P4230917

w miarę posuwania się poi RN A utrzymywane jest rozdzielenie mci DNA w formie „ bąbla”przed poi RNA i za jej przejściem jest z powrotem zamykane. Obszar przesuwania się polimerazy o długości około 30pz jest zabezpieczony przed trawieniem nukleazy . Wewnątrz tego obszaru - „bąbla” jedna nić DNA służy jako wzorzec dla syntezy RNA. Miejsce katalityczne polimerazy ma miejsce dla przyłączenia substratu NTP i miejsce dla łączenia produktu w którym koniec 3’ rosnącego łańcucha RNA jest usytuowany. Pyrofosforan jest odłączony od NTP i zostaje utworzone połączenie fosfodiestrowe pomiędzy grupą 3 ’0H ostatniego nukleotydu w RNA. Przyłączenie magnezu w miejscu aktywnym enzymu pomaga w nukleofilności atakującej grupy 3'OH i stabilizuje ujemny ładunek opuszczającej gmpy pyrofosforanowej. Transkrypcja postępuje w kierunku 5’->3\ i polimeraza RNA przesuwa się wzdłuż wzorca DNA aż napotka kodony stop.