Opracowanie do kolosa


  1. Amfiboliczny charakter cyklu Krebsa: Amfiboliczny charakter: Oznacza to, że cykl Krebsa odgrywa rolę zarówno w procesach syntez, jak i w procesach rozkładu - bierze udział jednocześnie i w katabolizmie, i w anabolizmie ważnych dla organizmu związków.

Niektóre szlaki przemian kończą się na związku pośrednim cyklu Krebsa, inne się z nich wywodzą. Dotyczy to następujących szlaków przemian metabolicznych:

  1. Przemian glukozy - glukoneogeneza i glikoliza: Połącznie między cyklem kwasu cytrynowego a glukoneogenezą i glikolizą jest uwarunkowane istnieniem dwóch enzymów:

  • Przemian aminokwasów - transaminacji i deaminacji - transaminacje są to odwracalne reakcje katalizowane przez aminotransferazy, deaminacja polega na odłączeniu grupy aminowej aminokwasu. Cykl może więc służyć jako źródło szkieletów węglowych do syntezy aminokwasów. W wyniku działania transaminaz:

  • Aminokwasy po deaminacji lub transaminacji mogą również wspierać glukoneogenezę, po przemianie w szczawiooctan. Włączane są one na różnych etapach cyklu:

    1. Przemian kwasów tłuszczowych - biosynteza kwasów tłuszczowych zachodzi w cytozolu, acetylo-CoA, stanowiący główny jej substrat, powstaje w mitochondriach. Acetylo-CoA nie przechodzi przez błony mitochondrialne, może być jednak przetransportowany w formie cytrynianu, po przekształceniu w cyklu Krebsa i rozszczepiony z powrotem do acetylo-CoA w cytozolu przez liazę ATP:cytrynianową.

    1. Anaboliczne reakcje cyklu Krebsa: Reakcje anaboliczne są to takie reakcje, w których z prostszych związków - substratów, powstaje bardziej złożony produkt. W cyklu Krebsa mamy dwie takie reakcje:

      1. Reakcja katalizowana przez syntazę cytrynianową, w której ze szczawiooctanu, acetylo-CoA i wody powstaje kwas cytrynowy i uwalnia się CoA.

      2. Reakcja katalizowana przez syntetazę sukcynylo-CoA (tiokinaza bursztynianowa), w której z α-ketoglutaranu i CoA powstaje sukcynylo-CoA i CO­2, przy równoczesnej redukcji NAD+ do NADH + H+.

    1. Regulacja cyklu Krebsa: Cykl Krebsa jest przede wszystkim regulowany przez łańcuch oddechowy i fosforylację oksydacyjną aktywność cyklu jest bezpośrednio zależna od podaży utlenionych kofaktorów dehydrogenaz, czyli NAD+ i FAD. Ponieważ utlenianie tych kofaktorów jest sprzężone z fosforylacją, czynnikiem regulującym jest również pośrednio dostępność ADP i szybkość zużywania ATP (wszystko dotyczy środowiska tlenowego).

    Cykl może być również regulowany na poziomie aktywności poszczególnych enzymów, katalizujących głównie reakcje nieodwracalne:

      1. Kompleks dehydrogenazy pirogronianowej: aktywowany przez jony wapnia, hamowany przez produkty swojej reakcji, czyli acetylo-CoA i NADH + H+; występuje również regulacja kowalencyjna - kompleks może występować w dwóch postaciach - aktywnej nieufosforylowanej i nieaktywnej ufosforylowanej. Przyłączanie i odłączanie grupy fosforanowej jest prowadzone przez kinazę i fosfatazę; kinaza jest aktywowana przez wzrost stosunku acetylo-CoA/CoA-SH i NADH/NAD i hamowana przez wzrost ADP/ATP, który również aktywuje fosfatazę.

      2. Syntaza cytrynianowa: aktywowana przez jony wapnia, hamowana allosterycznie przez ATP, długołańcuchowe acylo-CoA

      3. NAD-zależna dehydrogenaza izocytrynianowa: aktywowana przez jony wapnia, ADP, hamowana allosterycznie przez ATP i NADH

      4. Kompleks dehydrogenazy α-ketoglutaranowej: aktywowana przez jony wapnia,

      5. Dehydrogenaza bursztynianowa: hamowana przez szczawiooctan, którego dostępność zależy od dehydrogenazy jabłczanowej - MDH, zależnej od poziomu energetycznego komórki.

    Do inhibitorów cyklu Krebsa zaliczamy: fluorooctan (hamuje przejście cytrynianu w cis-akonitan), arsenian (blok działania kompleksu dehydrogenazy α-ketoglutaranowej), malonian (hamuje dehydrogenazę bursztynianową).

    1. Reakcje anaplerotyczne cyklu Krebsa: Reakcje anaplerotyczne, czyli reakcje uzupełniające, cyklu Krebsa dostarczają intermediatów cyklu, zapewniając jego ciągłość metabolity pośrednie są wykorzystywane do biosyntezy różnych związków, np. bursztynylo-CoA do syntezy porfiryn, więc aby nie doszło do zatrzymania cyklu związki pośrednie muszą być uzupełniane w ramach reakcji anaplerotycznych. Należą one do dwóch grup:

      1. Reakcje pozwalające na asymilację endogennego dwutlenku węgla, katalizowane przez:

    Zaliczamy tu również szlak pozwalający włączyć produkty β-oksydacji kwasów nieparzystowęglowych (propionylo-CoA) do cyklu Krebsa. Proces wymaga jonów magnezu, ATP i witaminy B12.

      1. Przemiany aminokwasów:

    1. Punkty uchwytu leków w metabolizmie puryn:

      1. Ponieważ dwa atomy węgla - 2 i 8 w pierścieniu purynowym pochodzą z pochodnych tetrahydrofolianu (2 z N5-formylotetrahydrafolianu, 8 z N5,N10-metenylotetrahydrofolianu), leki przeciwfolianowe zahamują tworzenie się tych związków, a co za tym idzie - zahamują syntezę puryn.

      2. Analogi glutaminy uniemożliwiają zajście reakcji przeniesienia azoty z Gln na powstający nukleotyd purynowy. Azaseryna hamuje dostarczanie atomu azotu z glutaminy, który wystąpi w pozycji trzeciej pierścienia purynowego. Diazanorleucyna hamuje tworzenie wiązania N-glikozydowego i powstawanie 5-fosfo-β-D-rybozyloaminy. Kwas mykofenolowy hamuje tworzenie GMP przez amidację XMP.

      3. Kwas 6-merkaptopurynowy hamuje reakcje konwersji IMP do AMP i GMP - odłączanie fumaranu i utlenianie IMP.

    1. Wpływ ołowiu na syntezę porfiryn: Ołów, poprzez wiązanie się z grupami tiolowymi -SH, hamuje aktywność enzymów syntezy porfiryn, które zawierają taką grupę w swojej strukturze. Są to: dehydrogenaza ALA, dekarboksylaza uroporfirynogenowa i ferrochelataza. W wyniku działania Pb dochodzi do porfirii wtórnej - porfirii nabytej toksycznej prócz ołowiu może być ona wywołana również solami innych metali ciężkich, zażyciem gryzeofulwiny i sedormidu. Obraz kliniczny jest taki sam, jak w porfirii skórnej późnej, czyli występuje fotodermatoza, hepatomegalia, hipertrichoza (zwłaszcza na czole, przedramionach i w okolicy kostek) i nadmierna pigmentacja skóry wystawionej na działanie promieni słonecznych.

    1. Metabolizm pirymidyn: W odróżnieniu od puryn, produkty rozkładu pirymidyn - CO2, NH3, β-alanina i β-aminoizomaślan - są dobrze rozpuszczalne w wodzie.

      1. Rozkład cytozyny: Prz udziale tlenu cząsteczkowego, zachodzi przemiana cytozyny w uracyl, uwalniany jest amoniak. Następnie, pod wpływem NADH + H+, powstaje dihydrouracyl, który jest hydrolizowany do β-ureidopropionianu, a następnie do CO2, NH3 i β-alaniny (która również może być przekształcana do dwutlenku węgla i amoniaku).

      2. Rozkład tyminy: Tymina, pod wpływem NADH + H+, przechodzi w dihydrotyminę, dalej przy udziale wody, w β-ureidoizomaślan i dalej do CO2, NH3 i β-aminoizomaślanu.

    1. Schemat cyklu syntezy pirymidyn - enzymy, reakcje, regulacja, droga salvage i de novo:

      1. Przebieg cyklu - reakcje (droga de novo):