Prawdopodobieństwo zależy od wielkości próby (subpopulacji)
Jeśli zamiast 4 wybieramy 6 tarlaków, wtedy dla:
k=8 P= [12!/(12-12)!*12!] * 0,58* 0,50= 1/4096 = 0,0002
Czyli prawdopodobieństwo układów homozygotycznych AA byłoby znacznie mniejsze niż poprzednie, które wynosiło 1/256 czyli 0,0391, a tempo utrwalania allelu w postaci homozygotycznej byłoby wolniejsze.
Utrwalanie jest najwolniejsze jeśli początkowa frekwencja alleli jest równa tzn. p=q=0,5.
Zjawisko dryfu genetycznego odgrywa znaczącą rolę w wielu procesach biologicznych –
w procesie selekcji
w procesach ewolucyjnych (efekt „botlle neck” / wąskiego gardła/ szyjki od butelki)
Zróżnicowanie subpopulacji :
I
I SUBPOPULACJA pA=0,5 qa=0,5 2pq=0,50 |
II SUBPOPULACJA pA=0,5 qa=0,5 2pq=0,50 |
---|
Średnie 2pg = 0,50
Średnie pA=0,5
Fst=2pq=Średnie 2pq/2pq =0
Kiedy 1 i 3 populacja miały taką samą ilość alleli.
II
I SUBPOPULACJA pA=1 qa=0 2pq=0 |
II SUBPOPULACJA pA=0 qa=1 2pq=0 |
---|
Średnie 2pg=0
Średnie:
pA=0,5
qa=0,5
2pq=0,50
Fst=2pq-Średnie 2pq/2pq =1
Kiedy 1 i 2 populacja różnią się kompletnie.
Ht- średnia frekwencja alleli – średnia2pq=0,5
Hs-średnia 2pq=0
Fst=HT-Hs/HT
Służy jako pomiar genetycznego zróżnicowania pomiędzy dwiema subpopulacjami.
Wybierzmy z poprzedniego przykładu pierwsze 400 stawów i wyobraźmy sobie, że każda steka znajduje się w innej lokalizacji, czyli tworzy lokalną grupę.
Grupa | L. Stawów1 | PA | 2pq |
---|---|---|---|
I | 32 | 1 | 0 |
68 | 0,875 | 0,21875 | |
II | 8 | 0,875 | 0,21875 |
92 | 0,75 | 0,375 | |
III | 36 | 0,75 | 0,375 |
64 | 0,535 | 0,46875 | |
IV | 100 | 0,625 | 0,46875 |
HS=0,35375
Średnia frekwencja allelu A w kolejnych grupach:
Dla grupy I to będzie:
pA(I)=0,915
Zatem średnia frekwencja allelu a będzie równa:
qa(I)=0,085
Poziom heterozygotyczności w tej grupie wyznaczony na podstawie średniej frekwencji alleli będzie równy:
2pq=0,15555
Analogicznie wyznaczamy średnie frekwencji alleli i heterozygot dla pozostałych grup.
Następnie średnie frekwencji alleli i heterozygot dla całej populacji według tej samej zasady postępowania.
W Wyniku otrzymamy:
Nr gr | Grupa | Ogólna | |
---|---|---|---|
2pq | pA | 2pq | |
I | 0 | ||
0,21875 | 0,915 | 0,15555 | |
II | 0,21875 | ||
0,375 | 0,75 | 0,3648 | |
III | 0,375 | ||
0,46875 | 0,67 | 0,4422 | |
IV | 0,46875 | 0,625 | 0,46875 |
Śred. | HS=0,35375 | HR=0,357825 |
Najwyższy poziom heterozygotyczności istnieje na najwyższym piętrze hierarchii.
Indeks fiksacji (utrwalenia) Wrighta.
Forma oceny genetycznego zróżnicowania na poszczególnych piętrach hierarchii.
Indeks obejmujący subpopulacje i grupy będzie równy:
FST=HR-HS/HR
FST= 0,0114
Mierzy spadek heterozygotyczności między subpopulacjami w obrębie grup w porównaniu do heterozygotyczności między grupami.
Analogicznie:
FRT=HT-HR/HT
FRT=0,0642
Mierzy spadek heteropzygotyczności mniedzy grupamie subpopulacji w porównaniu do heterozygotyczności ogólnej
Jest większa zmienność między grupami (mierzona przez FRT) niż między subpopulacjami w obrebie grup (FSR)
Następnie:
FST=HT-HR/HT = 0,0749
Mierzy spadek heterozygotyczności między subpopulacji w porównaniu do heterozygotyczności ogólnej.
Prawdziwa jest własność:
1-FST=(1-FSR)-(1-FRT)
Jeżeli we wszystkich subpopulacjach byłaby taka sama frekwencja alleli, to byłby taki sam poziom heterozygotyczności, jeśli jest inny to znaczy, że występuje genetyczne zróżnicowanie między subpopulacjami lub grupami subpopulacji
Gdyby cała populacja była podzielona na identyczne grupy i subpopulacje, to wszystkie wyżej wymienione indeksy byłby równe 0
Interpretacja indeksu FST wg Wrighta
0-0,05 | Małe różnice w populacji |
---|---|
0,05-0,15 | Średnie różnice genetyczne |
-,15-0,25 | Duże różnice genetyczne |
Powyżej 0,025 | Bardzo duże różnicowanie |
Pomiar genetycznego dystansu.