•komórka Procaryotae: cytoplazma otoczona błoną cytoplazmatyczną (spełnia podstawową rolę w pobieraniu substancji pokarmowych i wydalaniu produktów metabolizmu); od strony zewnętrznej komórka osłonięta ścianą komórkową (chroni wnętrze komórki przed uszkodzeniami), nukleoid (składa się z nici kwasu DNA, bierze udział w podziale komórki i przekazywaniu informacji genetycznej), rybosomy (odpowiadają za syntezę białek), mezosomy (udział w podziale komórki, rola centrów energetycznych)
•komórka Eucaryota: cytoplazma, ściana komórkowa, jądro, vacuola, chromosomy, plastydy (udział w procesie asymilacji CO2), retikulum endoplazmatyczne (łączy cytoplazmę z błoną jądrową, pośredniczy w transporcie substancji rozpuszczalnych w wodzie), aparaty Goldiego (uczestniczą w podziale komórki)
•organizmy żywe ze względu na ich zróżnicowaną budowę dzielimy na: Virales - wirusy; Procaryotae - bakterie, sinice; Eucaryotae - pozostałe organizmy roślinne oraz zwierzęta
•rośliny są z małymi wyjątkami organizmami autotroficznymi, zwierzęta heterotroficznymi
•wirusy są pasożytami nie mają zdolności do metabolizmu
•zwierzęta dzielą się na: Protozoa - jednokomórkowe i Metazoa - wielokomórkowe
•wirusy posiadają najmniejsze rozmiary żywych organizmów (kuliste średnica 10÷30nm, pręcikowate 10÷50∗300÷1800nm), są pasożytami bakterii, roślin i zwierząt
•bakterie mają rozmiary od dziesiętnych części do kilkunastu mikronów, rozróżniamy bakterie: kuliste, cylindryczne i spiralne
•glony są wodnymi roślinami jedno lub wielokomórkowymi należącymi do plechowców
Często do glonów zalicza się także Cyanophyta - sinice należace do Procaryotae. Są to organizmy jednokomórkowe tworzące kolonie, autotroficzne, zdolne do asymilacji (przyswajanie przez organizm żywy składników pokarmowych pobieranych z otoczenia i wykorzystanie ich w procesach wzrostu, rozmnażania lub regeneracji) dwutlenku węgla dzięki obecności w komórce różnych barwników asymilacyjnych: chlorofilu a, b i c, karotenów, fikocjanu. Zabarwienie niebiesko-zielone. Produktem fotosyntezy jest skrobia. Sinice rozmnażają się na ogół wegetatywnie w wyniku podziału komórek
•glony to organizmy jednokomórkowe lub występują w koloniach. Euglena pojedyncza komórka naga lub otoczona osłonką posiadająca wici, w chromatoforach tych glonów występuje chrolofil a i b, β-karoteni ksantofile. Rozmnażają się przez podział podłużny. Proces wegetatywnego rozmnażania odbywa się często za pomocą zoospor. Proces płciowy polega na kopulacji 2 gamet i wytworzeniu zygoty.
•grzyby przyjmuje się, że pochodzą od glonów jednak pozbawione są barwników asymilacyjnych, nie ma fotosyntezy. Odżywiają się heterotroficznie (cudzożywnie) podobnie jak większość bakterii i zwierząt. Ciało wieli grzybów otoczone jest ścianką zbudowaną z chityny lub celulozy, co odróżnia je od komórek zwierząt. Grzyby rozmnażają się bezpłciowo za pomocą zarodników wytwarzanych w różnego rodzaju zarodniach. Fotosynteza z dwutlenku węgla i wody przy dostępie światła powstaje glukoza i tlen: 6CO2+6H2O→C6H12O6+6O2.
•bakterie grupy coli
-są to ruchliwe pałeczki o wymiarach 0,5-3,0μ, Gram - ujemne, oksydazo - ujemne, nie przetrwalnikujące, względnie beztlenowe, fermentujące laktozę z wytworzeniem kwasu i gazu w temperaturze 37°C w zasadzie w ciągu 48 godzin i wykazujące charakterystyczny wzrost na podłożu Endo. Typ kałowy - Escherichia coli i typ ziemny - Aerobacter aerogenes.
•E. Coli
-świadczą o zanieczyszczeniu fekaliami, i dodatkowo może fermentować laktozę z wytworzeniem kwasu i gazu również w 44°C, wytwarza indol, daje pozytywną reakcje z czerwienią metylową (M), nie wytwarza acetylometylokarbinol (V), i nieposiada zdolności zużywania cytrynianu sodu jako jedynego źródła węgla (C).
•Clostridium perfringens
-są to nieruchliwe, beztlenowe laseczki Gram - dodatnie wytwarzające otoczki i wykazujące zdolność do fermentacji glukozy, laktozy, rozkładu żelatyny, a także tworzenia H2S.
•Proteus vulgaris
-występują w przewodzie pokarmowym człowieka i zwierząt; są to ruchliwe pałeczki gram-ujemne, nie wytwarzające przetrwalników i otoczek, posiadają zdolność fermentacji glukozy, maltozy i sacharozy, nie fermentują laktozy i mannitolu, z białek wytwarzają siarkowodór i indol
•paciorkowce i gronkowce hemolityczne
-gram-dodatnie, nie wytwarzają otoczek i zarodników, nieruchliwe; wykazują zdolność do wzrostu na podłożu z dodatkiem krwi i powodują rozkład krwinek (powstają strefy hemolizy), niektóre paciorkowce, tzw. niehemolizujące powodują zazielenienie pożywki z krwią wokół kolonii
Agar - jest to wielocukier otrzymywany z niektórych wodorostów morskich. Produkowany jest w postaci długich białawych włókien lub w postaci rozdrobnionej. Rozpuszcza się w wodzie w temp. 100°C, a krzepnie w temp. 40°C. Nie jest rozkładany przez mikroorganizmy nie stanowi więc składnika pokarmowego podłoża
•metoda powierzchniowa posiewu polega na równomiernym rozprowadzeniu materiału zaszczepiającego na powierzchnię zestalonej pożywki w płytce Petriego lub w probówce. Materiał zaszczepiający nanosi się na pożywkę jałową pipetą w ilości 0,1 cm3, rozprowadzając go po powierzchni podłoża jałową szklaną bagietką.
•metoda głębinowa posiewu, na dno jałowych płytek Petriego wlewa się pipetą 1 cm3 materiału zaszczepiającego i zalewa ostudzoną pożywką stałą. Pożywkę wylewa się z kolbek na płytki, wprost na posiany materiał. Wieczko płytki uchylone jak niejmniej. Rozprowadzamy poprzez równomierne wymieszanie.
•naturalne środowiska bytowania: woda i gleba; powietrze nie jest naturalnym środowiskiem życia
•rozwój uwarunkowany jest czynnikami abiotycznymi: temperatura, potencjał oksyredukcyjny, ilość tlenu i związków organicznych itp.
•2 rodzaje organizmów: mikroflora naturalna (te które naturalnie występują w danym środowisku) i organizmy alloktoniczne (pochodzą z zewnątrz)
Analiza bakteriologiczna wody
•choroby:
-bakterie: dur brzuszny, dur rzekomy, salmoneloza, czerwonka, cholera, tularemia, gorączka wodna, żółtaczka krwotoczna, gruźlica, wąglik
-wirusy: żółtaczka zakaźna, choroba Heinego-Medina
-grzyby: grzybice powierzchniowe, grzybice głębokie, choroby skóry, włosów, paznokci, zakażenia błon śluzowych, zapalenia narządów wewnętrznych
-pierwotniaki: stany zapalne przewodu pokarmowego (dwunastnicy, wątroby, dróg żółciowych), stany zapalne organów płciowych (rzęsistkownica)
-robaki (ich jaja): schorzenia przewodu pokarmowego (np. glista ludzka i owsik)
•2 cele analizy:
-ogólny: na podstawie obecności poszczególnych grup fizjologicznych bakterii w wodzie, oceniamy czy i czym jest ona zanieczyszczona i czy jest w stanie powrócić do pierwotnego stanu
-sanitarny: określenie czy dana woda nadaje się do spożycia i jakie jest ryzyko wywołania epidemii
•przyjęto wskaźniki, które:
-muszą występować w dużej ilości
-muszą być charakterystyczne dla danego zanieczyszczenia
-muszą być względnie łatwe do oznaczenia
-muszą być trwałe (muszą występować przez dłuższy czas niż bakterie chorobotwórcze)
•metoda fermentacyjna probówkowa (E.coli)
-badanie wstępne: posiew na podłoże laktozowe z purpurą bromokrezolową, 24-48h/37°C; grupy coli rozkładają laktozę co powoduje zmianę koloru z czerwonego na żółty; ponadto zmętnienie, gaz
-gdy brak jednej z cech lub wynik dodatni to badanie potwierdzające: test IMViC lub test szybki
•E.coli posiadają zdolność do wytwarzania indolu (I), dają pozytywną reakcję z czerwienią metylową (M), wytwarzają acetylometylokarbinol (V) i nie posiadają zdolności zużywania cytrynianu sodu jako jedynego źródła węgla (C)
•test szybki:
-materiał przesiewamy na podłoże płynne z zielenią brylantową oraz na wodę peptonową z tryptofanem do wykrywania indolu
-inkubujemy 24-48h/44°C
-po 24h obserwujemy wzrost: wynik dodatni na podłożu z zielenią brylantową to obecność gazu w rurce Durhama (przy lekkim wstrząsaniu)
-gdy wynik ujemny inkubujemy dalej 24h
-po 24h/44°C sprawdzamy wytworzenie indolu z tryptofanu; czyli do hodowli po ściance probówki dodajemy kilka kropel odczynnika Ehrilcha-Bohme'a; o obecności indolu świadczy pojawienie się czerwonego zabarwienia
•IMViC:
-materiał przeszczepia się na podłoże z zielenią brylantową; inkubuje się 18-48h/44°C
-materiał z dodatnich hodowli posiewa się metodą posiewu powierzchniowego na podłoże Endo i inkubuje 20h/44°C
-wyrosłe na tym podłożu pojedyncze typowe kolonie poddaje się identyfikacji wg szeregi IMViC
•coli: -badanie wstępne podobnie jak u E.coli + badanie potwierdzające:
-hodowle przesiewamy metodą posiewu powierzchniowego na podłoże agarowe Endo na 24h/37°C
-wynik dodatni: obecność typowych kolonii ciemnoczerwonych z metalicznym połyskiem (typowe kolonie)
-kolonie gładkie, o jasno lub ciemno różowym zabarwieniu, z ciemniejszym środkiem bez charakterystycznego połysku uznajemy za kolonie nietypowe; przeprowadzamy badanie uzupełniające:
-materiał przesiewamy na podłoże laktozowe ze wskaźnikiem Andrade oraz na powierzchnię skosu agarowego odżywczego; inkubujemy 24-48h/37°C
-zdolność fermentacji laktozy stwierdzić po 24 i 48h na podstawie zakwaszenia (różowe zabarwienie) oraz obecności gazu w podłożu laktozowym ze wskaźnikiem Andrade (brak zmian - wynik ujemny)
-natomiast po 24h na agarze odżywczym stwierdzić obecność ruchliwych pałeczek gram ujemnych, oksydazoujemnych
•metoda filtrów membranowych (coli)
-filtry gotuje się 2 razy w destylowanej wodzie po 20 minut
-wlać wodę do lejka, otworzyć kranik, przefiltrować próbkę
-zamknąć kran i wyjałowioną pincetą przenieść filtr membranowy na powierzchnię podłoża agarowego Endo FM (zawiera fuksynę)
-płytki Petriego z filtrami umieścić w cieplarce dnem ku górze; inkubujemy 20h/37°C (ewentualnie przedłużamy do 48h)
-następnie liczymy wyrosłe kolonie, tj. ciemnoczerwone z metalicznym połyskiem-połyskiem fuksynowym (ewentualnie badanie potwierdzające na podłożu laktozowym z purpurą bromokrezolową; w przypadku wyniku niepewnego-przesiać z powrotem na Endo i powtórzyć całą czynność)
E.coli:
-badanie wstępne podobnie jak u coli tyle, że inkubacja na podłożu agarowym Endo FM na 24h/44°C
-gdy brak typowych ciemnoczerwonych kolonii z metalicznym połyskiem, przeprowadzamy badanie potwierdzające:
-materiał wyizolowujemy na skos agarowy, a następnie wykonujemy barwienie preparatu metodą Grama, sprawdzamy zdolność wytwarzania oksydazy cytochromowej oraz fermentowania laktozy z wytworzeniem kwasu i gazu na pożywce ze wskaźnikiem Andrade lub na pożywce z zielenią brylantową (24h/44°C)
•+różne rozporządzenia ministrów:
-19.XI.2002r.: dotyczące jakości wody przeznaczonej do picia
-5 XI 1991 r.: w sprawie klasyfikacji wód oraz warunków, jakim powinny odpowiadać ścieki wprowadzane do wód lub do ziemi
-22.XI.2002.: w sprawie wymagań jakim powinny odpowiadać wody powierzchniowe, wykorzystywane do zaopatrywania ludności w wodę przeznaczoną do spożycia
Analiza bakteriologiczna gleby
•gleba to najlepsze środowisko do rozwoju; cały przekrój organizmów; w glebie mogą być wysokie temperatury; niebezpieczna dla człowieka bo organizmy chorobotwórcze długo przeżywają w glebie i doskonale się tam rozwijają
•choroby:
-bakterie: dur brzuszny, czerwonka, tężec, zgorzel gazowa, zatrucia pokarmowe, wąglik, gruźlica, promienica
-grzyby: schorzenia skóry i tkanek wewnętrznych
-pierwotniaki i robaki: choroby przewodu pokarmowego
•w procesie samooczyszczania gleby zmienia się stosunek pomiędzy poszczególnymi gatunkami bakterii grupy coli. W świeżo zanieczyszczonych glebach przeważa typ jelitowy a z czasem zaczyna dominować typ ziemny. Przy dawnym zanieczyszczeniu gleby wykrywa się spory Clostridium perfringens a nie ma na ogół bakterii coli
•metoda fermentacyjna probówkowa (Coli i E. Coli)
-etap I: posiew na podłoże Kesslera-Swenartona (różne systemy posiewów w zależności od rodzaju badanej gleby: piaszczysta czy ogrodowa)
-inkubacja 24h/37°C
-potem obserwujemy: gdy brak gazu i zmętnienia pozostawić w termostacie na kolejne 24 h; jeśli po 48h nic nie ma - wynik negatywny; gdy jest - przechodzimy do II etapu
-etap II: badanie potwierdzające: tak jak przy „wodzie”
-etap III: badanie uzupełniające
•oznaczenie Clostridium perfringens:
-posiew głębinowy na podłoże siarczynowo-żelazowe Wilson-Blaira; w celu wyeliminowania mikroflory niesporowej wkładamy do łaźni na 15 minut (80°C)
-hodowle inkubujemy 18-24h/37°C
-pojawienie się w ciągu pierwszych 18 godzin inkubacji w głębi agaru czarnych kolonii (często rozrywających podłoże na skutek wytwarzania gazu) świadczy o obecności Clostridium perfringens
-czarne zabarwienie powstaje w wyniku redukcji siarczynów do siarczku sodu (Na2S), który z chlorkiem żelaza tworzy czarno zabarwiony siarczek żelaza
Analiza bakteriologiczna powietrza
•mikroorganizmy chorobotwórcze dostają się do powietrza z cząstkami gleby, wody, odpadków miejskich, a także poprzez drogi oddechowe chorych ludzi i zwierząt, tworząc aerozole
•choroby:
-bakterie: gruźlica, błonica, płonica, zapalenie płuc, zapalenie gardła, nosa i niekiedy opon mózgowych
-gronkowce: schorzenia ropne skóry, narządów wewnętrznych, nieżyty błon śluzowych dróg oddechowych, zapalenie płuc, opon mózgowych, zatrucia pokarmowe
-wirusy: grypa, odra, ospa, różyczka, świnka
-grzyby: kryptokoroza skóry i narządów wewnętrznych, atakuję skórę i drogi oddechowe
-chorobotwórcze są też promieniowce, pierwotniaki i robaki
•u gronkowców do liczenia wybieramy tylko kolonie gronkowców chorobotwórczych otoczonych żółta strefą
•u promieniowców wybieramy typowe kolonie: okrągłe, płaskie lub wypukłe, matowe z białawym „aksamitnym” nalotem, „suche”, wykazujące zapach ziemny
•rozróżniamy 2 metody poboru próbek z powietrza: sedymentacyjną i zderzeniową:
•metoda sedymentacyjna
-polega na opadaniu z powietrza mikroorganizmów na podłoże stałe w określonym czasie (wady: wiatry źle wpływają, niektóre bakterie mogą nie opadać; zalety: najprostsza, najtańsza, są miejsca przy których nie da się pobrać próbki inaczej)
-ustawiamy płytki Petriego z odpowiednim podłożem na określony czas
•metoda zderzeniowa:
-polega na wychwytywaniu mikroorganizmów w wyniku działania siły uderzeniowej określonej objętości powietrza, skierowanej na powierzchnię podłoża (odkurzacze) - bakterie wbijają się w podłoże; nie może za szybko lecieć bo bakterie rozbijają się o podłoże, dlatego przepływ nie większy niż 180litrów/minutę, nie może być też za wolny; wskazany jest przepływ stabilny (nowoczesne metody-odkurzacze)
4
biologia - kolokwium 1