Koenzymy – niebiałkowe składniki białek (np. enzymów) niezbędne dla ich aktywności, rodzaj
kofaktorów. W przeciwieństwie do grup prostetycznych, są nietrwale (niekowalencyjnie), luźno
związane z białkami. Białko bez swojego koenzymu to apobiałko (apoproteina, apoenzym),
natomiast wraz z nią holobiałko (holoproteina).Biorą udział w reakcjach przez oddawanie lub
przyłączanie reagentów (atomów, grup atomów czy elektronów).Koenzymy mogą mieć charakter
zarówno organiczny (np. nukleotydy i ich pochodne) lub nieorganiczny (np. jony metali).Wiele
organicznych koenzymów to witaminy lub ich pochodne, dlatego właśnie te związki są niezbędne
dla funkcjonowania organizmu.
Wpływ PH – Najodpowiedniejsze stężenie jonów wodorowych, tzn. takie, przy
którym szybkość działania enzymu jest największa, nazywamy optimum pH. Dla większości
enzymów znajduje się ono w zakresie 5–7. Wpływ pH na aktywność danego enzymu zależy
od wartości stałej dysocjacji:
a) grup jonizujących w centrum aktywnym enzymu uczestniczących w wiązaniu
substratu,
b) grup funkcyjnych w cząsteczce substratu, którymi wiąże się on z enzymem,
c) grup funkcyjnych w cząsteczce enzymu, od których zależy kataliza,
d) innych grup w cząsteczce enzymu, których stan zjonizowania może warunkować
jego katalitycznie aktywną konformację.
Wpływ Temperatury – w miarę wzrostu temperatury reakcja enzymatyczna, podobnie jak każda
reakcja chemiczna, początkowo ulega przyspieszeniu w związku z dostarczaniem energii cieplnej
do układu. Podwyższenie temperatury przyspiesza szybkość reakcji zgodnie z regułą van't Hoffa,
która głosi, że podwyższenie temperatury o 10°C powoduje około dwukrotny wzrost szybkości
reakcji enzymatycznych. W określonej temperaturze zostaje osiągnięte optimum działania enzymu,
a przy dalszym jej wzroście następuje gwałtowny spadek szybkości reakcji, co jest związane z
denaturacją cieplną białka enzymu.
Wpływ aktywatorów i inhibitorów
Większość enzymów wymaga do uzyskania pełnej aktywności różnych czynników chemicznych
przyspieszających, a nawet umożliwiających ich działanie. Czynniki te nazywamy aktywatorami.
Działanie aktywatorów polega na ułatwieniu powstawania układu enzym – substrat. Aktywatorami
enzymów mogą być jony metali lub aniony współdziałające z białkiem enzymu, związki regulujące
potencjał redox środowiska, od których zależy budowa centrów aktywnych, bądź też związków
odszczepiających pewne grupy chemiczne, blokujące centra aktywne enzymu, np. a-amylaza
wymaga jonów Cl-, natomiast oksydaza polifenolowa jest aktywowana przez Cu2+, liczne
peptydazy przez jony Mn2+, Co2+, Zn2+. Czynniki hamujące działanie enzymów noszą nazwę
inhibitorów. Mechanizm działania inhibitorów jest różny, najczęściej polega na łączeniu się ich z
centrum aktywnym enzymu lub z koenzymem czy grupą prostetyczną powodując ich
unieczynnienie.
Inhibicja enzymu nieodwracalna – trwałe związanie inhibitora z resztami aminokwasów w
miejscu aktywnym, co na stałe inaktywuje enzym.
Inhibicja enzymu odwracalna, hamowanie aktywności enzymu, które polega na
współzawodnictwie inhibitora strukturalnie podobnego do substratu z cząsteczkami substratu o
wiązanie się z miejscem aktywnym enzymu (inhibicja kompetycyjna np kwas malonowy, ktory
hamuje aktywność dehydrogenazy bursztynianowej (oksydoreduktaza występująca w cykl Krebsa)
albo na wiązaniu się inhibitora niekompetycyjnego z miejscami innymi niż miejsce aktywne, co
zmniejsza szybkość katalityczną enzymu przez zmianę konformacyjną jego cząsteczki (inhibicja
niekompetycyjna, allosteryczna np. kwas acetylosalicylowy (aspiryna). Kwas acetylosalicylowy
hamuje niekompetycyjnie dehydrogenazę 2-oksoglutaranową (kompleks enzymatyczny działający
w cyklu Krebsa),).
Podział Enzymów:
•Oksydoreduktazy - przeprowadzają reakcje typu redox (utleniania – redukcjii) przenoszczenie
elektornów np. Oksydazy, hydroperoksydazy, peroksydazy, katalazy, oksygenazy, hydroksylazy,
dehydrogenazy (np. dehydrogenaza alkoholowa – enzym z grupy oksydoreduktaz przyspieszający
przekształcanie się aldehydu octowego w etanol lub odwrotnie.)
•transferazy - przenoszą grupy funkcyjne z jednej cząsteczki na inną (np. tiolowej (-SH), aminowej
(-NH ), metylowej (-CH ) czy fosforanowej (-OPO H )) lub atomu z jednej cząsteczki (donora) na
2
3
3 2
drugą (akceptora). Należą do nich np: metylotransferazy, fosfotransferazy, glukotransferazy,
acylotransferazy, aminotransferazy, kinazy (katalizują reakcję przeniesienia grupy fosforanowej ze
związku wysokoenergetycznego (np. ATP) na właściwą cząsteczkę docelową.)
•hydrolazy - biorą udział w reakcjach rozpadu z udziałem wody, hydroliza np, proteazy –
rozcinające białka, nukleazy - rozcinające kwasy nukleinowe (np. rybonukleazy, DNAzy),
glikozylazy - rozcinające węglowodany, amylaza, amyloglukozydaza, inwertazy - rozcinające wiązanie β-glikozydowe sacharozy, fosfatazy - katalizujące defosforylację estrów fosforanowych,
np nukleotydów, lipazy - rozcinające tłuszcze
•liazy - udział w reakcjach rozpadu bez udziału wody np liazy wiązań C-C (karboksylazy, np.
dekarboksylaza pirogronianowa), liazy wiązań C-O (np. hydrataza fumaranowa, dehydrataza
węglanowa), syntetazy liazy wiązań C-N (np. histydaza).
•izomerazy - udział w reakcjach przegrupowania wewnątrzcząsteczkowego np epimerazy,
zmieniające położenie podstawników przy asymetrycznym atomie węgla; substratami epimeraz
mogą być węglowodany i ich pochodne; przykład: 3-epimeraza rybulozofosforanowa katalizuje
reakcję: D-rybulozo-5-fosforan = D-ksylulozo-5-fosforan;
oksydazy wewnątrzcząsteczkowe, przenoszące atomy wodoru na tlen; substratami mogą być aldozy
i ketozy; przykład: izomeraza rybozofosforanowa katalizuje reakcję: D-rybozo-5-fosforan = D-
rybulozo-5-fosforan;
transferazy wewnątrzcząsteczkowe (mutazy), zmieniające położenie reszty fosforylowej; przykład:
fosfomutaza fosfoglicerynianowa katalizuje reakcję: 2-fosfo-D-glicerynian = 3-fosfo-D-
glicerynian;
izomerazy trans – cis, zmieniające położenie podstawników. , racemazy
•ligazy - udział w reakcjach syntezy (Syntetazy (sprzężone z hydrolizą ATP) i Karboksylazy) np
Ligazy DNA uczestniczą w łączeniu nici kwasu dezoksyrybonukleinowego, karboksylaza
pirogronianowa katalizuje przyłączenie dwutlenku węgla do pirogronianu – tworzenie
szczawiooctanu.