1
WICZENIE
7
SDS-PAGE L
AEMMLI ELEKTROFOREZA
Wyci g z kart charakterystyki substancji niebezpiecznych
• Akrylamid/bisakrylamid – T
• Temed – C, F
• SDS – Xn
• APS – O, Xn
• EDTA – Xi
• Merkaptoetanol – T, N
Wylewanie eli
Odczynniki:
- AA: 30% akrylamid, 0.8% bisakrylamid
- bufor do elu rozdzielaj cego: 1 M Tris-HCl, pH 8,8
- bufor do elu zag szczaj cego: 1 M Tris-HCl, pH 6,8
- 20% siarczan dodecylu sodu (SDS)
- 1% SDS
- 10% nadsiarczan amonu (APS)
- N,N,N’,N’- tetrametyloetylenodiamina (Temed)
- bufor do próbek (2x st ony):
625
µl 1 M Tris-HCl pH 6.8
1000
µl glicerol
500
µl 2-merkaptoetanol
1000
µl 20 % SDS
3,78 mg EDTA
1675
µl H
2
O dejonizowana
- bufor do naczy elektrodowych 5 mM Tris, 384 mM glicyna, 0,1 % SDS, pH 8,3
- 0,02% bł kit bromofenolowy
- zestaw wysokomasowych białek wzorcowych do elektroforezy (HMW) zawieraj cy:
miozyna (205 kDa),
α-galaktozydaza (116 kDa), fosforylaza b (97,4 kDa), albumina
surowicy wołu (66 kDa), albumina jaja kurzego (45 kDa), anhydraza w glanowa (29 kDa)
W celu przygotowania 12 ml
8 % elu rozdzielaj cego odpipetowa :
• roztwór AA
3,20 ml
• 1 M Tris-HCl, pH 8,8
4,50 ml
• 20 % SDS
60
µl
• H
2
O dejonizowana
4,25 ml
2
po odgazowaniu na pompce wodnej doda :
• Temed
24
µl
• 10 % APS
60
µl
W celu przygotowania 4 ml
4,5 % elu zag szczaj cego odpipetowa :
• roztwór AA
0,60 ml
• 1 M Tris-HCl, pH 6,8
0,49 ml
• 20 % SDS
20
µl
• H
2
O dejonizowana
2,88 ml
po odgazowaniu na pompce wodnej
• Temed
4
µl
• 10 % APS
16
µl
Przygotowanie próbek
Oznaczy st enia białka w próbkach metod Bradforda. Z ka dej próbki odpipetowa po
15
µg białka do osobnych eppendorfów. Próbki zag ci do obj. 5 µl na wirówce pró niowej,
doda 5
µl 2x st onego buforu do próbek oraz 0,5 µl roztworu bł kitu bromofenolowego,
zwirowa i gotowa 5-10 min w temperaturze 100
°C. Do próbki zawieraj cej białka o znanej
masie cz steczkowej (zestaw białek wzorcowych do elektroforezy, 3
µl) doda 0,5 µl
roztworu bł kitu bromofenolowego, zwirowa i gotowa 1 min w temperaturze 100
°C. Po
gotowaniu wszystkie próbki zwirowa i nakłada do kolejnych studzienek elu za pomoc
ko cówek kapilarnych.
Warunki pr dowe: 60 V na wej cie próbki w el zag szczaj cy (ok. 20 min)
120 V na rozdział (ok. 100 min)
Elektroforez prowadzi do wyj cia bł kitu bromofenolowego z elu.
Barwienie elu po elektroforezie
el zanurzy w wybarwiaczu (10% kwas octowy, 25% metanol, 65% woda 3 x dest. 0,1%
CBBG-250) i pozostawi na 30 min na wytrz sarce kołyskowej. Nast pnie usun
wybarwiacz i el zala odbarwiaczem (10% kwas octowy, 25% metanol, 65% woda 3 x
dest.). Cało pozostawi na wytrz sarce, a do uzyskania bezbarwnego tła.
3
Opracowanie wyników
Oznaczanie wzgl dnych mas cz steczkowych białek:
- wykre li krzyw kalibracyjn zale no ci log m.cz. białek standardowych od współczynnika
R
f
tj. wzgl dnej ruchliwo ci elektroforetycznej wyznaczonej ze stosunku drogi przebytej
przez dane białko do drogi przebytej przez bł kit bromofenolowy.
- obliczy warto ci
R
f
dla białek badanych i z wykresu kalibracyjnego odczyta wzgl dne
masy cz steczkowe tych białek.
Literatura:
1. „Techniki bada fizjologicznych” (red. A. Lity ska, M.H. Lewandowski), str. 102 - 106
Białka standardowe:
M.cz. (kDa)
log M.cz.
R
f
miozyna
205
α
-galaktozydaza
116
fosforylaza b
97,4
albumina surowicy wołu
66
albumina jaja kurzego
45
anhydraza w glanowa
29
Białko badane:
1.
2.
3.
4.
5.
6.