1. W celu przeprowadzenia trawienia enzymem restrykcyjnym XYZ do 14ml próbki zawierającej DNA dodano 2 ml odpowiedniego dla tego enzymu buforu 2 ml roztworu zawierającego enzym i 2 ml wody destylowanej tak przygotowana mieszanina reakcyjna pracowała na optymalnych parametrach i z dużą wydajnością substratową. Wiedząc, że optymalne dla enzymu XYZ stężenie NaCl wynosi 100mM można wywnioskować iż w buforze wyjściowym wartość stężenia tej soli wynosi:
a) 100mM
b) 1000mM
c) 50mM
d) 500mM
e) trudno powiedzieć bo za mało informacji
2. Które z podanych poniżej enzymów będą dawały produkty, które można poddać, bez dodatkowych zabiegów, radioaktywnemu znakowaniu przy pomocy [a 32P] - dATP i fragmentu Klenowa? W nawiasach podano sekwencje, dla uproszczenia tylko jednej z nici, rozpoznawanej przez odpowiednie enzymy, gwiazdka oznacza położenie trawionego wiązania fosfodiestrowego.
a) EcoRI (GA*ATTC)
b) PstI (CTGCA*G)
c) SmaI (CCC*GGG)
d) HpaII (C*CGG)
e) BglII ( A*GATCT)
3. Pojedyncza mieszanina reakcyjna stosowana w thermal cycle sequencing musi zawierać.
a) dNTP
b) trifosforany rybonukleozydów
c) 2',3'-didezokswyanalogi czterech nukleotydów
d) 2',3'-didezokswyanalog jednego z czterech nukleotydów
e) fragment Klenowa
4. PCR jest techniką, która może być użyta do:
a) bezpośredniego powielenia fragmentu RNA, jeżeli znamy sekwencje sąsiadujące z tym fragmentem
b) przygotowania sondy DNA do przeszukania biblioteki cDNA
c) bezpośredniej izolacji (powielenia) fragmentu genu prokariotycznego
d) przygotowania, która posłuży analizy polimorfizmu długości fragmentów restrykcyjnych (RFLP)
e) Przeprowadzenia wszystkich eksperymentów, wymienionych w punktach A), B), C) i D)
5. Jeden z etapów doświadczenia, którego celem jest nokaut mysiego genu, prowadzi do selekcji komórek macierzystych, które są:
a) oporne na działanie antybiotyku G418 i oporne na działanie związku chemicznego noszącego nazwę gancyklowir
b) wrażliwe na działanie antybiotyku G418 i oporne na działanie związku chemicznego noszącego nazwę gancyklowir
c) oporne na działanie antybiotyku G418 i wrażliwe na działanie związku chemicznego noszącego nazwę gancyklowir
d) homozygotyczne względem genu poddawanemu nokautowi
e) heterozygotyczne względem genu poddawanemu nokautowi
6. Która z podanych poniżej metod, używanych do funkcjonalnej inaktywacji genu, powodują zmianę jego sekwencji:
a) nokaut genu
b) interferencja RNA (ang.: RNAi, RNA interference)
c) nadekspresja produktu allelu dominującego negatywnego
d) nadekspresja produktu allelu recesywnego negatywnego
e) metoda wykorzystująca system rekombinacyjny LoxP-Cre
7. Które z podanych poniżej związków jest odpowiednim substratem do radioaktywnego oznakowania cDNA o końcach tępych, który zostanie wykorzystany do eksperymentu footprintingu:
a) dATP znakowany 32P w pozycji g
b) ATP znakowany w pozycji a
c) dGTP znakowany w pozycji a
d) [g 32P] - ATP
e) [a 32P] - dATP
8. Enzym restrykcyjny ClaI rozpoznaje sekwencje AT- CGAT i trawi wiązanie fosfodiestrowe pomiędzy resztami T i C. Enzym restrykcyjny TaqI rozpoznaje sekwencje T- CGA:
a) fragmenty powstałe po trawieniu enzymami są w części komplementarne
b) fragmenty powstałe po trawieniu enzymami są w całości komplementarne
c) ClaI i TaqI są izoschizomerami
d) dowolne fragmenty powstałe po trawieniu ClaI i TaqI mogą być ligowane i następnie trawione ClaI
e) dowolne fragmenty powstałe po trawieniu ClaI i TaqI mogą być ligowane i następnie trawione TaqI
9. Przedstawiony poniżej wektor może być używany zarówno w komórkach bakteryjnych jak i drożdżowych. Elementami, które są specyficzne dla komórek drożdżowych są:
a) ori
b) amp'
c) URA3
d) ARS
e) polilinker
10. Które z poniższych twierdzeń nie są prawdziwe:
a) uwolnienie zreplikowanych fagów l z komórki gospodarza prowadzi do jej lizy
b) fragmenty o długości nawet 53 kb mogą być wklonowane do wektora będącego pochodną faga l
c) zarówno cDNA jak i DNA genomowy mogą być klonowane w wektorach będących pochodnymi faga l
d) większość wektorów będących pochodnymi faga l zawiera geny konieczne dla integracji i wycięcia DNA faga l z chromosomu komórki bakteryjnej
e) większość wektorów będących pochodnymi faga l jest pozbawiona genów potrzebnych dla lizy komórki gospodarza