1.Jaka Kaspaza w szlaku mitochondrialnym
2. dlaczego chromosomy się skracają, czyli dlaczego są krótsze( jakoś tak)
z tematu "Podstawowe techniki biologii molekularnej i ich zastosowanie":
1. opisać technikę PCR
2. pytanie testowe o real time PCR
Podstawowe techniki
1. Opisać sekwencjonowanie metodą Sangera + zastosowanie.
2. Na czym polega multiplex PCR?
Apoptoza:
1. Limit Hayflicka
2. Pytanie testowe o czynnik hamujący przejście punktu restrykcyjnego G1/S (odpowiedzi: nieprawidłowe DNA, coś z kinazami CKD, brak dostatecznej syntezy białek do wrzeciona kariokinetycznego, czy coś w tym stylu)
Nowotwory:
-Wymieniony glejak wielopostaciowy, rak sutka, li fraumeni i połączyć z białkami, z którymi jest problem Rb, P53, BRCA1 coś w tym stylu
-O chromosom philadelphia- 3 zdania które fragmenty, których chromosomów, nazwa tego chromosomu, translokacja (wszystkie były dobrze)
-Choroba Burkitta - które chromosomy w translokacji
-Według teorii Voglesteina, scieżka rozwoju raka, wybrać poprawną
Na I części laboratorium
1. Opisać technikę PCR
2. Opisac technikę real time PCR, do czego służy
w drugiej grupie było o multiplex PCR i coś chyba jak się przeprowadza sekwencjonowanie, mieszaniny itp.
Z onkogenezy:
1. Mutacje w jakich chromosomach powodują chłoniaka Burkitta.
2. Wybrać poprawny tor mutacyjny wg Vogelsteina (rak jelita grubego) - jedyna trudność to zamieniona kolejność aktywacji Ki-RAS i utraty DCC.
I laborki
Wymienić składniki mieszaniny reakcyjnej PCR
Biotechnologia w medycynie.
oba pytania testowe. 1. mikroiniekcja do przedjądrzy- co otrzymujemy odp. organizmy transgeniczne
2. metoda ex vivo- wprowadzenie genu/białka, wewnątrz organizmu/poza organizmem- kombinacja tych możliwości odp. gen poza organizmem
Podstawowe techniki biologii molekularnej i ich zastosowanie
1. Opisz PCR
2. Przyporządkuj np. sonda - FISH itp.
Biotechnologia:
I grupa:
1.Jakie wektory powodują mutacje insercyjne: odp: retrowirusy. możliwości: retrowirusy, adenowirusy, plazmidy, liposomy
2.Połącz w pary:
odp.
mikroiniekcja - zwierzęta transgeniczne
szczepionki doustne - rośliny transgeniczne
enzymy restrykcyjne - wybiórcze trawienie DNA
klonowanie DNA - powielenie
II grupa:(nie wiem dokładnie, jakie były możliwości odpowiedzi, ale sens jest mniej więcej taki)
1.Jak wygląda terapia genowa w mukowiscydozie?
odp. wprowadzenie genu CFTR do genomu (chodzi o komplementację genomu prawidłowym genem)
2. Wprowadzenie jądra komórki somatycznej do oocytu to proces:
odp. klonowania ssaka (?) tu chodziło chyba o to, że cały organizm jest powielany, bo była chyba jeszcze odp: klonowanie genu i jakieś inne klonowanie
1. Jaką terapię można zastosować przy leczeniu mukowiscydozy?
Odpowiedzi różniły się tym, czy wprowadzamy gen czy produkt białkowy i dokąd (ja zaznaczyłam wprowadzenie genu CFTR do komórek budujących drogi oddechowe)
2. W jakim procesie wprowadza się DNA komórki somatycznej do niezapłodnionego oocytu?
klonowanie ssaka (to wybrałam), klonowanie DNA, klonowanie genu, rekombinacja (chyba DNA)
laborki cz. II
1. pytanie testowe o to, na czym polega sekwencyjny PCR - jakiej długości fragmenty DNA powstają w wyniku zastosowania tej metody
2. jakie metody (poza sekwencyjnym PCR) pozwalają na wykrycie mutacji punktowych, jeśli mutacja występuje w tym samym miejcu u wszystkich pacjentów?
koleżanka obok miała wymienic składniki potrzebne do wykonania PCR i opisac startery.
laborki cz. II
1. Jakie cechy muszą posiadać startery F i R używane w PCR?
2. Czym różni się PCR od sekwencjonowania cyklicznego?
było sporo grup, z tego co widziałam to w innych pytanie o nested PCR, testowe o sekwencjonowaniu (co powstaje w wyniku tego procesu)
Apoptoza i cykl komórkowy
1. Pomiędzy jakimi strukturami pośredniczy białko DD (w drugiej grupie FED)
Odp. prawidłowa w obu przypadkach z receptorami śmierci.
2. Opisz co to jest limit Hayflicka i czy dotyczy wszystkich komórek?
3.Skracanie telomerów jako jedna z teorii starzenia
Podstawowe techniki:
1. Opisz metodę sekwencjonowania Sangera.
2. testowe. Jaka metoda pozwala na ilościowe oznaczenie wirusa jakiegośtam. Możliwe odpowiedzi: real time PRC, RFLP,SSCP, sekwencjonowanie
molekularne mechanizmy śmierci kom i starzenia się
pytanie testowe która kaspaza bierze udział w mitochondrialnym szlaku apoptozy,
pytanie opisowe - jakie znaczenie ma białko FADD;
molekularne mechanizmy śmierci i starzenia:
1. pytanie testowe - do czego należy domena DED i z czym się łączy (prokaspaza 8 i fadd)
2. pytanie opisowe - teoria telomerazowa
Podstawowe techniki:
1) opisać zasadę hybrydyzacji
2) połączenie: (typu: przeciwciała - Western Blotting), sondy, sekwencjonowanie, enzymy restrykcyjne i jeszcze jedno, ale nie pamiętam
Podstawowe techniki:
1. opisać co to jest hybrydyzacja.
2. połączyć techniki z pojęciami (np. przeciwciała, Western-Blotting itp. - z giełdy)
Onkogeneza
1) Były podane choroby:
Rak piersi - gen BRCA 1 i BRCA 2
Zespół Li-Fraumeri - gen TP53
Zespół siatkówczaka - gen RB1
Rodzinna poliplowatość jelita grubego (Fap) - gen APC
Trzeba było napisać w jakim genie doszło do mutacji w przypadku tych chorób (odp. podane powyżej)
2) Co to jest tor mutatorowy
3) W innej grupie trzeba było dopasowywać też te choroby i geny, ale były one podane
4) Podaj przykłady chorób gdzie mutacja dotyczy genów supresorowych
I laborki:
1. Opisać etapy PCR.
2. Nested PCR i jego zastosowanie.
Onkogeneza
1)Opisać III stadium kancerogenezy;
2)Opisać rodzaje onkogenów;
Onkogeneza:
1. Opisac co sie dzieje w IV stadium karcenogenezy
2. Jaka funkcje pelnia geny supresorowe
Laborki I
1) co to jest i po co się używa RT-PCR
2) wymienić składniki potrzebne do przeprowadzenia reakcji PCR
dużo grup, pytań z innych dokładnie nie znam, coś o multiplex PCR, o nested PCR, wymienić startery (?)
molekularne mechanizmy śmierci kom i starzenia się:
pytanie testowe która kaspaza bierze udział w mitochondrialnym szlaku apoptozy (9)
opisowe: jakie białka regulują cykl komórkowy