Stwierdzenie obecności drobnoustrojów i ich identyfikacja w badanym materiale pobranym od zakażonego człowieka lub zwierzęcia lub też w próbce pobranej ze środowiska stanowi cel badania mikrobiologicznego.
Diagnostyka mikrobiologiczna to zespół postępowań przedlaboratoryjnych i laboratoryjnych, mających na celu identyfikację drobnoustrojów oraz oznaczenie ich lekowrażliwości.