CHEMIA KOMÓRKI

Kolokwium II (2012/2013 sem. zimowy)

Grupa 1a: 1. Kinetyka Michaelisa-Menten.

2. 3-fosfoglicerynian jako prekursor aminokwasów. Omów biosyntezę aminokwasów tej rodziny.

3. Regulacja hormonalna biosyntezy i degradacji glikogenu.

Grupa 1b: 1. Klasyfikacja enzymów.

2. Degradacja aminokwasów, aminokwasy glutogenne i ketogenne.

3. Szlak pentozo-fosforanowy a zapotrzebowanie metaboliczne komórki.

Grupa 2a: 1.Inhibitory r.enzymatycznych i ich wpływ na kinetykę reakcji.

2. Oksydacyjna degradacja lipidów.

3. Synteza i degradacja nukleotydów purynowych.

Grupa 2b: 1.Mechanizmy kontroli reakcji enzymatycznych (procesów metabolicznych w komórce).

2.Jakich aminokwasów prekursorem jest alfa-ketoglutaran, podaj reakcje biosyntezy rodziny tych aminokwasów.

3.Glukoneogeneza.

Grupa 3a (najprawdopodobniej to):

1. Oksydacyjna degradacja kwasów tłuszczowych.

2. Biosynteza i degradacja zasad purynowych.

3. Inhibitory enzymatyczne.

Grupa 3 b:

1. Funkcja katalityczna enzymów.

2. Faza ciemna fotosyntezy.

3. synteza i degradacja aminokwasów aromatycznych lub alifatycznych (ale chyba tych pierwszych).

Poniżej wymienione pytania pojawiły się na egzaminie z chemii komórki w semestrze zimowym 2012/2013. Na naszym egzaminie było ok. 100 pytań do uzupełnienia. Egzamin był trudny, tak jak otwarcie zapowiadał to prowadzący wykład.

Akceptor CO2 w fazie ciemnej fotosyntezy, enzym tego procesu, produkt, co ulega redukcji i końcowy produkt.

Enzymy zużywają się/ nie zużywają się podczas reakcji.

Zdania do uzupełnienia dla enzymów prostych zależność stężenia substratu od prędkości reakcji jest... krzywa przedstawiająca to...

Grupa prostetyczna jest... związana z enzymem. Przykłady grup prostetycznych.

Klasy enzymów

Do jakich klas enzymów należą enzymy fazy ciemnej fotosyntezy? Dwie klasy wymienić.

Powiązanie biosyntezy hemu z cyklem Krebsa, jaki substrat (wydaje mi się, że chodziło tu o bursztynylo-CoA).

Beta oksydacja (nie pamiętam co dokładnie, ale dużo rzeczy z tego było), dużą uwagę zwracał na produkty i substraty np. iluwęglowe są.

Aminokwasy glukogenne i ketogenne, wymienić ketogenne.

Cykl mocznikowy tak ogólnie uzupełnić i coś o tym jak jest odtwarzany karbamoilofosforan.

Biosynteza nukleotydów (z rodzieleniem na puryny i pirymidyny, uwagę zwracał na prekursory tych biosyntez)

Szlak pentozofosforanowy prekursory i do jakich związków jest przekształcany rybozo-5-fosforan kiedy nie ma na niego zapotrzebowania.

Solenoid to...

Enzym będący markerem w błonie zewnętrznej mitochondrium- chodzi o oksydaza monoaminową?

Procesy zachodzące w jądrze komórkowym, chodziło chyba o replikację i translację.

Wirusy pasożytujące na bakteriach i roślinach jako materiał genetyczny mają...

Czym różnią się morfologicznie lizosomy i peroksysomy?

Trzy miejsca do których transportowane są białka z retikulum endoplazmatycznego.

Dwa rodzaje struktur II-rzędowych białek.

Współczynniki sedymentacji podjednostek rybosomów (jaki jest mały współczynnik sedymentacji ale nie pamiętam czy u eukariota cyz prokariota).

Kodon (aminokwas) startowy translacji, napisać.

Z ilu podjednostek składają się rybosomy? W jakim miejscu zachodzi translacja? (nie pamiętam dokładnie, ale coś z tym było)

Jakie odcinki zawiera pre-mRNA- eksony i introny.

Co ma mRNA na końcu 3'?

Między jakimi resztami i czym powstaje wiązanie O-glikozydowe i N-glikozydowe? Gdzie zachodzi N-glikozylacja i O-glikozylacja?

Regulacja hormonalna biosyntezy i degradacji glikogenu (pytał o hormony w zależności od stężenia glikogenu lub glukozy).

Prekursor histydyny w szlaku pentozofosforanowym; prekursor alaniny, waliny, leucyny; Kompartmentacja i przykład, Kinaza i fosfataza jako mechanizm regulacji przeciwstawnych procesów; Oddziaływania niekowalencyjne w białkach; Chlorofil ma w centrum…, Powiązanie szlaku pentozosforowanego z innymi szlakami; Prekursory szlaku pentozosforowanego, Jak u roślin magazynowany jest NH4+; Czynnik decydujący o powstaniu komórki

Narysować: glicynę, acetylo-CoA, kwas palmitynowy i purynę (1 grupa), alaninę, pirogronian, kwas szczawiooctowy i pirymidynę (2 grupa)

Jak zmienia się potencjał (maleje/rośnie) elektrochemiczny kolejnych przekaźników elektronów, w fotosyntezie i w łańcuchu oddechowym

W jakiej postaci przechowywany jest w organizmie NH4+

struktura II-rzędowa białek

"coś z kwasami tłuszczowymi które są przekształcane w... i przekazywane do mózgu"

"coś z wpływem insuliny na rozkład kwasów tłuszczowych"

1. Białka odpowiadające za przenoszenie materii między cysternami Aparetu Golgiego; 2. Reakcje zachodzące w mitochondrium.

reakcje w B-oksydacji, prekursor proliny, jedyna ligaza występująca w cyklu Krebsa, cukier 7-węglowy w regeneracji w f. ciemnej.

Enzym allosteryczny w glikolizie

prokariota dzielimy na ....i....

w sklad plazmolemmy wchodzi..

krzywa dla enzymow allosterycznych jest....

czynniki warunkujace regulacje krotkotrwala enzymow

desmozyna to.... wchodzi w sklad ....

inhibicja kompetycyjna i niekompetycyjna jak zmienia v max i km

wymienic aminokwasy alifatyczne nie posiadajace grup funkcyjnych

aminokwas zamiast gr aminowej ma iminowa to...

insulina stymukuje/hamuje synteze glikogenu

w glikogenie znajduja sie wiazania....i....

szereg uzupeknianek o n i o-gljkozylacji gdzie zachodzi do jakuch reszzt jest dolaczane i jaka grupa no do asp grupa GlcNAc itp

wyminic klasy enzymow 6klas

skad wielblad ma wode na pystyni

enzymy model zamka i klucza oraz indukcyjnego dopasowania

blona....mitochondrium tworzy..... ktore maja specyficzne enymy ...

sciana kom u grzybow zbudowana jest....

wymienic rodzaje rna i ktore znich ma wlasciwosvi katalityczne?

co jest ns koncu mrna 3,

co znaczy ze kod jest zdegenerowany

helikazy to....

ZDNA to..... wynikajacy z nagromadzenia.....

Boksydacja zachodzi w...

plastochinon przenosi elektrony

z...na....j ma w swoim centrum....

w centrum okstdazy cytochromowej jest...i....

ruchome przenosniki elektr. w lancuchu oddechowym to........

PS1 przekazuje elektrony na.....

regulacja dlugotrwała,

stała michalena menstena to

kodon startowy

co na koncu 5 mRNA

retrowirusy maja jako materiał genetyczny...

enzymy cyklu krebsa

wymien oksydoreduktazy

enzym przenoszacy grupe aminowa nalezy do grupy enzymow zwanych....

w cyklu krebsa fad przenosi elektorny przez enzym....

cos o replikacje semikonserwatywna

no wiadomo rysowac peptyd i te polaczenia

bialka budujace otoczke jadrowa to....

najwiecej w komorce jest dna rodzaju...

enzymy allosteryczne poflegaja 2 zjawiska.....i......

w inhibicji niekomepetecyjnej km.... a V max.....

plynnosc blony stabilizuje.....

cos o szlak pentozofosforanowy jakies prekursory

prekursory aminokwasow aromatycznych

co laczy sie z Nh4 + podczas degradacji aminokwasow.... i co z produktem

glukogenogeneza to przemiania ..... w .....

świetlna fotosynteza zachodzi w...

tRNA jest akceptorem

proces który zachodzi tylko a aparacie golgiego

proces który zaczyna się w reticulum i tam jest... potem przechdzi do...

allosteryczne enzymy działają na zasadzie...

cukier zapasowy u zwierząt (coś tam jeszcze o tym było zdanie dość długie)

element białkowy w jąderku ... odpowiedzialny jest za...

coś było o jądrze i rybosomach, że łączą .... i coś o ilości podjednostek

O glikolizacja do końca (...) coś tam .... i ... przyłącza ......

narysować wiązanie guanina cytozyna

narysować peptyd WINTERDAY (oznaczenia jednoliterowe)