3240962977

46

2.3 Composantes principales d’heritabilitć, Klei et al. (2008)

Motivation

Dans un organisme complexe tel que 1’etre humain, le nombre de caracteres est dans l’ordre de millions alors que le nombre de g&nes dans le genome humain est d’environ 20 000. Inśvitablement, il y a au moins un gene qui affecte plusieurs caracteres. Ce phenomene d’un gene (ou une mutation) qui affecte plusieurs caracteres est connu sous le nom de pleiotropie.

Une approche standard d’analyse d’association genetique consiste a tester 1’associa-tion entre chaque phenotype et chaque SNP. Cependant, cette approche penalise la puissance de detection des variantes genetiques a cause des tests multiples. Le defi consiste donc a identifier un nombre reduit de phenotypes capables d’expliquer le maximum de la variabilite genetique, limitant ainsi la problematique des tests multiples.

Dans ce contexte Klei et al. (2008) ont proposś de capturer 1’effet de la pleiotropie dans 1’approche des composantes principales de 1’heritabilitć de Ott et Rabinowitz (1999). Ceci est fait dans le cadre de 1’analyse d’association portee sur des sujets non apparentśs.

Pour chaque SNP, 1’approche PCH de Klei (Klei et al., 2008) reduit les phćnotypes a un seul caractere compose qui a une plus grandę heritabilite que toute autre com-binaison lineaire des phenotypes.

2.3.1 Methodologie de Papproche

Supposons que nous avons q phenotypes observes chacun sur n sujets non apparentes. Reprenons la matrice definie precedemment, Y_nxq. Le modele est defini pour chaque