Zestaw 16
1 metabolizm pirogronianu
2 mioglobina- struktura, funkcje
3 rola hormonów steroidowych w kontroli transkrypcji
Ad 1
Pirogronian może powstawać :
- w wyniku przemiany aminokwasów - transaminacja ( treonina, glicyna, seryna, cysteina, alanina, tryptofan)
-z glikolizy z fosfoenolopirogronianu w wyniku fosforylacji substratowej
-z mleczanu w wyniku dehydrogenazy mleczanowej
-z jabułczanu
Z pirogronianu powstają :
-jabułaczan w wyniku redukcyjnej karboksylacji (enzym jabułczanowy w cytoplazmie)
-aceltylo-CoA w wyniku oksydacyjnej dekarboksylacji CYKL KREBSA
-szczawiooctan w w yniku karboksylacji przez karboksylazę pirogronianową GLUKONEOGENEZA
-mleczan (reakcja odwrotna do podanej bo działa w obie strony)
-animokwasy np. alanina (reakcja odwrotna)
Ad2
Mioglobina to białko globularne ( bo cząsteczka jest upakowana przy czym większość reszt hydrofobowych jest zanużona w jej wnętrzu, a polarne znajdują się na powierzchni) utworzone przez pojedynczy łańcuch polipeptydowy założony ze 153 aa i fałdujący się w osiem alfa helis (A-H).
W obrębie hydrofobowego zagłębienia utworzonego przez łańcuch polipeptydowy znajduje się prostetyczna grupa hemowa jest ona połaczona z mioglobina niekowalencyjnie i wiąże tlen.
Mioglobina ma większe powinowadztwo do tlenu niż hemoglobina ilustrują to krzywe dysocjacji tlenu dla tych białek (krótkie wykłady 48)
Głównym zadaniem mioglobiny jest wiązanie tlenu w mięśniach
AD 3
(Harper rodz 45 )
Litofilne cząsteczki przenikają przez błony wszystkich komórek wiążą się natomiast tylko ze swoistym receptorem wysokiego powinowadztwa w komórkach docelowych .Kompleks złożony z receptora i hormonu ulega następnie aktywacji- znienia się jego wielkość konformacja i ładunek i staje się zdolny do wiązania z chromatyną w miejscu określanym jako „sekwencja odpowiedzi hormonalnej” aktywując bądź inaktywując określone geny.
Przeważaja dowody ze hormony steroidowe wpływaja głownie na transkrypcję choć mogą podobnie jak inne hormony oddziaływac na dowolny etap.
Wymagania strukturalne niezbędne do regulacji transkrypcji przez hormon steroidowy lub tarczycy to to ze geny musza się znajdowac w obszarach „otwartej” transkrypcyjnie otwartej chromatyny ( wystająca bańka podatna na działanie trawiącej DNA-azy)
Dotychczas przebadane geny wykazuja przynajmniej dwa odcinki regulatorowe :
-element promotorowy- ma charakter nieswoisty występują we wszystkich genach w róznych postaciach - określa miejsce wiązania polimerazy RNA 2 do DNA i tym samym dokładność inicjacji transkrypcji
-sekwencja odpowiedzi hormonalnej HRE- dalej od końca 5 prim niż odcinek promotorowy
I może się składać z kilku oddzielnych fragmentów- moduluje częstość inicjacji transkrypcji (podobna pod tym względem do fragmentów wzmacniających transkrypcje )
Dokładne położenie HRE jest różne dla różnych genów ale jest najczęściej zlokalizowany z paśmie DNA przed fragmentem inicjacji transkrypcji jakieś kilkaset nukleotydów , czasem jest zlokalizowany w obrębie samego genu.
Geny kontrolowane przez kilka hormonów maja odpowiednio większą ilość HRE.
Fragment HRE odznacz się tym że wiąże się lepiej z kompleksem hormon receptor niż otaczające go fragmenty DNA lub inne DNA
HRE tez inicjuje odpowiedz na działanie hormonu. Domniemana sekwencja regulatorowego DNA może być sprzeżona z genami reporterowymi. Normalnie te geny fuzyjne zawierają geny reporterowe na które hormony zwykle nie mają wpływu (np. geny dla globiny, kinazy tymidynowej). Jeśli po transfekcji genu fuzyjnego do komórki hormon wykazuje działanie regulujące transkrypcje to znaczy ze HRE został zdefiniowany
**Mogą tez działać na transkrypcje hormony działające przez cAMP ale wtedy czynnikiem przenoszącym Sygułą jest specjalne białko CREB