Biochemia wyklady


Biochemia wyklady

Wiązanie chemiczne

Typy wiązań chemicznych

Mechanizm tworzenia wiązań
H + H
H2

0x08 graphic
0x01 graphic

Wiązanie chemiczne

0x08 graphic
0x01 graphic

-COOH0x08 graphic
0x01 graphic

Wiązanie kowalencyjne, kowalencyjne spolaryzowane
i jonowe

Wiązanie wodorowe

0x08 graphic
0x01 graphic

Wiązanie wodorowe - rodzaj stosunkowo słabego wiązania chemicznego polegającego głównie na przyciąganiu elektrostatycznym między atomem wodoru i atomem elektroujemnym zawierającym wolne pary elektronowe.
Wysoka temp. Wrzenia wody spowodowana jest obecnością wiązań wodorowych

Energia aktywacji

A-B + C A + B-C

A-B + C A + B-C

Energia aktywacji EA (E1) jest równa wysokości bariery energetycznej, którą muszą pokonać reagujące cząstki na drodze reakcji,

(E2)- energia aktywacji reakcji odwrotnej.

Różnica pomiędzy stanem energetycznym produktów i substratów DU jest równa ciepłu reakcji Q.

0x08 graphic
0x01 graphic

Kataliza chemiczna

0x08 graphic
0x01 graphic

Katalizator

Model miejsca aktywnego enzymu

0x08 graphic
0x01 graphic

Inhibitory współzawodnicze (odwracalne) , wiążą się w sposób odwracalny w miejscu aktywnym enzymu

0x08 graphic
0x01 graphic
Sulfonamidy blokują enzymy bakteryjne

Inhibitory niewspółzawodnicze (nieodwracalne) wiążące się kowalencyjnie, nieodwracalnie w miejscu aktywnym enzymu

0x08 graphic
0x01 graphic

Gazy bojowe toksyczne dla enzymów ssaków,

Penicylina dla enzymów bakterii.

Prawo działania mas

A + B AB

V = k * [A] * [B]

Prawo działania mas
reakcja odwrotna

AB A + B

V2 = k2 * [AB]

Dla reakcji A +B = AB
szybkości:
reakcja biegnąca w prawo  V1= k1 * [A] * [B] 
reakcja odwrotna V2=k2 * [AB]
 
Dla stanu równowagi
 
V1 = V2
 
k1 * [A] * [B] =k2 * [AB]
 
[AB] k1
---------------- = ------ = K
[A] * [B] k2

Definicja pH

Mocne i słabe kwasy

Mocne kwasy
takie jak kwas solny, kwas siarkowy kwas azotowy są całkowicie zdysocjowane w roztworach wodnych i ich stężenie analityczne (dodane) jest równe stężeniu jonów wodorowych

Dla słabych kwasów (np.. octowy, mrówkowy) częściowo tylko zdysocjowanych należy stężenie jonów wodorowych (pH) wyliczać w oparciu o prawo działania mas

AH = A- + H+
 
[AH]
---------------- = K
[A-] * [H+]
 
  1 [A-]
-------- =-------- * K
[H+] [AH]
 
[A-]
pH = log -------- + pK
[AH]

pH buforu nie zależy od rozcieńczenia

Przykładowe wartości pH dla niektórych płynów ustrojowych

Równowaga kwasowo-zasadowa

Równowaga kwasowo-zasadowa - to stan, w którym zachowany jest swoisty stosunek kationów i anionów w płynach ustrojowych, warunkujący odpowiednie pH i prawidłowy przebieg procesów życiowych
Optymalny zakres pH krwi dla większości procesów przemiany materii wynosi 7,35-7,45

Stabilizacja pH organizmu

Najważniejsze procesy odpowiedzialne za stabilizacje pH:

- wydalanie nadmiaru dwutlenku węgla przez płuca

- wydalanie kwasów lub zasad przez nerki

- wytwarzanie amoniaku.

system buforów krwi i tkanek

Regulacja pH

Mechanizm buforowania roztworów przez białka

ATP

Rozerwaniu wiązania ostatniego fosforanu z ATP towarzyszy wydzielenie energii 7300 cal/mol czyli 30500 J/mol lub 30,5kJ/mol.

Masa cząsteczkowa ATP wynosi 507.2 czyli około 60 kJ/ kg.

+

Wysokoenergetyczne wiązania to ATP adenozynotrojfosforan

Bezwodnikowe wiązania (tworzone między cząsteczkami kwasu fosforowego lub między cząsteczką kwasu fosforowego i grupą karbonylową przez odłączenie cząsteczki wody) mają duży ujemny potencjał termodynamiczny (dG hydrolizy)

AMP, ADP, ATP

Zużycie ATP

Stężenia związków zawierających fosforan w mięśniach w stanie spoczynku

ATP 4 mM

ADP 0,013 mM

Fosforan kreatyny 25 mM

Kreatyna 13 mM

Metabolizm to całokształt reakcji biochemicznych zachodzących w komórkach organizmu. Związany jest z przepływem materii i energii.

Anabolizm to reakcje syntez związków złożonych z prostszych, wymagające dostarczenia energii. Energia ta podnosi poziom energetyczny związków w czasie procesu chemicznego. Powstający produkt rekcji zawiera większą ilość energii, niż poszczególne substraty. Dostarczona energia zostaje zmagazynowana w postaci wiązań chemicznych.

Katabolizm to reakcje chemiczne podczas których następuje obniżanie poziomu energetycznego substratów w wyniku ich rozkładu na związki proste, oraz wydzielana jest energia wiązań wysokoenergetycznych substratów.

GTP, GDP ATP

utlenianie NADH

0x08 graphic
0x01 graphic

Przemiany energetyczne organizmu

Węglowodany tłuszcze białka

Cukry proste kwasy tłuszczowe aminokwasy

WSZTSTKIE ROZKLADAJA SIĘ DO Acetylo-koenzym

POTEM JEST Cykl Krebsa

potemEnergia w postaci powstającego ATP, NADH oraz FADH2

Powstawanie acetylo-CoA

0x08 graphic
0x01 graphic

0x08 graphic
0x01 graphic

zamienianych na energię magazynowaną w ATP w łańcuchu oddechowym

CoA + GTP + 3NADH + 3H+ + FADH2 + 2CO2

Cykl kwasu cytrynowego (Krebsa)

Jabłczan szczawiooctan cytrynian

0x08 graphic
0x01 graphic
ziocytrynian po lewej

Furman po pawejbursztynian bursztynyloCoA -ketoglutaran szczawiobursztynian

Etap1 4-węglowy i 2-karboksylowy (4C, 2COOH) szczawiooctan łączy się z grupą acetylową pochodzącą z acetylo-CoA i tworzy 6-węglowy i 3-karboksylowy cytrynian -(enzym-syntaza cytrynianowa)

Etap 2Następuje izomeryzacja cytrynianu do izocytrynianu czemu towarzyszy odłączenie i przyłączenie cząsteczki wody -(enzym-hydrataza akonitanowa)

Etap 3 6-węglowy i 3-karboksylowy izocytrynian (6C, 3COOH) ulega utlenieniu (odłączane są dwa atomy wodoru) i przechodzi w szczawiobursztynian jednocześnie następuje redukcja NAD+ do NADH -(enzym-dehydrogenaza izocytrynianowa)

Etap4 Następuje odłączenie cząsteczki CO2 , ze szczawiobursztynianu (6C, 3COOH) powstaje α-ketoglutaran(5C,2COOH) -(enzym-dehydrogenaza izocytrynianowa)

Etap 5 5-węglowy i 2-karboksylowy α-ketoglutaran (5C, 2COOH) analogicznie do poprzedniego etapu ulega utlenieniu i dekarboksylacji tworząc
4-węglowy i 1-karboksylowy związek, który łącząc się z koenzymem A daje bursztynylo-CoA (4C, 1COOH) -(enzym-dehydrogenaza
-ketoglutaranowa )

Eta 6 bursztynylo-CoA (4C, 1COOH) odłączając koenzym A tworzy bursztynian (4C, 2COOH) uwalniając jednocześnie dużą porcję energii, która za pośrednictwem nukleotydu GTP przekazywana jest na ADP fosforylując go do ATP - (fosforylacja substratowa} -(enzym-syntetaza bursztynylo-CoA )

Etao 7 4-węglowy i 2-karboksylowy bursztynian (4C, 2COOH) ulega dehydrogenacji i utlenieniu do 4-węglowego i 2-karboksylowego fumaranu (4C, 2COOH) towarzyszy temu redukcja FAD do FADH2 -(enzym-dehydrogenaza bursztynianowa )

Etap 8 fumaran (4C, 2COOH) ulega hydratacji do jabłczanu (4C, 2COOH); jabłczan jest bardzo podobny pod względem budowy chemicznej do bursztynianu - zamiast jednego wodoru przy C2 (bursztynian) występuje grupa hydroksylowa (jabłczan) -(enzym-fumaraza )

Etap 9 4-węglowy i 2-karboksylowy jabłczan (4C, 2COOH) ulega dehydrogenacji do 4-węglowego i 2-karboksylowego szczawiooctanu (4C, 2COOH), który w kolejnym etapie łącząc się z grupą acetylową acetylo-CoA rozpoczyna kolejny cykl od nowa-(enzym-dehydrogenaza jabłczanowa )

Regulacja cyklu kwasu cytrynowego

Na szybkość cyklu ma wpływ:

dostępność substratów,

hamujące działanie nagromadzonych produktów i oparte na mechanizmach sprzężenia zwrotnego allosteryczne hamowanie przez następne intermediaty cyklu

. Najbardziej prawdopodobnymi miejscami regulacji są reakcje nieodwracalne katalizowane przez następujące enzymy:
- syntazę cytrynianową (hamowana przez cytrynian, a także przez ATP)
- dehydrogenazę izocytrynianową (hamowana przez NADH i ATP, a aktywowana przez ADP)
- dehydrogenaz
ę α-ketoglutaranową (hamowana przez NADH i bursztynylo-CoA)
- dehydrogenazę pirogronianową (hamowana przez NADH i acetylo-CoA).

Wniosek 1

Cykl Krebsa przebiega szybciej, gdy poziom energii w komórce jest niski

(duże stężenie ADP, a małe stężenie ATP i NADH),

zwalnia swój przebieg, gdy dochodzi do akumulacji ATP (jak i również NADH, byrsztynylo-CoA oraz cytrynianu).

Wniosek 2

Cykl Krebsa zachodzi wyłącznie w warunkach tlenowych. Tlen choć nie bierze bezpośredniego udziału w cyklu Krebsa to jest niezbędny do utleniania FADH2 i NADH

Łańcuch oddechowy

0x08 graphic
0x01 graphic

NADH i FADH2 są bogate energetycznie, ponieważ zawierają pary elektronów o wysokim potencjale przenoszenia. Energia swobodna uwalniana podczas przenoszenia tych elektronów na tlen cząsteczkowy jest wykorzystywana do pompowania protonów przez wewnętrzną błonę mitochondrium do przestrzeni międzybłonowej

Protony wracając specjalnym kanałem do wnętrza mitochondrium powodują syntezę ATP.

Brak tlenu hamuje syntezę ATP,

Nadmiar ATP i brak ADP hamuje fosforylację oksydacyjną dzięki temu proces zachodzi wtedy gdy organizm potrzebuje ATP

Z każdej cząsteczki NADH powstają 2,5 cz. ATP, a z FADH2 - 1,5 cz.

Leonardo da Vinci zauważył że mięśnie mogą jedynie ciągnąć, zauważył również że wyjątkiem jest język, który może pchać

Antagonistyczne działanie mięśni:

0x08 graphic
0x01 graphic

Budowa anatomiczna mięśnia szkieletowego

0x08 graphic
0x01 graphic

Mięsnie poprzecznie prążkowane, utworzone są z długich, wielojądrowych komórek.. Włókna mięśnia prążkowanego składają się z jasnych i ciemnych prążków,. Mięsnie te pracują szybko zgodnie z nasza wola, jednocześnie szybko się męczą.

Obserwacje mięśni prążkowanych pod mikroskopem

W obrębie sarkomeru wyróżniamy

Linię Z

Pasmo A-długość stała

Pasmo I-ulega zmniejszeniu podczas skurczu

Strefę H zmniejsz się podczas skurczu

Budowa sarkomeru

0x08 graphic
0x01 graphic

Miozyna

Mięśnie szkieletowe zawierają 70 do 100 mg miozyny w 1g. Stanowi to około 40 50 %. wszystkich białek w mięśniu.

Mcz. monomeru miozyny wynosi ok. 200 kD. Miozyna rozpuszczalna jest w roztworach soli (0,5 M) przy niższym stężeniu soli polimeryzuje tworząc filamenty miozynowe

0x08 graphic
0x01 graphic

Silne i słabe wiązanie miozyny z aktyną

Miozyna łączy się z aktyną

W nieobecności ATP z bardzo dużą siłą stała wiązania (stan silnego wiązania) Kw= 108 M taki stan w mięśniach nazywa się rygor, polega na maksymalnym napięciu mięśni pojawia się po śmierci gdy zużyje się ATP

W obecności ATP siła wiązania aktyny do miozyny spada 10000 razy i wynosi Kw= 104 . Wiązanie miozyny do aktyny w obecności ATP nazywa się stanem słabego wiązania. Dodanie ATP do mięśni w stanie rygor powoduje ich rozluźnienie.

Hydroliza MgATP przez aktomiozynę

Sama miozyna hydrolizuje ATP ale bardzo powoli

Dodatek aktyny przyspiesza wiele razy szybkość hydrolizy MgATP, nazwa aktyna jest spowodowana jest tym że to białko aktywuje aktywność ATPazy miozynowej

Cykl hydrolizy ATP

0x08 graphic
0x01 graphic

Regulacja aktywności aktomiozyny

Czysty kompleks aktomiozynowy hydrolizuje ATP z maksymalną prędkością niezależnie od stężenia jonów wapnia.

Dodatek tropomiozyny i troponiny, białek wchodzących w skład mięśni szkieletowychi i sercowych które silnie wiążą się z aktyną powoduje czułość na wapń aktomiozyny.

Regulacja aktywności mięsni po przez filament aktynowy

0x08 graphic
0x01 graphic

Regulacja skurczu mięśni szkieletowych

Regulacja skurczu mięśni szkieletowych zachodzi po przez zmiany filamentu aktynowego

0x08 graphic
0x01 graphic

Aktynowy filament zbudowana jest z globularnych monomerów, które polimeryzując tworzą 2 spiralnie zwinięte ze sobą łańcuch

Każdy monomer ma miejsce wiążące główkę miozyny, w czasie spoczynku miejsce to jest zablokowane kompleksem białkowym troponina-tropomiozyna

Wydłużona cząsteczka tropomiozyny leży w rowku między łańcuchami monomerów aktyny, kontaktuje się z 7 monomerami aktyny

Troponina przy dużym stężeniu wapnia (ok. 10 -5) przesuwa cząsteczkę tropomiozyny i odsłania miejsca aktywne na aktynie umożliwiając oddziaływanie aktyny z miaozyną i skurcz mięśni

W czasie spoczynku mięśnia gdy stężenie Ca+2 w sarkoplazmie jest niskie (ok. 10 -5) polimery tropomiozynowe znajdują się w centrach miejsc wiązania aktyny z główkami miozyny, uniemożliwiając skurcz mięsni

Proces skurczu przebiega w następujących etapachh:

Regulacja skurczu

Komórki mięśni szkieletowych reagują na zasadzie: wszystko albo nic

Ilość aktywowanych jednostek motorycznych decyduje o sile skurczu

0x08 graphic
0x01 graphic

Typy włókien mięśniowych

Rodzaje mięśni

0x08 graphic
0x01 graphic

Mięsnie poprzecznie prążkowane, utworzone są z długich, wielojądrowych komórek. Włókna mięśnia prążkowanego składają się z jasnych i ciemnych prążków. Tkanka ta tworzy mięsnie szkieletowe, tzw. ruchowe. Mięsnie te pracują szybko zgodnie z nasza wola, jednocześnie szybko się męczą.

Mięsień serca, zbudowany jest z włókien poprzecznie prążkowanych rozgałęzionych, zaopatrzonych w pojedyncze jądra ułożone centralnie. Tkanka ta jest mocno ukrwiona, tworzy jeden narząd - serce.

Mięsień gładki, zbudowany z wrzecionowatych komórek, zawierających jedno jądro komórkowe ułożone centralnie.

Mięsnie gładkie pracują (kurczą się) wolno, nie ulęgają szybko zmęczeniu, ich praca jest niezależna od woli organizmu - regulowana przez autonomiczny układ nerwowy.

Mięśnie gładkie to: naczynia krwionośne, tętnice, żyły, żołądek, macica, mięśnie jelit, pęcherz

W mięśniu sercowym mechanizm regulacji jest podobnie jak w mięśniach szkieletowych związany z filamentami aktynowymi (troponina +tropomiozyna)

W mięśniach gładkich mechanizm regulacji związany jest z filamentami miozynowymi ulegającymi w trakcie regulacji odwracalnej fosforylacji

Mięsień gładki

0x08 graphic
0x01 graphic

Skurcz mięśni gładkich

0x08 graphic
0x01 graphic

Kreatyna

0x08 graphic
0x01 graphic

Przekazanie reszty fosforanowej

0x08 graphic
0x01 graphic

Wydajność przemian produkujących ATP w mięśniach

PRZEMIANY BEZTLENOWE

PRZEMIANY TLENOWE

Przykłady aktywności wykorzystujących różne szlaki metaboliczne

typ przemiany - źródło energii

przykłady

Beztlenowa

fosfokreatyna

skok, cios, nagły zwrot ciała

Beztlenowa

glukoza

ucieczka lub pogoń; bieg 100 m

Tlenowa

glukoza

godzinny intensywny marsz, bieg na 1500 m

Tlenowa kw.tłuszczowy

wielogodzinny marsz; bieg maratoński

Rola kreatyny

Żródła energii mięśni szkieletowych

kinaza adenylanowa

całkowita odwracalność tej reakcji, powoduje że ubytek ATP natychmiast jest kompensowany po przez zamianę ADP na ATP i AMP

Różne fazy aktywności

Zwiększa się aktywność glikolizy a to pociąga zwiększenie aktywności glikogenolizy

Regeneracja energetyczna mięśni

Energia kwasów tłuszczowych

Rola kwasów tłuszczowych

Kwasy tłuszczowe -pożywienie

Kwasy tłuszczowe przykłady

Trawienie triacylogliceroli

Sole kwasów żółciowych (emulgacja)

Lipazy trzustkowe

Lipazy jelitowe

Hydroliza tłuszczów

0x08 graphic
0x01 graphic

-oksydacja kwasów tłuszczowych

Aktywacja kwasów tłuszczowych

0x08 graphic
0x01 graphic

Transport kwasów tłuszczowych

0x08 graphic
0x01 graphic

Suplementacja karnityną

Bilans rozpadu kwasu palmitynowego

0x08 graphic
0x01 graphic

Synteza kwasów tłuszczowych



Wyszukiwarka

Podobne podstrony:
b9.11, Prywatne, Biochemia WYKŁADÓWKA I, Biochemia wykładówka 1, WYKŁADY, wykłady I
Biochemia wykład nr 3 kopia
Biochemia wykład 1st 2nd rok 2
globalne cykle biochemiczne wykład 10
Biochemia wykład1, wzory
Biochemia - kolokwium[1], Studia, Semestr III, Biochemia, Wykłady
lipidy 2, Prywatne, Biochemia WYKŁADÓWKA I, Biochemia wykładówka 1, TESTY, testy
Biochemia wykład 13 Metabolizm węglowodanów
Biochemia wykład 04 2013r 3
Biochemia- wyklady 1-8, Semestr II, biochemia
Biochemia wykłady, biochemia
biochemiawykady, Wykład 12, Wykład 12
BIOCHEMIA WYKŁAD I&092014
Biochemia wykład 04 2013r
Biochemia wykład 4
Biochemia Wyklady id 86257
biochemia wykłady, pielęgniarstwo, biochemia
Biochemia wykład 04 2013r 2

więcej podobnych podstron