107885

Niektóre czynniki mutagenne nie modyfikują chemicznie zasad, ale są to np. interkalatory (pochodne o charakterze pierścieniowym, kancerogeny), które wchodzą pomiędzy zestakingowane pary zasad (staking interkalacyjny) i modyfikują strukturę DNA, co może spowodować niewłaściwe odczytanie informacji genetycznej.

Procesy wywołane promieniowaniem UV lub jonizującym

Dimeryzacja tyminy. Dwie pirymidyny sąsiadujące ze sobą na tej samej nici ulegają tej reakcji pod wpływem UV. Cząsteczka po zaabsorbowaniu kwantu promieniowania uzyskuje energię, następuje wzbudzenie elektronowe - elektron przechodzi z niższego poziomu energetycznego na wyższy (towarzyszą temu wzbudzenia oscylacyjne i rotacyjne). Taka wzbudzona cząsteczka ma inny typ reaktywności. Powstaje dimer, który zaburza strukturę DNA i może powodować przekłamania w odczytywaniu informacji genetycznej.

Systemy naprawy DNA

-    bezpośrednie przywrócenie nieuszkodzonego DNA w wyniku działania enzymów naprawczych. Uszkodzenie przez reakcję fotochemiczną lub chemiczną .

Np. rozcinanie dimeru T; enzymy fotoreakcyjne katalizują reakcję przecięcia połączeń między dwoma T. Enzymy fotoreakcyjne wiążą się z tym dimerem i pod wpływem promieniowania światła widzialnego (nie U V) rozcina wiązania pomiędzy dwoma T.

-    naprawa przez wycięcie

Też dla niekomplementamej pary zasad. Nie komplementarna zasada wycinana z nowosyntetyzowanej nici. Układ odróżnia starą nić od nowej, bo niektóre sekwencje na starej nici są metylowane. System naprawczy składa się z układu enzymatycznego, na który składa się m.in. endonukleaza specyficzna w stosunku do danego typu uszkodzenia, polimeraza, ligaza

Proteomika zajmuje się pełnym charakteryzowaniem protonów Inaczej: Genomika - nie do końca poprawnie.

Proteomika strukturalna - scharakteryzowanie struktur wszystkich białek kodowanych przez gonomy. U człowieka: ok. 300 tys białek kodowanych przez 30 tys genów.

Oprócz metod eksperymentalnych wymagane są rozwinięte metody bioinformatyczne (katalogowanie i łatwy dostęp)

Zespoły badawcze LSF (large skill facility) - badają struktury białek, powiązane z firmami farmaceutycznymi. Zespoły krystalografów, techników NMRowych i teoretyków zajmujących się modelowaniem.

Na podstawie analizowanych struktur można podać oddziaływania między białkami oraz mechanizmy zachodzenia reakcji biochemicznych i pewnych procesów.

W ramach opisanych struktur białkowych wybiera się tzw. tarcze - receptory podatne na określone środki farmakologiczne.

Projektowanie leków - bardzo wydajne w porównaniu do szukania metodą prób i błędów.

Białka - polimery liniowe; zasadniczo 20 aminokwasów, które mogą być modyfikowane (ostateczne ilość większa)

a-aminokwasy posiadają 2 grupy funkcyjne: karbosylową i aminową, które są połączone z węglem Ca.

Grupa aminowa jednego aminokwasu reaguje z grupą karboksylową drugiego, powstaje wiązanie peptydowe i tworzy się łańcuch.

Wolne aminokwasy: