcji.

Podczas nieobecności liganda większość receptorów

Podczas nieobecności liganda większość receptorów

ER, PR, AR zlokalizowanych jest w cytoplaźmie, a

ER, PR, AR zlokalizowanych jest w cytoplaźmie, a

kompleks receptor – hormon migruje do jądra

kompleks receptor – hormon migruje do jądra

komórkowego, aby modulować ekspresję genów.

komórkowego, aby modulować ekspresję genów.

Pewna ilość receptorów występuje też w jądrze, od

Pewna ilość receptorów występuje też w jądrze, od

obecności hormonu. Receptory GR, MR, TR, RAR

obecności hormonu. Receptory GR, MR, TR, RAR

występują w jądrze niezależnie od obecności

występują w jądrze niezależnie od obecności

hormonu. Receptory GR, MR, TR, RAR, występują w

hormonu. Receptory GR, MR, TR, RAR, występują w

jądrze niezależnie od obecności liganda

jądrze niezależnie od obecności liganda

.

.

background image

Receptory jądrowe hormonów steroidowych są typowym

Receptory jądrowe hormonów steroidowych są typowym

przykładem białek transregulatorowych transkrypcji.

przykładem białek transregulatorowych transkrypcji.

Umożliwiają one inetrakcje z innymi białkami, a

Umożliwiają one inetrakcje z innymi białkami, a

zwłaszcza z uniwersalnymi czynnikami transkrypcyjnymi i

zwłaszcza z uniwersalnymi czynnikami transkrypcyjnymi i

działają stabilizująco na czynniki wiążące w pobliżu

działają stabilizująco na czynniki wiążące w pobliżu

promotora. Ten sposób interakcji cząsteczek

promotora. Ten sposób interakcji cząsteczek

steroidowych receptorów jądrowych nazywa się

steroidowych receptorów jądrowych nazywa się

transkrypcją.

transkrypcją.

Białko G jest heterotrimerem ulokowanym w błonach

Białko G jest heterotrimerem ulokowanym w błonach

komórkowych, który tłumaczy i wzmacnia sygnały

komórkowych, który tłumaczy i wzmacnia sygnały

przekazywane do wnętrza komórki powodując zmiany

przekazywane do wnętrza komórki powodując zmiany

aktywności enzymów komórkowych. Białko G posiada

aktywności enzymów komórkowych. Białko G posiada

strukturę IV rzędową i zbudowane jest z trech różnych

strukturę IV rzędową i zbudowane jest z trech różnych

podjednostek ά, β i γ.

podjednostek ά, β i γ.

Heterotrimery wiążą i hydrolizują

Heterotrimery wiążą i hydrolizują

GTP. Ta katalityczna aktywność kontroluję dezaktywację

GTP. Ta katalityczna aktywność kontroluję dezaktywację

białka.

białka.

Białka G stają się aktywne podczas interakcji, ze

Białka G stają się aktywne podczas interakcji, ze

specyficznym kompleksem receptor – hormon, w

specyficznym kompleksem receptor – hormon, w

obecności Mg

obecności Mg

+2

+2

i GTP. Białka te jako heterotrimery

i GTP. Białka te jako heterotrimery

wiążące GTP wzbudzają sygnał translacji.

wiążące GTP wzbudzają sygnał translacji.

W momencie aktywacji białko G, jego podjednostki

W momencie aktywacji białko G, jego podjednostki

dysocjują, a podjednostka α aktywuję cyklazę adenylową i

dysocjują, a podjednostka α aktywuję cyklazę adenylową i

sama ulega inaktywacji hydrolizując GTP. Bodziec

sama ulega inaktywacji hydrolizując GTP. Bodziec

pierwotny pośrednio wywołuje syntezę cAMP biorącego

pierwotny pośrednio wywołuje syntezę cAMP biorącego

udział w wielu szlakach metabolicznych.

udział w wielu szlakach metabolicznych.

background image

Dziękujemy za uwagę

Dziękujemy za uwagę


Document Outline


Wyszukiwarka

Podobne podstrony:
2 Regulacja funkcji genów Zmienność i mutacje
10 WYK X Regulacja funkcji genów u bakterii1id 10654 ppt
10 WYK X Regulacja funkcji genów u?kterii1
Regulacja funkcji genów pod wpływem temperatury
2 Regulacja funkcji genów Zmienność i mutacje
Regulacja funkcji genów pod wplywem temperatury
Regulacja funkcji genów pod wplywem temperatury 1
2 Regulacja funkcji genów Zmienność i mutacje
Genetyczna regulacja embriogene Nieznany
Algorytmy genetyczne w minimalizacji funkcji logicznych 5 część 2
regulacja funkcji genu
Regulacja ekspresji genow poprawione
Regulacja ekspresji genów u eucaryota
3. Przyklady regulacji ekspresji genow u Eukaryota-ok, Biologia II, Biologia molekularna
Regulacja ekspresji genów, fizjoterapia, biologia medyczna
12 Regulacja ekspresji genow
1 Regulacja ekspresji genów u prokariota
Algorytmy genetyczne w minimalizacji funkcji logicznych 5 część 1

więcej podobnych podstron