MITOCHONDRIA- organelle otoczone podwójną błoną, obecne we
wszystkich komórkach eukariotycznych za wyjątkiem niektórych patogennych
ameb i erytrocytów.
Liczebność (skrajnie od 24 np. w plemnikach do 0.5 mln u ameby
Chaos chaos) i struktura różna w różnych typach komórek, przeważnie
proporcjonalna do intensywności oddechowej i zapotrzebowania na energię.
Stosunkowo mała liczba (kilkaset) mitochondriów charakteryzuje komórki
roślinne, niezróżnicowane komórki zwierzęce takie jak komórki nowotworowe,
regenerujące, limfocyty, komórki naskórka. Szczególnie dużo (1000-2000)
mitochondriów występuje w komórkach wątrobowych, okładzinowych
gruczołów żołądkowych, kanalików nerkowych krętych i komórkach kory
nadnerczy, komórkach mięśnia sercowego.
Wielkość mitochondriów jest również zróżnicowana i w komórkach
ssaków wg różnych źródeł ich długość wynosi 0,5-9mm a średnica 0,2-2mm.
Ani wielkość, ani kształt mitochondriów nie są stałe, lecz zmieniają się w
różnych stadiach rozwojowych komórki, jak i w zależności od warunków
metabolicznych.
Kształt mitochondriów jest zwykle okrągły lub owalny, bywają również
mitochondria niciowate i rozgałęzione np. u jednokomórkowych wiciowców,
glonów i drożdży Formy niciowate (o długości do 10mm) stwierdzono także w
komórkach trzustki, wstawce plemnika a także komórkach wątrobowych. Ten
typ mitochondriów powstaje na skutek ścisłego połączenia części powierzchni
sąsiednich mitochondriów tworząc w ten sposób nić lub rozgałęzioną sieć.
Niciowate mitochondria są przeważnie zorientowane wzdłuż mikrotubul, a
występowanie tej formy wiąże się z przesyłaniem na odległość energii
gradientu protonowego niezbędnej do wytworzenia ATP. Kształt mitochondriów
nie jest stały.
Lokalizacja mitochondriów w komórce również nie jest stała.
Lokalizują się one w miejscach zwiększonego zapotrzebowania na energię np.
między fibrylami komórek mięśniowych, w aparacie kurczliwym mięśnia
sercowego, u podstawy komórek nabłonka gruczołowego, w zakończeniach
włókien nerwowych - synapsach, wzdłuż włókien wrzeciona cytokinetycznego,
u podstawy witki w plemniku albo też lokalizują się w pobliżu substratów
oddechowych - przy kroplach tłuszczu. Przemieszczają się w komórce w
wyniku ruchów cytoplazmy lub dzięki związaniu się z elementami
cytoszkieletu takimi jak mikrotubule.
BUDOWA MITOCHNDRUM
Mitochondrium otoczone jest podwójną błoną białkowo-lipidową.
Pomiędzy obiema błonami występują strefy ścisłego kontaktu zwane miejscami
kontaktowymi. Są to miejsca, przez które transportowane są do wnętrza
mitochondrium prekursory białek. W miejscach tych skupione są białka
zewnętrznej błony mitochondrialnej istotne dla translokacji prekursorów -
białka receptorowe, białka kanałów błonowych.
Błona zewnętrzna jest podobna do błon endoplazmatycznego
retikulum, ma charakter sita molekularnego i jest przenikliwa dla substancji
osmotycznie czynnych, które przepuszcza poprzez specjalne kanały. Błona ta
zawiera enzymy metabolizmu tłuszczy ( synteza lipidów mitochondrialnych
oraz przekształcanie substratów lipidowych do formy metabolizowanej w
matriks) a jej enzymem markerowym (tj. charakterystycznym dla danej
struktury, dzięki któremu można daną strukturę wykryć) jest oksydaza
monoaminowa. W błonie tej zlokalizowane jest charakterystyczne dla niej
białko transbłonowe – poryna. Cząsteczki tego białka tworzą kanały
hydrofilne, tzw. pory wodne, przez które dyfundują cząsteczki o niskiej masie
(do 5 kDa). Błona zewnętrzna zawiera również receptory rozpoznające białka
cytoplazmatyczne transportowane do mitochondrium.
Błona wewnętrzna jest nieprzenikliwa dla substancji osmotycznie
czynnych - nawet dla małych jonów, jej przepuszczalność jest kontrolowana
przez specyficzne nośniki i pompy. Przez błonę tą przenikają swobodnie
jedynie tlen dwutlenek węgla, woda, amoniak, i substancje hydrofobowe.
Transport substancji wytwarzanych np. w cyklu Krebsa czy też jonów sodu,
wapnia, potasu i wodoru odbywa się za pośrednictwem specyficznych
białkowych przenośników wbudowanych w błonę wewnętrzną, zwanych
translokazami lub permeazami. Poza tymi białkami błona wewnętrzna zawiera
wszystkie składniki związane z łańcuchem oddechowym oraz fosforylacja
oksydacyjną. Błona wewnętrzna tworzy uwypuklenia zwane grzebieniami
mitochondrialnymi. Uwypuklenia te mają zwykle kształt 1) blaszek
(mitochondria lamelarne np. w komórkach wątroby i mięśni) częściowo lub
całkowicie przecinających mitochondrium, 2) cewek (rurek - mitochondria
tubularne np. u niektórych jednokomórkowych i tkankach steroidotwórczych u
kręgowców). Grzebienie mitochondrialne są bardzo plastyczne i podatne na
zmiany, ich liczba i kształt zmienia się podczas różnicowania komórki i jest
proporcjonalna do intensywności oddychania (zapotrzebowania na ATP).
Na powierzchni błony wewnętrznej (od strony matriks) występują
liczne cząstki uszypułkowane (buławkowate, grzybkowate), które są
odpowiednikiem katalitycznej części kompleksu enzymatycznego ATPazy
mitochondrialnej. Enzymem markerem tej błony jest dehydrogenaza
bursztynianowa.
Wnętrze mitochondrium wypełnia matriks o charakterze białkowego
żelu, której 50% stanowią białka głównie enzymatyczne (około 40 różnych
enzymów, m.in. enzymy cyklu kwasów trójkarboksylowych, b-oksydacji
kwasów tłuszczowych, syntezy DNA, RNA i białek, katabolizmu
aminokwasów). Enzymem markerowym matriks jest syntetaza cytrynianowa
występująca w cyklu Krebsa.
W matriks bezpośrednio jest zlokalizowany DNA mitochondrialny
(=mtDNA) w formie pierścieniowej, niekiedy liniowej, w liczbie od 1 do kilku
cząsteczek, przyczepionych do wewnętrznej błony mitochondralnej. mtDNA
pozbawiony jest histonów, koduje rRNA, tRNA, niektóre enzymatyczne białka
błon mitochondrialnych. Oprócz mtDNA, w mitochondriach niektórych
grzybów i roślin wyższych występują plazmidy (w formie kolistej i liniowej),
replikujące się niezależnie od mtDNA. Na terenie matriks występują również
rybosomy - o stałej sedymentacji 70S i właściwościach podobnych do
rybosomów prokariotycznych i plastydowych oraz ziarnistości fosforanu
wapnia. Większość białek matriks jest syntetyzowana na terenie cytoplazmy na
bazie genomu jądrowego. Z genomem mitochondrialnym jest związane u
zwierząt dziedziczenie cytoplazmatyczne. DNA mitochondrialny
charakteryzuje się małą liczbą sekwencji niekodujących.
Enzymy mitochondrialne
Z każdym przedziałem w mitochondrium są związane inne enzymy:
· błona zewnętrzna: oksydaza monoaminowa (marker), syntetazy acylo-CoA,
oraz oksydoreduktazy.
· przestrzeń międzybłonowa: kinaza adenylowa (marker), kinaza
nukleozydodifosforanowa.
· błona wewnętrzna - enzymy łańcucha oddechowego, syntetaza ATP, koenzym
Q, cytochromy, ubichinon.
· matriks - enzymy cyklu kwasów trókarboksylowych, oksydacji kwasów
tłuszczowych, syntezy DNA, RNA i białek.
FUNKCJE MITOCHONDRIÓW
Główną rolą mitochondriów jest dostarczanie komórkom energii w
postaci ATP w procesie oddychania tlenowego. Na oddychanie komórkowe
składają się 3 fazy: 1) glikoliza, 2) cykl kwasów trójkarboksylowych (cykl
Krebsa) i 3) łańcuch oddechowy. Pierwsza faza oddychania odbywa się na
terenie cytoplazmy podstawowej natomiast dwie pozostałe w mitochondriach.
Mitochondria mogą używać jako paliwa zarówno pirogronianu jak i kwasów
tłuszczowych. Pirogronian jest dostarczany z glukozy i innych cukrów, a kwasy
tłuszczowe pochodzą z tłuszczów. Obie cząsteczki paliwowe są transportowane
przez wewnętrzną błonę mitochondrialną, a następnie przekształcane przez
enzymy umiejscowione w matriks mitochondrialnej do kluczowego
intermediatu, jakim jest acetylo-CoA
W cyklu kwasów trójkarboksylowych, który zlokalizowany jest w
matriks oraz na powierzchni wewnętrznej błony mitochondrialnej, zachodzi
całkowite utlenienie acetylo-CoA, jednak nie bezpośrednio, tylko w wielu
etapach cyklu. Najpierw 2-węglowy fragment ulega kondensacji z 4-węglowym
szczawiooctanem do 6-węglowego cytrynianu, cytrynian ulega kolejno dalszym
przemianom w wyniku, których zachodzi dwukrotna dekarboksylacja i
czterokrotna dehydrogenacja (odwodorowanie). Ostatecznie, odtworzony
szczwiooctan łączy się z nową cząsteczką acetylo-CoA. W cyklu wytwarza się
CO2, uwalniany z komórki jako produkt uboczny, oraz powstają elektrony o
wysokiej energii przenoszone przez zaktywowane cząsteczki nośnikowe, NAD+
i FAD+ . Te wysokoenergetyczne elektrony są z kolei przenoszone do
wewnętrznej błony mitochondrialnej, gdzie wchodzą na łańcuch transportu
elektronów; oddanie elektronów powoduje regenerację NAD+ i FAD+,
cząsteczek niezbędnych do utrzymania ciągłości metabolizmu tlenowego.
Następnie rozpoczyna się transport elektronów wzdłuż łańcucha.
Łańcuch transportu elektronów, który przeprowadza fosforylację
oksydacyjną, występuje w błonie mitochondrialnej w wielu kopiach. Nazywany
również łańcuchem oddechowym, składa się prawie z 40 białek, z których ok.
15 bierze bezpośredni udział w transporcie elektronów. Białka tworzące
łańcuch oddechowy są pogrupowane w trzy duże enzymatyczne kompleksy
oddechowe, z których każdy zawiera wiele różnych białek. W skład
poszczególnych kompleksów wchodzą białka transbłonowe, które mocno
osadzają kompleks w wewnętrznej błoni mitochondrialnej. Trzy enzymatyczne
kompleksy oddechowe to 1) kompleks dehydrogenazy NADH. 2) kompleks
cytochromów b-c1 i 3) kompleks oksydazy cytochromowej. Każdy zawiera jony
metali i grupy chemiczne, które formują drogę dla elektronów przechodzących
przez dany kompleks. Te trzy kompleksy oddechowe są miejscami pompowania
protonów; każdy z nich można sobie wyobrazić jako białkową maszynę
pompującą protony w poprzek błony w czasie, gdy przez kompleks przechodzą
elektrony.
Transport elektronów rozpoczyna się, gdy usunięty z NADH jon wodorkowy
zostanie przekształcony w proton i dwa elektrony o wysokiej energii H: -® H+ +
2e-. Reakcja ta katalizowana jest przez dehydrogenazę NADH, pierwszy z
enzymatycznych kompleksów oddechowych przyjmujących elektrony. Białka
łańcucha oddechowego prowadzą elektrony tak, że przechodzą one kolejno od
jednego kompleksu do następnego. W każdym z trzech kompleksów
oddechowych elektrony poruszają się między atomami metali ściśle
związanymi z białkami, przeskakując z jednego jonu metalu na następny.
Natomiast między różnymi kompleksami są przenoszone przez cząsteczki,
które dyfundują w dwuwarstwie lipidowej. Od dehydrogenazy NADH
elektrony odbiera ubichinon, mała hydrofobowa cząsteczka rozpuszczalna w
dwuwarstwie lipidowej, która jako jedyny przenośnik elektronów nie jest
częścią białka. Ubichinon przenosi elektrony na kompleks cytochromów b-c1.
Stąd elektrony są odbierane przez kolejny ruchomy przenośnik – cząsteczkę
cytochromu c – który przekazuje elektrony do kompleksu oksydazy
cytochromowej, kończącej łańcuch oddechowy. Oksydaza cytochromowa
przekazuje elektrony na tlen cząsteczkowy w reakcji 4e- + 4H+ +O2 ® 2H2O.
Każde przeniesienie elektronu jest reakcją utleniania/redukcji.
Elektrony będą spontanicznie przechodzić od cząsteczek, które mają małe
powinowactwo do dostępnych dla nich elektronów do cząsteczek z dużym
powinowactwem, tracąc część swojej energii swobodnej. W łańcuchu
oddechowym przenośniki są ułożone według wzrastającego potencjału redoks
( coraz większe powinowactwo do przyjmowania elektronów), co umożliwia
stopniowe uwalnianie energii zmagazynowanej w elektronach NADH i FADH2.
Komórka może wykorzystać większość energii przenoszonych elektronów
dzięki posiadaniu białek, które potrafią pompować protony z na koszt
transportowanych przez siebie elektronów. Energia uwalniana podczas
transportu elektronów przez poszczególne kompleksy oddechowe służy do
przemieszczania H+ w poprzek błony do przestrzeni międzybłonowej. W
rezultacie korzystny energetycznie przepływ elektronów wypompowuje
protony z matriks do przestrzeni międzybłonowej tworząc elektrochemiczny
gradient protonowy w poprzek wewnętrznej błony mitochondrialnej. Aktywne
pompowanie protonów wytwarza gradient stężenia protonów (gradient pH,
stężenie protonów w matriks jest ok. 10 razy mniejsze niż w przestrzeni
międzybłonowej) w poprzek wewnętrznej błony mitochondrialnej oraz tworzy
potencjał błonowy ( różnicę w rozmieszczeniu ładunków elektrycznych po
dwóch stronach błony). Gradient pH i potencjał błonowy w wewnętrznej błonie
mitochondrialnej mają ten sam kierunek i razem tworzą silny elektrochemiczny
gradient protonowy, który stwarza bardzo korzystne warunki dla wejścia H+ z
powrotem do matriks mitochondrialnej. Jednak wewnętrzna błona
mitochondrialna jest nieprzepuszczalna dla jonów i protony mogą przez nią
przechodzić tylko w określonych miejscach, gdzie znajdują się dla nich kanały.
Gradient jonowy wytworzony w poprzek błony jest formą magazynowania
energii; energia ta może być wykorzystana do pracy użytecznej gdy jony mają
możliwość przepływania przez błonę, zgodnie z ich gradientem
elektrochemicznym.
Elektrochemiczny gradient protonowy wytworzony w poprzek
wewnętrznej błony mitochondrialnej jest używany w procesie fosforylacji
oksydacyjnej do napędzania syntezy ATP. Działanie tego mechanizmu jest
możliwe dzięki dużemu, związanemu z błoną enzymowi zwanemu syntazą ATP.
Jest to duże białko składające się z kilku podjednostek. Wystająca z
wewnętrznej błony w kierunku matriks duża część enzymu kształtem
przypominająca główkę lizaka ( CF1), jest przymocowana do transbłonowego
kanału dla protonów (CF0)za pomocą zbudowanego z wielu podjednostek
„trzonka”. Enzym tworzy hydrofilową drogę w poprzek wewnętrznej błony
mitochondrialnej, co pozwala na przepływ protonów zgodnie z ich gradientem
stężeń. Energia strumienia przepływających protonów zostaje użyta przez
katalityczną część syntazy do syntezy ATP z ADP i Pi . Syntaza ATP spełnia
rolę turbiny, która umożliwia gradientowi protonowemu napędzanie produkcji
ATP. Elektrochemiczny gradient protonowy jest wykorzystywany nie tylko do
syntezy ATP, napędza również aktywny transport metabolitów pomiędzy
matriks mitochondrialną a cytoplazmą
Zaproponowaną po raz pierwszy w latach 60. hipotezę zakładającą
związek między transportem elektronów, pompowaniem protonów i syntezą
ATP nazwano sprzężeniem chemiosmotycznym, ze względu na
współdziałanie reakcji tworzących wiązania chemiczne podczas syntezy ATP
( „chemi”) z procesami transportu przez błony („osmotyczna” od greckiego
osmos, tzn. „pchać”). Mechanizmy sprzężenia chemiosmotycznego są
powszechne, a ich rodowód jest bardzo stary. Wykorzystują go zarówno
bakterie jak i rośliny oraz zwierzęta.
Związki wysokoenergetyczne
Podstawowym związkiem wysokoenergetycznym w komórce jest ATP.
ATP tworzy się głównie podczas fosforylacji oksydacyjnej w mitochondriach,
oraz w czasie fosforylacji substratowej (jak w glikolizie) i fosforylacji
fotosyntetycznej w chloroplastach. Tworzenie ATP mitochondrialnego
sprzężone jest z przemieszczaniem elektronów z cyklu Krebsa, mających
wysoką energię, na kolejne akceptory elektronów. ATP powstały w łańcuchu
oddechowym jest głównym źródłem dostępnej energii u wszystkich
heterotrofów. W procesie glikolizy jedna cząsteczka glukozy dostarcza 2
cząsteczki ATP netto zaś podczas utlenienia jednej cząsteczki glukozy
poczynając od glikolizy i kończąc na fosforylacji oksydacyjnej zysk netto
wynosi ok. 30 cząsteczek ATP. Energia ta niezbędna jest do licznych procesów
syntezy różnych substancji komórkowych, ruchu cytoplazmy, transportu,
utrzymania organizacji złożonej struktury, regulacji hormonalnej. U zwierząt
nakładu energii wymaga dodatkowo przewodnictwo w układzie nerwowym,
praca mięśni, zjawiska bioluminescencji i inne. Dlaczego przemiany w
komórce przebiegają tak złożonymi drogami? Utlenianie cukrów do CO2 i
wody z pewnością mogłoby przebiegać prościej z wykluczeniem cyklu kwasu
cytrynowego i wielu etapów łańcucha oddechowego. Byłoby to jednak
katastrofalne w skutkach dla komórki. Ogromna ilość energii swobodnej
uzyskiwana podczas oddychania może być skutecznie wykorzystana tylko w
małych porcjach. W skład szlaków utleniania biologicznego wchodzi wiele
intermediatów, z których każdy niewiele różni się od poprzednika. Wskutek
tego uwolniona energia zostaje rozłożona na porcje, które za pomocą reakcji
sprzężonych mogą być skutecznie zamienione w wysokoenergetyczne wiązania
takich cząsteczek, jak ATP i NADPH.
INNE FUNKCJE
1.Tworzenie acetylo-CoA i utrzymanie jego poziomu w komórce. W wyniku
utleniania pirogronianu i b-oksydacji kwasów tłuszczowych powstają znaczne
ilości acetylo-CoA. Związek ten jest kluczowy dla wielu procesów
metabolicznych np. w cyklu krebsa w mitochondriach.
2. Synteza, rozkład i przemiany aminokwasów takie jak transaminacja,
deaminacja, dekarboksylacja a także wymiana ich z cytoplazmą.
3. Współudział z glioksysomami w glukoneogenezie - w przemianie tłuszczów
w cukrowce podczas kiełkowania nasion, w których materiałami zapasowymi
są tłuszcze.
STRUKTURA WEWNĘTRZNA A AKTYWNOŚĆ ODDECHOWA
Na podstawie struktury wewnętrznej mitochondrium i jego aktywności
oddechowej wyróżniono 6 stanów energetycznych, w tym wyróżnia się 2
skrajne stany (formy) metaboliczne: skondensowaną, charakteryzującą się
znacznym zagęszczeniem matriks poprzez jej skurczenie, wywołane wolną
energią pochodzącą bezpośrednio z łańcucha transportu elektronów.
Przestrzenie wewnątrzgrzebieniowe (międzybłonowe) takich mitochondriów są
poszerzone, przestrzeń wewnętrzna (matriks) jest obkurczona. Takie
mitochondria zawierają mało ATP (ATP jest zużywany - defosforylowany do
ADP) i występują w komórkach o wysokim poziomie oddychania.
Przeciwstawną formą jest forma ortodoksyjna charakteryzująca się zwężoną
przestrzenią wewnątrzgrzebieniową (międzybłonową) i dużą ilością jasnej (na
zdjęciach z mikroskopu elektronowego) matriks. W stanie tym dochodzi do
silnej energizacji błon przez silny przepływ elektronów, ADP jest
fosforylowany do ATP. Mitochondria takie będą występowały w komórkach o
zmniejszonym zapotrzebowaniu na energię i małym zużyciu tlenu.
POCHODZENIE I POWSTAWANIE MITOCHONDRIÓW
Według hipotezy endosymbiozy mitochondria powstały w ewolucji z
bakteryjnych endosymbiontów (prawdopodobnie bakterie a-purpurowe)
stopniowo integrowanych w komórkę gospodarza, która dostarczyła genom
jądrowy, co miało miejsce prawdopodobnie 1mld lat temu. Wskazuje na to
wiele podobieństw bakterii do mitochondriów: struktura genomu, rRNA,
struktura genów kodujących białka transformujące energię, złożoność
funkcjonalna. Zgodnie z tą hipotezą błona zewnętrzna mitochondriów jest
ewolucyjnie błoną fagosomu, czyli pochodną błony komórkowej, zaś błona
wewnętrzna reprezentuje błonę bakterii. Sfagocytowane bakterie-
premitochondria- utraciły w czasie ewolucji komórek eukariotycznych
większość swoich genów na rzecz gospodarza, zostały one wbudowane w
genom komórki eukariotycznej.
Mitochondria, podobnie jak plastydy, pozostają w komórce
półautonomiczne, zachowują odrębny genom ulegający replikacji i ekspresji,
ale nie są zdolne do samodzielnego funkcjonowania. W komórkach
eukariotycznych mitochondria namnażają się przez podział lub rzadziej
pączkowanie.