Ćwiczenie I - Amfoteryczny charakter aminokwasów
TWÓJ BIOTECHNOLOG https://www.facebook.com/twoj.biotechnolog
1. Wstęp teoretyczny.
Doświadczenie 1 - Wyznaczanie punktu izoelektrycznego kazeiny
Punkt izoelektryczny- odpowiada takiej wartości pH, przy której sumaryczny ładunek cząsteczki jest równy zero. W punkcie izoelektrycznym białko lub aminokwas charakteryzuje się brakiem ruchu w polu elektrycznym. Wyznaczenie pI jest ważnym elementem opisu białka. Najbardziej precyzyjną metodą wyznaczania pI jest metoda izoelektroogniskowania. Jest to technika elektroforetyczna polegająca na rozdziale białek zgodnie z ich punktami izoelektrycznymi podczas wędrówki w polu elektrycznym w żelu. Żel został tak przygotowany, że posiada liniowy gradient pH.
Celem ćwiczenia jest wyznaczenie punktu izoelektrycznego kazeiny. Kazeina jest najważniejszym białkiem w mleku ssaków. Stanowi ona około 3/4 wszystkich białek zawartych w mleku.
Doświadczenie 2 - Krzywe miareczkowania aminokwasów
Aminokwasy mają charakter amfoteryczny. Wskazuje na to ich budowa- posiadanie grupy aminowej i karboksylowej. W roztworach aminokwasów panuje równowaga wystepowania wszystkich form jonowych aminokwasów. Wartość pH determinuje, których form będzie więcej, a których mniej w roztworze.
Celem ćwiczenia jest wyznaczenie krzywej miareczkowania kwasu asparaginowego. Trzeba zaznaczyć, że wartośc pH nie zmienia się proporcjonalnie wraz z dodawaniem roztworu miareczkującego. W pobliżu wartości pK obserwuje się mniejsze zmiany wartości pH. Spowodowane jest to właściwościami buforującymi roztworu aminokwasu.
Kwas asparaginowy jest aminokwasem o charakterze kwasowym. W skład jego cząsteczki wchodzą dwie grupy karboksylowe i grupa aminowa. To właśnie przewaga grup karboksylowych determinuje taki, a nie inny charakter aminokwasu.
Kwas asparaginowy
2. Materiały
Odczynniki:
- 1 M NaOH
- 1 M HCl
- wodny roztwór aminokwasu: 0,05 M kwas asparaginowy
- 1 M kwas octowy
- 0,1 M CH3COONa zawierający kazeinę w końcowym stężeniu 0,2%
- bufory wzorcowe do kalibracji pehametru o pH 4,01 ; 7,01 ; 9,18
Szkło i aparatura:
- probówki chemiczne na 20 ml i na 5 ml
- pipety automatyczne oraz tipsy
- pipety szklane
- cylinder miarowy
- zlewki o pojemności 50 ml
- mieszadło magnetyczne
- mieszadełka magnetyczne małe i duże
- pehametr laboratoryjny z elektrodą
3. Pomiary
Miareczkowania wody
ΣVHCl [ml] | pH |
---|---|
0 | 5,00 |
0,01 | 3,64 |
0,02 | 3,33 |
0,03 | 3,15 |
0,06 | 2,84 |
0,09 | 2,67 |
0,12 | 2,54 |
0,17 | 2,40 |
0,23 | 2,27 |
0,31 | 2,14 |
0,41 | 2,02 |
0,53 | 1,92 |
0,65 | 1,83 |
0,77 | 1,76 |
0,89 | 1,70 |
1,1 | 1,64 |
1,2 | 1,61 |
1,3 | 1,57 |
1,4 | 1,54 |
1,47 | 1,51 |
1,5 | 1,50 |
ΣVNaOH [ml] | pH |
0 | 6,29 |
0,01 | 10,30 |
0,02 | 10,64 |
0,03 | 10,82 |
0,04 | 10,97 |
0,09 | 11,30 |
0,14 | 11,50 |
0,25 | 11,73 |
0,35 | 11,88 |
0,45 | 11,97 |
0,65 | 12,04 |
Miareczkowania kwasu asparaginowego
pH | VHCl [ml] | VH2O [ml] | b-c | ntittranta/naa |
---|---|---|---|---|
a | b | c | d | e |
2,94 | 0 | 0 | 0 | 0 |
2,91 | 0,02 | 0,02 | 0 | 0,01 |
2,84 | 0,04 | 0,04 | 0 | 0,03 |
2,79 | 0,04 | 0,04 | 0 | 0,05 |
2,68 | 0,08 | 0,08 | 0 | 0,09 |
2,58 | 0,08 | 0,08 | 0 | 0,13 |
2,49 | 0,08 | 0,08 | 0 | 0,17 |
2,41 | 0,08 | 0,08 | 0 | 0,21 |
2,33 | 0,08 | 0,08 | 0 | 0,25 |
2,26 | 0,08 | 0,08 | 0 | 0,29 |
2,20 | 0,08 | 0,08 | 0 | 0,33 |
2,14 | 0,08 | 0,08 | 0 | 0,37 |
2,09 | 0,08 | 0,08 | 0 | 0,41 |
2,04 | 0,08 | 0,08 | 0 | 0,45 |
1,98 | 0,1 | 0,1 | 0 | 0,5 |
pH | VNaOH [ml] | VH2O [ml] | b-c | ntitranta/naa |
---|---|---|---|---|
b | a | c | d | e |
2,93 | 0 | 0 | 0 | 0 |
3,09 | 0,1 | 0,05 | 0,05 | 0,05 |
3,22 | 0,1 | 0,04 | 0,06 | 0,1 |
3,51 | 0,2 | 0,08 | 0,12 | 0,2 |
3,65 | 0,1 | 0,06 | 0,04 | 0,25 |
3,91 | 0,2 | 0,15 | 0,05 | 0,35 |
4,06 | 0,1 | 0,06 | 0,04 | 0,4 |
4,24 | 0,1 | 0,06 | 0,04 | 0,45 |
4,46 | 0,1 | 0,07 | 0,03 | 0,5 |
4,80 | 0,1 | 0,07 | 0,03 | 0,55 |
6,36 | 0,1 | 0,07 | 0,03 | 0,6 |
8,75 | 0,1 | 0,07 | 0,03 | 0,65 |
9,11 | 0,1 | 0,08 | 0,02 | 0,7 |
9,34 | 0,1 | 0,08 | 0,02 | 0,75 |
9,52 | 0,1 | 0,08 | 0,02 | 0,8 |
9,66 | 0,1 | 0,08 | 0,02 | 0,85 |
9,80 | 0,1 | 0,09 | 0,01 | 0,9 |
9,94 | 0,1 | 0,09 | 0,01 | 0,95 |
10,07 | 0,1 | 0,09 | 0,01 | 1,0 |
10,23 | 0,1 | 0,09 | 0,01 | 1,05 |
10,40 | 0,1 | 0,1 | 0 | 1,1 |
10,62 | 0,1 | 0,1 | 0 | 1,15 |
10,90 | 0,1 | 0,1 | 0 | 1,2 |
pK grup funkcyjnych
titrant: HCl ; aminokwas: asparaginian
ntitranta | naa | pH |
---|---|---|
0 | 0,05 | 2,94 |
0,0004997 | 0,04997 | 2,91 |
0,001498 | 0,04992 | 2,84 |
0,002494 | 0,04987 | 2,79 |
0,004480 | 0,04978 | 2,68 |
0,006458 | 0,04968 | 2,58 |
0,008428 | 0,04958 | 2,49 |
0,01039 | 0,04948 | 2,41 |
0,01235 | 0,04938 | 2,33 |
0,01429 | 0,04928 | 2,26 |
0,01623 | 0,04919 | 2,20 |
0,01816 | 004909 | 2,14 |
0,02009 | 0,04900 | 2,09 |
0,02200 | 0,04890 | 2,04 |
0,02439 | 0,04878 | 1,98 |
titrant: NaOH ; aminokwas: asparaginian
ntitranta | naa | pH |
---|---|---|
0 | 0,05 | 2,93 |
0,002494 | 0,04987 | 3,09 |
0,004975 | 0,04975 | 3,22 |
0,009901 | 0,04950 | 3,51 |
0,01235 | 0,04938 | 3,65 |
0,01720 | 0,04914 | 3,91 |
0,01961 | 0,04902 | 4,06 |
0,02200 | 0,04890 | 4,24 |
0,02429 | 0,04878 | 4,46 |
0,02676 | 0,04866 | 4,80 |
0,02913 | 0,04854 | 6,36 |
0,03148 | 0,04843 | 8,75 |
0,03382 | 0,04823 | 9,11 |
0,03614 | 0,04819 | 9,34 |
0,03846 | 0,04808 | 9,52 |
0,04077 | 0,04796 | 9,66 |
0,04306 | 0,04785 | 9,80 |
0,04535 | 0,04773 | 9,94 |
0,04762 | 0,04762 | 10,07 |
0,04988 | 0,04751 | 10,23 |
0,05213 | 0,04739 | 10,40 |
0,05437 | 0,04728 | 10,62 |
0,05660 | 0,04717 | 11,90 |
0,05882 | 0,04706 | 11,95 |
0,06103 | 0,04695 | 12,00 |
$$pK = pH - log\left( \frac{\left\lbrack \text{zasada} \right\rbrack\lbrack H^{+}\rbrack}{\lbrack kwas\rbrack} \right)$$
$$pK = 2,91 - log\left( \frac{0,04997}{0,0004997} \right) = 0,91$$
titrant: HCl ; pK dla asparaginianu titrant: NaOH ; pK dla asparaginianu
1,79 |
---|
2,22 |
2,81 |
3,05 |
3,45 |
3,66 |
3,89 |
4,16 |
4,54 |
6,14 |
8,56 |
8,95 |
9,21 |
9,42 |
9,59 |
9,75 |
9,92 |
10,07 |
10,25 |
10,44 |
10,68 |
10,98 |
11,31 |
11,56 |
11,75 |
11,88 |
11,98 |
12,08 |
12,14 |
12,20 |
0,91 |
---|
1,32 |
1,49 |
1,63 |
1,69 |
1,72 |
1,73 |
1,73 |
1,72 |
1,72 |
1,71 |
1,70 |
1,69 |
1,68 |
Obliczając pK grup funkcyjnych w aminokwasie wyliczam średnią wartość
pK1=1,72
pK2=9,93
pK3=3,79
Na podstawie obliczonych pK można wyznaczyć pI dla asparaginianu:
$$pI = \frac{pK_{1} + pK_{3}}{2} = \frac{1,72 + 3,79}{2} = 2,76$$
PB1= 1,22 - 2,22
PB2= 9,43 - 10,43
PB3= 3,29 - 4,29
pK | pK1 | pK2 | pK3 | pI |
---|---|---|---|---|
doświadczalne | 1,72 | 9,93 | 3,79 | 2,76 |
literaturowe | 2,0 | 10,0 | 3,9 | 2,95 |
Metoda wykorzystana do obliczenia wartości pK i pI aminokwasu sprawdza się co obrazują otrzymane wartości. Są one bardzo zbliżone do literaturowych, a delikatne różnice pomiędzy wynikami doświadczalnymi a literaturowymi można tłumaczyć niewielkim zanieczyszczeniem roztworów lub nie w pełni sucha elektrodą, która mogła przyczynić się do dodatkowego rozcieńczenia roztworów.
Badanie punktu izoelektrycznego kazeiny
2,53 | 2,73 | 2,87 | 3,03 | 3,22 | 3,39 | 3,54 | 3,70 | 3,72 | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
zmętnienie | - | - | + | ++ | +++ | ++ | + | - | - |
osad | - | - | + | ++ | ++ | + | + | - | - |
Na podstawie powyższej tabeli można uzyskać informacje na temat punktu izoelektrycznego kazeiny. Największe zmętnienie roztworu i wytracenie osadu zaobserwowani w próbce nr 5. pH roztworu tej próby wynosi 3,22 i ta wartość oznacza szukany pI. Jest to wartość znacznie niższa od literaturowej, która kształtuje się w przedziale 4,0-5,0. Zastosowana metoda jest zbyt ogólna i pozwala nam jedynie z pewną dokładnością wyznaczyć punkt izoelektryczny. Innym powodem odnotowania zbyt niskiej wartości może być zanieczyszczenie przygotowywanych roztworów lub zawiodła percepcja.