tabela biochemia, biotechnologia UP Wrocław losowe pierdoły, Biochemia


Cecha

Prokariota

Eukariota

SYNTEZA DNA- REPLIKACJA

Zachowawczość

Semikonserwatywny

Semikonserwatywny

Enzymy

Polimeraza DNA I - wymaga udziału nukleotydotrifosforanów(dATP, dGTP, dCTP, dTTP), a także jonów Mg2+, DNA-matrycy oraz startera z wolną grupą OH, ma również funkcję kontrolną(koryguje błędy w zapisie zasad- usuwa błędny nukleotyd dzięki aktywności 3`->5`-egzonukleazy), może rozkładać łańcuch poli-d-nukleotydów(eliminacja startera RNA), wypełnia miejsce d-nukleotydami po rozłożonym starterze DNA

Polimeraza DNA II- pełni funkcje kontrolne i naprawcze

Polimeraza DNA III -właściwy enzym dla biosyntezy DNA, ma podobne właściwości co polimeraza I jednak nie wykazuje aktywności 5`-> 3`

Ligaza- spaja fragmenty nici opóźnionej (fragmentów Okazaki, złożonych z około 1000 nukleotydów)

Prymaza(polimeraza RNA)- katalizuje syntezę starterów niezbędnych do syntezy DNA

Helikaza DNA+ATP- rozplecenie DNA i zrywanie wiązań wodorowych

Topoizomeraza I- rozkłada wiązania fosfodiestrowe w jednej z nici DNA

Topoizomeraza II - przejściowo przecina jeden z potomnych łańcuchów DNA, tworząc szczelinę przez którą może wydostać się druga cząsteczka niewymagająca rozcięcia. Po rozdzieleniu spaja przecięte końce łańcucha.

Białka: DBP/SSB- przyłączają się do rozplecionego DNA aby zapobiec ponownemu tworzeniu się wiązań wodorowych

Nukleotydotransferazy: α β γ δ ε

polimeraza α i δ biorą udział w tej samej replikacji.

polimeraza β i ε są aktywne przy naprawię błędów lub uszkodzeń i działają na terenie jądra.

Polimeraza γ -bierze udział w syntezie DNA mitochondriów

polimeraza α- katalizowanie nici opóźnionej, połączona z polimeraza α

polimeraza δ- katalizowanie syntezy nici wiodącej

polimeraza β- podobnie jak polimeraza DNA I naprawia i usuwa błędy, dzięki aktywności egzonukleazowej.

Telomeraza- dobudowuje brakujący koniec 3` w syntezie nici opóźnionej, zawiera odcinek RNA, który służy jako matryca do syntezy brakującego odcinka DNA

Prymaza(polimeraza RNA)- katalizuje syntezę starterów niezbędnych do syntezy DNA, przyłączona do polimeraza α

Helikaza DNA+ATP- rozplecenie DNA i zrywanie wiązań wodorowych

Białka: DBP/SSB- przyłączają się do rozplecionego DNA aby zapobiec ponownemu tworzeniu się wiązań wodorowych

Miejsce rozpoczęcia replikacji

Ori( oczko replikacyjne)- następuje wstępne rozplecenie łańcucha DNA, widełki replikacyjne tworzą się w obu kierunkach, przy wykorzystaniu obu nici jaki matrycy,

Oczko replikacyjne- od którego w obie strony przemieszczają się widełki replikacyjne, a synteza DNA rozpoczyna się od momentu spotkania się sąsiadujących replikonów. Grupy replikonów tworzą jednostki replikacyjne, które podlegają wspólnej regulacji

Biosynteza RNA-traskrupcja

Enzym

Polimeraza RNA- katalizuje syntezę wszystkich rodzajów RNA, wykorzystując informację zawarte na jednej z nici dwuniciowej cząstki DNA. Jest to kompleksowy enzym zbudowany z pięciu podjednostek. Dwie z nich - α wiążą białka regulatorowe, podjednostka β przyłącza substraty reakcji, natomiast β' jest odpowiedzialna za wiązanie matrycy DNA. Razem tworzą one rdzeń enzymu, który przed syntezą łączy się z podjednostką σ odszukującą miejsce promotorowe na matrycy.

Difosfataza nieorganiczna- katalizuje rozpad difosforanu(produktu ubocznego przy przyłączaniu trifosfonukleotydów do wolnej grupy OH 3` ) d ) wytwarzając energię, która powoduje przesunięcie równowagi energii w kierunku syntezy.

Rybonukleaza- rozcina pre-rRNA i degraduje sekwencje łączące.

Polimeraza RNA mitochondrialna (i Ew. chloroplastowa).

Polimeraza RNA I (w jąderku)- odpowiada za syntezę rRNA 28S,18S i 5,8S. Do swojej aktywności wymaga Mg2+ oraz czynników transkrypcyjnych: UBF1 i UCF. Rozpoznaje promotory leżące w górę od miejsca startu transkrypcji.

Polimeraza RNA II (nukleoplazma)- odpowiada za syntezę mRNA i małych jądrowych snRNA uczestniczących w jego dojrzewaniu. Wymaga obecności Mg2+

Polimeraza III(nukleoplazma) - odpowiada za syntezę tRNA, 5SrRNA, oraz kilku frakcji regulacyjnych (np. snRNA i7S RNA, który jest skompleksowany z białkiem SRP rozpoznającym peptyd sygnałowy białka).Wymaga jonów Mn2+

Etapy

1)inicjacja- polimeraza RNA rozpoznaje miejsce przed genem przeznaczonym do replikacji(miejsce promotorowe) i rozplata wyznaczony region DNA w celu wyeksponowania zasad na nici, która ma służyć jako matryca. Promotor położony jest w sąsiedztwie części kodującej genu, a liczba transkryptów zależy od ilości cząsteczek polimerazy.

2)elongacja- rozpoczyna się po przyłączeniu polimerazy RNA i wyeliminowaniu podjednostki σ, jako pierwszy przyłączany jest 5`pppG, lub 5`pppA. Nukleotydy dobudowywane są w kierunki 5`->3` TTP zostaje zastąpiony UTP.

3)terminacja- zachodzi, gdy polimeraza RNA dojdzie do miejsca kończącego, zwanego terminatorem.. Polimeraza przesuwa się do sekwencji "terminatora", odłącza się od nici DNA. Rozpada się nietrwała hybryda DNA-RNA. Nici DNA odtwarzają strukturę spirali.

4*) dojrzewanie- dotyczy tylko tRNA i rRNA, ponieważ wytwarzane są one jako prekurosry. Pre-rRNA- jest kodowany przez gen zespolony i tworzy się jako nić zawierająca 4 frakcje uczestniczące następnie w budowie rybosomów. W czasie dojrzewania pre-rRNA zostaje pocięty przez rybonukleazę, a sekwencje łączące są degradowane.

1)miejscem startu transkrypcji regulowane jest przez promotory wewnętrzne -specjalnie sekwencje w obrębie odpowiedniego genu- (polimeraza III.) lub sekwencja na końcu 5` ( polimeraza I i II).

2) powstanie wielocząsteczkowego hnmRNA( jądrowy RNA) .- zawiera sekwencję nieinformacyjne i informacyjne.

3) odcięcie pierwotnego transkryptu przez RNA-zę, blokada końca 5` przez dołączenie „czapeczki” (7-metyloguanozyny)

4) składanie( splicing )- składanie informacyjnych części mRNA(eksonów) w pojedynczą cząsteczkę

5) transport mRNA przez pory błony jądrowej.



Wyszukiwarka

Podobne podstrony:
PYTANIA, biotechnologia UP Wrocław losowe pierdoły, Biochemia
Komis, biotechnologia UP Wrocław losowe pierdoły, Biochemia
biochemia egzaminy, biotechnologia UP Wrocław losowe pierdoły, Biochemia
Przenoszenie acetylo, biotechnologia UP Wrocław losowe pierdoły, Biochemia
Przenoszenie, biotechnologia UP Wrocław losowe pierdoły, Biochemia
3 koło biochemia, biotechnologia UP Wrocław losowe pierdoły, Biochemia
pytania na biochemie, biotechnologia UP Wrocław losowe pierdoły, Biochemia
biochemia pytania kolo 1, biotechnologia UP Wrocław losowe pierdoły, Biochemia, Biochemia
MIKROBIOLOGIA ZYWNOSCI KOLOKWIA, biotechnologia UP Wrocław losowe pierdoły, mikro żywności
M+ÂŹ (Biotechnol.) (1), biotechnologia UP Wrocław losowe pierdoły, mikro żywności
wyklad bio 5, biotechnologia UP Wrocław losowe pierdoły, Biologia komórki, Biologia komórki, ściągoi
II rok grupy[1]to (2), biotechnologia UP Wrocław losowe pierdoły, Analiza żywności, analiza
sciaga[1].biochema -tabela, Biochemia, Ściągi
Tabela 1, biochemia, mgr
sprawozdanie z miareczkowania, UP Wrocław, IŚ I SEM, Chemia
Chemiczne środki ochrony roślin, Ogrodnictwo UP Wrocław, semestr V, Ochrona roślin - środki ochrony
ochrona wlasnosci intelektualnej, Inżynieria Środowiska UP Wrocław I semestr, OWI
UP Wrocław lista zadan, Technologia Informacyjna semestr 1 oraz Informatyka i komputerowe wspomagan

więcej podobnych podstron