Biochemia wykład 04 2013r 2

Związane jest to przede wszystkim od różnic w budowie w DNA, jak wiadomo w u eucariota są kodujące i niekodujące introny i egzony, jeżeli chodzi o ilość DNA u człowieka jest około 1000 razy więcej aniżeli u bakterii, z drugiej strony u organizmów eucariotycznych zbudowanych z wielu komórek(człowiek 100 bilionów) niewszystkie istniejace geny musza być w tym samym czasie czynne – aktywne. Ich aktywacja związana jest z przyłączaniem do określonych struktur DNA, przede wszystkim białek, one pełnią funkcje regulatorowe. Istotną rolę w regulacji ekspresji genów pełnią histony, przynajmniej jeden z nich moze indukować transkrypcję(inicjację transkrypcji). Ekspresja genów u eucariota jest kontrolowana podobnie jak u procariota na poziomie transkrypcji, ale również na poziomie translacji. Kontrola ta(regulacja procesu) polega przede wszystkim na kombitoryjnym przyłączaniu różnego rodzaju białek(?). Aktywatory transkrypcji posiadają dwa główne rejony. Pierwszy rejon, to domena wiążąca się z DNA, która rozpoznaje określoną sekwencję na DNA i domena aktywująca(aktywacyjna), która pomaga w składaniu się kompleksu transkrypcyjnego przy kasecie TATA. Stwierdzono jednocześnie, że transkrypcją mogą regulować białka wiążące się z określonymi sekwencjami DNA oddalonymi od kasety TATA nawet o kilka tysięcy par zasad.

Dzieje się tak, dlatego, że...

DNA jest cząteczką elastyczną, która może tworzyć pętle. Pamiętać należy, że białka regulatorowe, które wiążą się z DNA, musza charakteryzować się dużym powinowactwem do tej struktury. Najlepiej poznane są trzy motywy wystepujące w takich białkach.

Są to:
palec cynkowy
motyw helix zwrot helix

Suwak leucynowy

W niektórych aktywatorach znajduje się wielokrotny motyw palca cynkowego(czyli w aktywatorach mamy białka).

Palce cynkowe to pętle utworzone z fragmentów łańcucha polipeptydowego, które utrzymywane są przez jon cynkowy. Taka struktura umożliwia wciskania się białka w motyw podwójnej spirali DNA, w rowek tej spirali podwójnej DNA. Dzięki związaniu się takiego białka z palcami cynkowymi ze specyficzną parą zasad mozliwy jest kontakt czynnika transkrypcyjnego z genem docelowym.

Okazuje się, że u człowieka z palcami cynkowymi współdziała conajmniej 10% DNA(to jest bardzo dużo).

Wykazano, że niektóre białka regulatorowe wiążą sie nie bezpośrednio z DNA, ale z innymi białkami, wywołując efekt na ekspresję okreslonego genu.

Cechą charakterystyczną białek suwaka leucynowego, jest to, że zawierają one w co siódmej pozycji leucynę w obrębie 35 aminokwasów łańcucha polipeptydowego. Białka takie podobnie jak motyw helix-zwrot helix. Tworza dimer złożone z dwóch skręconych ze sobą łańcuchów o strukturze super helisy.

W przypadku helix-zwrto helix białka znajdują coś tam i łączą sekwencję.

Sekwencje suwaka leucynowego posiada jeszcze rejon zasadowy(około 30 aminokwasów), który służy(to na CZarno NA ZDJĘCIU), JAKO REJON wiążący się z DNA.

ZDJĘCIE KURWA!!!!

Pamiętać nalezy w odróżnieniu od procariota transkrypcja genów u eucariota przebiega rzy udziale 3 głównych polimeraz, które wymagają do zainicjowania swej funcji obecności różnych czynników białkowych.

Istotną rolę w regulacji genów u eucariota, pełnią hormony, które najczęściej syntetyzowane są w jednych komórkach, a funkcje swą pełnią w innych.

Hormony białkowe spełniaja swą funkcję w regulacji ekspresji genów przez swój wpływ na czynniki transkrypcyjne(nie bezpośrednio hormon wpływa na transkrypcję, ale na białka które będą regulować tranksrypcję). Hormony stereidowe posiadają łatwośc przenikania przez błony bilogiczne ze względu na swa budowę(są to substancję niskocząsteczkowe), po wniknięciu do jądra bądź cytoplazmy, mogą łączyć się z odpowiednimi recepturami, a w dalszych etapách z odpowiednimi sekwencjami DNA(i to są te sekwencje hre, odpowiedzi hormonalnej).

Hormony, których wktórnych przekaźnikiem jest cykliczny AMP hormony... i bialkowe, aktywują transkrypcję poprzez kinazę białkową A.
Kinaza jest fosfotransferazą, należy do drugiej kasy enzymów – transferaz i przenosi reszty ortofosforanowa z jednego związku na drugi(fosoryluje substráty za pomocą reszty PO4).

Promotory genów wrażliwych na tą kinazę posiadają element DNA, tzw. Element cre, który w odpowiedzi na wysokie stężenie cyklicznego AMP, wiąże się z odpowiednim białkiem aktywującym transkrypcję.


Wyszukiwarka

Podobne podstrony:
Biochemia wykład 04 2013r 3
Biochemia wykład 04 2013r
Biochemia wykład 04 2013r kopia
Biochemia wykład 04 2013r 5
Biochemia wykład 04 2013r kopia 2
Biochemia wykład 04 2013r
Biochemia wykład 04 2013r 4
Biochemia wykład 04 2013r 2
Biochemia wykład 05 2013r
Biochemia wykład 05 2013r 3
Biochemia wykład 05 2013r 2
hlp wyklady WYKŁAD HLP 04 2013r
hlp wyklady WYKŁAD HLP 04 2013r
hlp wyklady WYKŁAD HLP 04 2013r
Biochemia wykłady Wykład 10 2013r
Biochemia wykłady Wykład 10 2013r
Biochemia wykłady Wykład! 10 2013r
wykład 5 04 11 2013r
Wykład 04

więcej podobnych podstron