Czynnik nie może być toksyczny dla komórek działają wyłącznie na ekspresję konkretnego genu. w naturze nie są składnikiem komórki.
Regulowane czynnikami fizycznymi (światło, temp)
Syntetyczne- we wspólny element połączone są naturalne konsensusowi sekwencje DNA, najbardziej konserwatywne regiony promotora Pro i Eucaryota np. TATA box (u roślin zastępowany przez AGGA box), CAAT box, GC box.
Dodatkowo:
Tkankowo-specyficzne- indukowane czynnikami egzo i endogennymi.
Zawierają elementy wzmacniające, osłabiające ekspresje genu w wybranych organach (np. owoce-E8 genu oksydazy ACC, nasiona-adh3).
Ogranowo- specyficzne (promotora Palatyny ulegający ekspresji w bulwach) lub działające w określonych fazach rozwojowych roślin (apg z Arabidopsis aktywizujący geny w stadium mikrospor). Terminator (np. sekwencja terminatorowa syntazy nopaliny), odp nie tylko za ukończenie transkrypcji, ale także za poliadenylację otrzymanego mRNA (ochrona ptzed degradacją).
Promotory konstytutywne- cechy, przykłady:
• Wysoki poziom produkcji białek w odniesieniu do wybranych komórek/tkanek
• Wysoki poziom ekspresji białek reporterowych lub markerowych, umożliwiają łatwą detekcję, selekcję genów/ komórek
• Wysoki poziom czynników tranaksrypcji (jedne z elementów systemu regulacji transkrypcji, ekspresji)
• Produkcja komponentów niezbędnych podczas wszystkich etapów różnicowania komórki. Dodatkowo:
Promotory genów z roślin jednoliściennych zwykle nie podnoszą ekspresji transgenów w roślinach dwuliściennych (np. promotor genu Adhl z kukurydzy nieaktywny w tkankach tytoniu).
Dodanie elementów wzmacniających powoduje jego aktywację.
Promotor genu dobrze działający w tkankach rodzimego gatunku może nie wykazywać aktywności lub niską w tkankach innego gatunku (potrzeba badań roślin transgenicznych różnych gatunków, także w różnych warunkach środowiska).
Transgeny nieaktywne w jednym genotypie roślinnym mogą być stabilne winnym środowisku genetycznym.
Roślinne promotory konstytutywne, uniwersalne- CaMV 35S, syntazy opinowej, Nos-syntazy nopaliny. Dla jednoliściennych- ubikwitynowy, Act-1 (rice acńn), Adh-1 (maize dehydrogenase alcohol).
Promotor CaMV 35S
Pochodzi z wirusa mozaiki kalafiora, odp za wytworzenie w genomie gospodarza transkryptu 35S. Fragmenty promotora ok. 800-1000pz w górę od msca transkrypcji są aktywne w komórkach jedno i dwuliściennych. Aktywność promotora nie zalezy od białek kodowanych przez genom CaM V, odpowiadają za nią czynniki transkiypcyjne gospodarza.
Złożony z licznych domen o odrębnych właściwościach.
Każda z subdomen istotna dla poziomu transkrypcji w innych elemnatch rośliny (koizenie, liście, łodygi) są specyficzne tkankowo.
Każda z subdomen funkcjonująca osobno aktywowała ekspresję transgenu znacznie słabiej. Mogą one oddziaływać na siebie- działanie synergistyczne.
Sekwencje consensus- charakterystyczne, konserwatywne elementy np. promotora ustalone na pods analizy porównawczej sek nukleotydowych tysiący genów licznych gatunków.
Indukcja wektora ekspresyjnego i efekt wywołany jego wprowadzeniem do komórki.