Wykład 11
Przemiany związków azotowych.
Azot w przyrodzie występuje w różnych postaciach, tj:
jako azot atmosferyczny N2 , czyli cząsteczka,
jako jon amonowy NH4+ ,
jako jon azotanowy NO3-,
w mniejszych ilościach jako azotan NO2-,
w formie azotu związków organicznych.
Azot atmosferyczny stanowi 78% składu powietrza, jednakże rośliny i zwierzęta nie mogą korzystać z tej formy azotu. Zdolność do wiązania N2 mają tylko mikroorganizmy i sinice. Ilość azotu wiązanego przez mikroorganizmy w skali całej kuli ziemskiej to 108 t. W skali roku stanowi to 60% azotu przyswajalnego. Wyładowania atmosferyczne i promieniowanie UV dostarcza kolejnych 15%, a pozostałe 25% jest efektem działania procesów przemysłowych.
Bakterie wiążące azot to:
bakterie symbiotyczne (ryzobium, azospiryllum),
bakterie wolnożyjące (azotobakter, klostrydium, klepsiella).
Redukcja azotu atmosferycznego do formy amonowej przeprowadzana jest przez kompleks nitrogenazy. Hydrogenaza zbudowana jest z 2 białek, tj: z reduktazy i nitrogenazy.
reduktaza - homodimer zawierający 1.....?..... żelazo-siarkowe i 2 miejsca wiązania ATP,
nitrogenaza - zbudowana jest z 2 podjednostek α i z 3 podjednostek typu β oraz zawieta tez kompleks żelazo-molibdenowy.
Transfer 1 elektronu od reduktazy do nitrogenazy zawsze wiąże się z hydrolizą z cząsteczką ATP. Donorem elektronów jest zredukowana ferodyksyna. Proces redukcji azotu jest bardzo kosztowny energetycznie.
Redukcja azotanów do jonów amonowych
Główną formą azotu dostępnego dla roślin jest forma azotanowa, w dalszej kolejności jony amonowe, azot związków organicznych. Azotany nie mogą być jednak bezpośrednio włączone do związków organicznych, muszą być redukowane do NH4+ , gdyż jedyna formą azotu nieorganicznego, która bezpośrednio może być włączona do związków organicznych jest forma amonowa.
Redukcja azotanów przebiega dwuetapowo:
1) redukcja azotanów do azotynów w reakcji katalizowanej przez reduktazę azotanową. Przebiega ona w cytoplazmie, a źródłem elektronów niezbędnych od redukcji azotanów jest cząsteczka NADP(H), reduktaza azotanowa jest dimerem, w którym każda z podjednostek zorganizowana jest w 3 domeny wyposażone w odpowiednie przenośniki elektronów tj: FAD, cytochrom B557, molibden.
Azotany w roślinach są prowadzone w formie 2 pul: puli metabolicznej zlokalizowanej w cytoplazmie i puli zapasowej w wakuoli. W miarę potrzeb rośliny następuje przemieszczenie się azotu z puli zapasowej do mtabolicznej.
2) przekształcenie azotynów w jon amonowy przy udziale reduktazy azotanowej. ta reakcja przebiega w chloroplastach lub w plastydach (w korzeniach). Donorem tej reakcji jest zredukowana ferodyksyna, a w tkankach niefotosyntezujący NADP(H).
Asymilacja jonów amonowych -
włączenie azotu nieorganicznego do związków organicznych
W wyniku tego procesu powstają tzw. aminokwasy pierwotne. Jony amonowe mogą być włączone w związki organiczne w postaci:
grupy aminowej - obecnych w aminokwasach
grupy amidowej
grupy karbomoilowej
Grupa aminowa powstaje z grupy NH4+ na drodze redukcyjnej aminacji 2-oksoglutaranu. Przykładem tego typu reakcji jest reakcja katalizowana przez dehydrogenazę glutaminianową, która wytwarza jako produkt reakcji kwas glutaminowy (kwas pierwotny), rzadziej w roślinach funkcjonują inne dehydrogenazy np.: alaninowa, asparaginianowa.
Podstawową drogą asymilacji azotu amonowego u roślin jest cykl GS/GOGAT, w który asymilowane jest ponad 90% azotu nieorganicznego, w cyklu tym funkcjonują 2 enzymy, gdzie pierwszy z nich włącza azot NH4+ w postaci grupy amidowej, wytwarzając glutaminę. W drugim etapie katalizowanym przez GOGAT (syntazę glutaminianową) azot amidowy z glutaminy przenoszony jest na 2-oksoglutaran w wyniku czego powstają 2 cząsteczki kwasu glutaminowego. Jedna z nich ponownie wchodzi w kolejny cykl, druga wykorzystywana jest do syntezy wielu związków, w tym pozostałych aminokwasów białkowych. Azot amonowy może być też włączony w postaci grupy karbomoilowej w reakcji katalizowanej przez syntetazę karbomilofosforanowej. Powstały karbomoilofosforan służy do syntezy aminokwasów, nukleotydów pirmytynowych i innych związków.
Wtórna synteza aminokwasów - transaminacja
Powstały aminokwas pierwotny - kwas glutaminowy jest dawcą grupy aminowej w procesach syntezy wielu innych aminokwasów białkowych. Odpowiedzialne są za to reakcje transaminacji. Odpowiednie transaminazy przenoszą grupę amonowa z glutaminianu na różne 2-oksokwasu, wytwarzając odpowiednie aminokwasy.
Katabolizm aminokwasów
W wyniku rozkładu białek (wymiany) powstaje wiele aminokwasów, które moga być wykorzystywane do syntezy lub też mogą wchodzić w przemiany kataboliczne. Przemianami tymi są reakcja deaminacji i dekarboksylacji.
Deaminacja - mogą być oksydacyjne lub nieoksydacyjne
> oksydacyjne - wymagają udziału koenzymów oksydoreduktaz (NAD+, FAD). Reakcje deaminacyjne oksydacyjne mogą być odwracalne lub nieodwracalne,
> nieoksydacyjne - przebiegają bez udziału tych koenzymów.