Wyróżniamy następujące rodzaje genów: - transpozony – „wędrujące geny” - geny modyfikatory – to geny, które wpływają na stopień przejawienia się innego genu - geny supresorowe – to dominujące geny znoszące działanie innych genów nieallelicznych - geny kumulatywne (wielokrotne) – to geny o niewielkich efektach indywidualnych, współdziałające ze sobą w wytworzeniu jednej cechy ilościowej - geny plejotropowe – to geny wpływające na więcej niż jedną cechę - geny podzielone – to geny, które zawierają odcinki niosące informację genetyczną (egzony) i odcinki pozbawione informacji (introny) - geny hipostatyczne – to geny, których działanie jest tłumione - geny epistatyczne – to geny, które hamują działanie genów z innej pary alleli - geny nakładające się – to geny, które wykorzystują tą samą sekwencję nukleotydów do kodowania różnych łańcuchów polipeptydowych (występują u wirusów) - geny regulatorowe – to geny, które kontrolują działanie genów struktury – włączają lub wyłączają ich aktywność - geny struktury – te geny kodują określone enzymy lub są niezbędne przy syntezie białka	- onkogeny – geny odpowiedzialne za powstanie raka - geny subletalne – to genu upośledzające - geny zmutowane - geny letalne – geny śmiercionośne - geny recesywne – to geny ujawniające się jedynie w stanie homozygotycznym - geny dominujące – to geny, które ujawniają się zarówno w stanie homozygotycznym, jak i heterozygotycznym.

Wybrane rodzaje genów

Kryterium podziału	Rodzaj genu	Definicja	Występowanie
			bakterie
Funkcja	strukturalny	gen, który koduje białka wchodzące wskład komórki (np. enzymy)	tak
	regulatorowy	gen, który kontroluje ekspresję innego genu	tak
	homeotyczny	gen, który kontroluje różnicowanie się komórek i rozwój zarodkowy	nie
Struktura	ciągły	gen zawierający jeden ciągły obszar kodujący	tak
	nieciągły (podzielony)	gen, który składa się z rozłącznych odcinków kodujących polipetyd (egzonów) przedzielonym odcin­kami niekodującymi (intronami)	nie^b
^a W zasadzie dotyczy tylko organizmów wielokomórkowych; ^b istnieją nieliczne wyjątki.