przewodnikPoPakiecieR5

102 pmcuRtry

Nie wszystkie urządzenia i protokoły są dostępne pod każdym systemem <jr racyjnym. Aby sprawdzić, czy konkretny protokół lub urządzenie graficzne jest < stępne możemy posłużyć się funkcją capabilities (base). Poniżej przykład jej i wołania

> capabilitiesO

jpeg	png	tcltk	XII http/ftp	sockets	libxral
TRUE	TRUE	TRUE	FALSE TRUE	TRUE	TRUE
fifo	cledit	iconv	NLS profmem
FALSE	TRUE	TRUE	TRUE FALSE

Tabela 2.11: Lista funkcji do operacji na źródłach danych (plikach, kolejkach i gni i połączeniach

file(base)	Do nawiązywania połączenia z plikami na lokalnych dyskach, wskazywanych poprzez adres URL lub jeden z dwóch przedefiniowanych połączeń stdin (interaktywne odczytywanie danych z konsoli) lub clipboard . (odczytywanie danych ze schowka systemowego).
url(base)	Do nawiązywania połączenia z plikami poprzez adres URL. Można korzystać z protokołów http: //, ftp: // oraz file://.
gzfile(base)	Do nawiązywania połączenia z plikami spakowanymi algorytmem gzip (tej funkcji można również użyć do plików niespakowanych).
bzfile(base)	Do nawiązywania połączenia z plikami spakowanymi algorytmem bzip2 (tej funkcji można również do plików niespakowanych).
unz(base)	Do nawiązywania połączenia (wyłącznie w trybie czytanie) z plikiem archiwum w formacie zip.
pipę(base)	Do nawiązywania połączenia (również z innymi pro-, gramami) poprzez mechanizm pipe’ów.
fifo(base)	Do nawiązywania połączenie poprzez kolejkę FIFO (Windows nie obsługuje kolejek FIFO).
socketConnection(base)	Do nawiązywania połączenie poprzez mechanizm gniazd.
seek(base) readLines(base)	Pozwala na zmianę aktualnej pozycji w połączeniu. ; Dzięki temu możemy wybiórczo odczytywać z dowol-nych wskazanych miejsc połączenia. Odczytuje do n (domyślnie n=-l czyli wszystkie) linie z połączenia (traktowanego jako plik tekstowy). Dodatkowymi argumentami można określić sposób kodo- 1 waiua znaków. Wynikiem tej funkcji jest wektor napisów. -
readBin(base)	Odczytuje do n (domyślnie n=-l czyli wszystkie) rekordów z połączenia.
writoLlnea(base)	Zapisuje do połączenia wskazany wektor napisów.
urlteBln(base)	Zapisuje do połączenia wskazany wektor rekordów.

Ol wiar ja wtjdria/ wyjścia (zapisywanie i odczytywanie danych)

%

2.3.4 Baza danych

Środowisko R przechowuje w pamięci wszystkie dane, na których operuje. To rozwiązanie świetnie się sprawdza, jeżeli zbiory na których operujemy nie są bardzo I duże. Jednak w pewnych zagadnieniach nie jesteśmy nawet w stanie wczytać do pamięci całego zbioru danych, nie mówiąc już o manipulowaniu tymi danymi. W tej sytuacji warto dane przechowywać w bazie danych a do pamięci wczytywać tylko te fragmenty, na których chcemy wykonać jakąś operację.

Nie ma co się tutaj rozwodzić nad zaletami baz danych (w szczególności będziemy mówić o relacyjnych bazach danych), ponieważ operując na dużych zbiorach danych (dużych, czyli ponad 10 milionów wierszy) nie mamy praktycznie wyboru i musimy z nich korzystać. Nawet dla zbiorów danych o średnich rozmiarach, korzystając z baz danych zyskujemy na możliwości łatwego współdzielenia danych z innymi aplikacja-nii/użytkownikami. Poniżej przedstawiamy dwa przykłady komunikacji R z bazami danych z wykorzystaniem pakietów RODBC i RMySCJL. Pierwszy z pakietów pozwala na łączenie się z różnymi bazami danych poprzez sterowniki ODBC, drugi pakiet jest dedykowany do korzystania z bazy danych MySQL.

> półleżenie ODBC musi być przygotowane w systemie ,library( "RODBC")

■ t jeżeli chcemy wybrać połączenie interaktywnie z GUI Wmdowsowego połączenie <- odbcDriverConnect("") k# Otwieramy połączenie z wskazaną bazą danych HySQL połączenie <- odbcConnectObaza”, uid="użytkownik" , case="tolower")

#    zobaczmy jakie są tabele w tej bazie danych, i odczytajmy dane z tabeli ■JŚi'";. tabelaA

śąlTables(połączenie)

sąlOuery(połączenie, "select ¹ from tabelaA") ćlose(połączenie)

Możemy też połączyć się z bazą danych, używając biblioteki RMySQL. library (RMySCJL)

*    Otwieramy połączenie z wskazaną bazą danych MySQl

połączenie <- dbConnect(MySQL(), user”"uzytkownik", dbnajne»“baza" , host"" 0-:' host", password¹“haslo")

ł# odczytajmy wszystkie wiersze z tabeli tabelaA ?apyt <- dbSendCJuery(połączenie, "SELECT « FROM tabelaA")

. dane <- f et ch (zapyt, n - -1)

Kxcel utn ogranie²! ma ksynM)! kolumn (| 256) i wi« to 65&al jftst ninprt

powainyii

zasto»ow4

ii' Używając funkcji odbcConnectAccess(RODBC) mona połączyć się z Accessową ■: bazą danych a używając funkcji odbcConnectExcel (RODBC) można na plikach Exce-^: la wykonywać operacje jak na bazie danych.

1

łączymy się ¹ bazą Access - library("RODBC")

ÓPpłacżenie <- odbcConnectAccessOplik.mdb", uid»"uzytkovnik")

2

■ A . .. operacje na danych