DOCHODZENIE
DOCHODZENIE
EPIZOOTYCZNE
EPIZOOTYCZNE
I POBIERANIE
I POBIERANIE
MATERIAŁU DO
MATERIAŁU DO
BADAŃ
BADAŃ
LABORATORYJNYCH
LABORATORYJNYCH
Mateusz Leciejewski gr. 6A
Mateusz Leciejewski gr. 6A
Ustawa z dnia 7 stycznia
Ustawa z dnia 7 stycznia
2005 r.
2005 r.
o zmianie ustawy o ochronie zdrowia
o zmianie ustawy o ochronie zdrowia
zwierząt oraz zwalczaniu chorób
zwierząt oraz zwalczaniu chorób
zakaźnych zwierząt
zakaźnych zwierząt
(ustawa z dnia 11 marca 2004 r.)
(ustawa z dnia 11 marca 2004 r.)
Załącznik nr 2
Załącznik nr 2
Wykaz chorób zakaźnych zwierząt
Wykaz chorób zakaźnych zwierząt
podlegających obowiązkowi zwalczania.
podlegających obowiązkowi zwalczania.
1) pryszczyca (Foot and mouth disease - FMD);
2) pęcherzykowe zapalenie jamy ustnej (Vesicular stomatitis);
3) choroba pęcherzykowa świń (Swine vesicular disease - SVD);
4) księgosusz (Rinderpest);
5) pomór małych przeżuwaczy (Peste des petits ruminants - PPR);
6) zaraza płucna bydła (Contagious bovine pleuropneumonia - CBPP);
7) choroba guzowatej skóry bydła (Lumpy skin disease - LSD);
8) gorączka doliny Rift (Rift valley fever);
9) choroba niebieskiego języka (Bluetongue);
10) ospa owiec i ospa kóz (Sheep pox and goat pox);
11) afrykański pomór koni (African horse sickness);
12) afrykański pomór świń (African swine fever - ASF);
13) klasyczny pomór świń (Clasical swine fever - CSF, Hog
cholera);
14) wysoce zjadliwa grypa ptaków d. pomór drobiu (Highly pathogenic
avian influenza- HPAI d. Fowl plague);
15) rzekomy pomór drobiu (Newcastle disease - ND);
16) wścieklizna (Rabies);
17) wąglik (Anthrax);
18) gruźlica bydła (Bovine tuberculosis);
19) bruceloza u bydła, kóz, owiec i świń (B. abortus, B. melitensis, B. ovis, B.
suis);
20) enzootyczna białaczka bydła (Enzootic bovine leucosis - EBL);
21) gąbczasta encefalopatia bydła (Bovine spongiform encephalopathy - BSE);
22) zgnilec amerykański pszczół (American foulbrood);
23) trzęsawka owiec (Scrapie);
24) zakaźna martwica układu krwiotwórczego ryb łososiowatych (Infectious
haematopoietic necrosis - IHN);
25) zakaźna anemia łososi (Infectious salmon anaemia - ISA);
26) wirusowa posocznica krwotoczna (Viral haemorrhagic septicaemia - VHS);
27) krwotoczna choroba zwierzyny płowej (Epizootic haemorrhagic disease of
deer
- EHD);
28) Bonamioza;
29) martelioza.
Załącznik nr 3
Załącznik nr 3
Wykaz chorób zakaźnych zwierząt
Wykaz chorób zakaźnych zwierząt
podlegających obowiązkowi rejestracji.
podlegających obowiązkowi rejestracji.
1) paratuberkuloza (Paratuberculosis);
2) listerioza (Listeriosis);
3) toksoplazmoza (Toxoplasmosis);
4) tularemia (Tularaemia);
5) wirusowe zapalenia mózgu i rdzenia koni (Equine
encephalomyelitis);
6) nosacizna (Glanders);
7) niedokrwistość zakaźna koni (Equine infectious anaemia);
8) zakaźne zapalenie macicy u klaczy (Contagious equine metritis);
9) wirusowe zapalenie tętnic koni (Equine viral arteritis);
10) zaraza stadnicza (Dourine);
11) zakaźne zapalenie nosa i tchawicy/otręt bydła (Infectious bovine
rhinotracheitis/
infetious pustular vulvovaginitis IBR/IPV);
12) choroba mętwikowa bydła (Bovine genital campylobacterosis);
13) zaraza rzęsistkowa bydła (Trichomonosis);
14) gorączka Q (Q fever);
15) salmonelozy bydła i świń (Salmonellosis of cattle and pigs);
16) wirusowe zapalenie żołądka i jelit świń (Transmissible gastroenteritis -
TGE);
17) włośnica (Trichinellosis);
18) choroba Aujeszkyego u świń (Aujeszky's disease in pigs);
19) enterowirusowe zapalenie mózgu i rdzenia świń d. choroba cieszyńska i
talfańska
( Porcine enteroviral encephalomyelitis);
20) zakaźna bezmleczność u owiec i kóz (Contagious agalactia);
21) choroba maedi-visna (Maedi-visna disease);
22) gruczolakowatość płuc u owiec i kóz (Ovine pulmonary adenomatosis);
23) wirusowe zapalenia stawów i mózgu kóz (Caprine arthritis/encephalitis -
CAE);
24) serowaciejące zapalenie węzłów chłonnych (Caseus lymphadenitis - CLA);
25) salmonelozy drobiu (S. Gallinarum, S. Pullorum, S. Enteritidis, S.
Typhimurium,S. Arizonae) / Avian salmonellosis (S. Gallinarum, S.
Pullorum, S. Arizonae);
26) chlamydioza ptaków (Avian chlamydiosis);
27) zakaźne zapalenie torby Fabrycjusza (choroba Gumboro)
/Infectious bursal disease;
28) choroba Mareka (Marek's disease);
29) choroba Derzsy'ego (Derzsy's disease);
30) mykoplazmozy drobiu (Mycoplasma gallisepticum, M. synoviae, M.
meleagridis)
/ Avian mycoplasmosis (M. gallisepticum, M. synoviae, M.
meleagridis);
31) wirusowe zapalenie jelit u norek (Mink viral enteritis);
32) choroba Aleucka (Aleutian disease);
33) myksomatoza (Myxomatosis);
34) krwotoczna choroba królików ( Rabbit haemorrhagic disease );
35) wiosenna wiremia karpi (Spring viraemia of carp);
36) bakteryjna choroba nerek ryb łososiowatych (Renibacteriosis);
37) zgnilec europejski (European foulbrood);
38) waroza (Varroosis);
39) choroba roztoczowa (Acariosis of bees).
Obowiązki właściciela
Obowiązki właściciela
zwierzęcia chorego lub
zwierzęcia chorego lub
podejrzanego
podejrzanego
Art. 42.
Art. 42.
1. W przypadku podejrzenia wystąpienia
1. W przypadku podejrzenia wystąpienia
choroby zakaźnej zwierząt, a w szczególności
choroby zakaźnej zwierząt, a w szczególności
poronienia u bydła, świń, owiec i kóz,
poronienia u bydła, świń, owiec i kóz,
objawów neurologicznych u zwierząt,
objawów neurologicznych u zwierząt,
znacznej liczby nagłych padnięć, zmian o
znacznej liczby nagłych padnięć, zmian o
charakterze krost, pęcherzy, nadżerek lub
charakterze krost, pęcherzy, nadżerek lub
wybroczyn na skórze i błonach śluzowych
wybroczyn na skórze i błonach śluzowych
zwierząt kopytnych, oraz zwiększonego
zwierząt kopytnych, oraz zwiększonego
śnięcia ryb, skorupiaków lub mięczaków,
śnięcia ryb, skorupiaków lub mięczaków,
posiadacz zwierzęcia jest obowiązany do:
posiadacz zwierzęcia jest obowiązany do:
1) niezwłocznego zawiadomienia o tym
Organu Inspekcji Weterynaryjnej albo
najbliższego podmiotu świadczącego
usługi z zakresu medycyny
weterynaryjnej, albo wójta (burmistrza,
prezydenta miasta);
2) pozostawienia zwierząt w miejscu
ich przebywania i nie wprowadzania
tam innych zwierząt;
3) uniemożliwienia osobom postronnym
dostępu do pomieszczeń lub miejsc, w
których znajdują się zwierzęta podejrzane o
zakażenie lub chorobę, lub zwłoki zwierzęce;
4) wstrzymania się od wywożenia,
wynoszenia i zbywania produktów, w
szczególności mięsa, zwłok zwierzęcych,
środków żywienia zwierząt, wody, ściółki,
nawozów naturalnych w rozumieniu
przepisów o nawozach i nawożeniu i
innych przedmiotów znajdujących się w
miejscu, w którym wystąpiła choroba;
5) udostępnienia organom Inspekcji
5) udostępnienia organom Inspekcji
Weterynaryjnej zwierząt i zwłok
Weterynaryjnej zwierząt i zwłok
zwierzęcych do badań i zabiegów
zwierzęcych do badań i zabiegów
weterynaryjnych, a także udzielania
weterynaryjnych, a także udzielania
pomocy przy ich wykonywaniu;
pomocy przy ich wykonywaniu;
6) udzielania organom Inspekcji
6) udzielania organom Inspekcji
Weterynaryjnej oraz osobom
Weterynaryjnej oraz osobom
działającym w imieniu tych organów
działającym w imieniu tych organów
wyjaśnień i podawania informacji,
wyjaśnień i podawania informacji,
które mogą mieć znaczenie dla
które mogą mieć znaczenie dla
wykrycia choroby i źródeł zakażenia
wykrycia choroby i źródeł zakażenia
lub zapobiegania jej szerzeniu.
lub zapobiegania jej szerzeniu.
1a. Posiadacz zwierząt gospodarskich
1a. Posiadacz zwierząt gospodarskich
natychmiast informuje powiatowego
natychmiast informuje powiatowego
lekarza weterynarii o każdym
lekarza weterynarii o każdym
przypadku padnięcia bydła, owiec
przypadku padnięcia bydła, owiec
lub kóz.
lub kóz.
Dochodzenie epizootiologiczne
uwzględnia z jednej strony chorobę,
jej charakterystykę i metody
zapobiegania oraz zwalczania, z
drugiej strony –instytucje i osoby,
których udział w zwalczaniu chorób
zwierząt przewiduje obowiązujące
ustawodawstwo.
Cel dochodzenia
Cel dochodzenia
epizootiologicznego
epizootiologicznego
ust. 7 art. 42
ust. 7 art. 42
1)
1)
ustalenie okresu, w którym choroba zakaźna
ustalenie okresu, w którym choroba zakaźna
zwierząt mogła rozwijać się w gospodarstwie
zwierząt mogła rozwijać się w gospodarstwie
przed podejrzeniem lub stwierdzeniem jej
przed podejrzeniem lub stwierdzeniem jej
wystąpienia;
wystąpienia;
2)
2)
ustalenie źródła pochodzenia choroby zakaźnej
ustalenie źródła pochodzenia choroby zakaźnej
zwierząt wraz z ustaleniem innych gospodarstw,
zwierząt wraz z ustaleniem innych gospodarstw,
w których zwierzęta z gatunków wrażliwych
w których zwierzęta z gatunków wrażliwych
mogły zostać zakażone z tego źródła;
mogły zostać zakażone z tego źródła;
3)
3)
ustalenie dróg przemieszczania się wektorów:
ustalenie dróg przemieszczania się wektorów:
a) do gospodarstwa, w którym wystąpiło
a) do gospodarstwa, w którym wystąpiło
podejrzenie choroby zakaźnej zwierząt,
podejrzenie choroby zakaźnej zwierząt,
b) z gospodarstwa, w którym wystąpiło
b) z gospodarstwa, w którym wystąpiło
podejrzenie choroby zakaźnej
podejrzenie choroby zakaźnej
zwierząt.
zwierząt.
Elementy dochodzenia :
1. Wywiad epizootiologiczny;
2. Badania kliniczne zwierząt chorych;
3. Badanie anatomo- i
histiopatologiczne;
4. Badanie laboratoryjne.
1.Wywiad epizootiologiczny:
Wielkość populacji zwierząt, ich gatunek, wiek, płeć;
Liczba chorych zwierząt z podziałem na gatunki;
Szybkość rozprzestrzeniania się choroby;
Przebieg choroby i objawy;
Stan odporności populacji;
Sposób leczenia;
Ustalenie źródeł zakażenia i dróg szerzenia się;
Warunki żywienia, utrzymania i eksploatacji zwierząt;
Dane uzyskane z wywiadu należy skonfrontować z
innymi danymi, które uzyskano na podstawie
znajomości aktualnej sytuacji epidemiologicznej na
danym terenie oraz z sytuacją epidemiologiczną
poprzedzającą wystąpienie epidemii.
2. Badania kliniczne zwierząt
chorych
3. Badanie anatomo- i
histopatologiczne
4.Badanie laboratoryjne:
biologiczne
serologiczne
alergiczne
mikotoksykologiczne
toksykologiczne
mikrobiologiczne
Pobieranie materiału do
Pobieranie materiału do
badań laboratoryjnych
badań laboratoryjnych
Materiał pobierany przyżyciowo:
Materiał pobierany przyżyciowo:
1. Krew
1. Krew
Próby z antykoagulantem: heparyna,
Próby z antykoagulantem: heparyna,
cytrynian/ wersenian sodu, pozwala
cytrynian/ wersenian sodu, pozwala
na badanie morfologii i izolacje
na badanie morfologii i izolacje
komórek
komórek
Próby bez antykoagulantów –
Próby bez antykoagulantów –
surowica do badań serologicznych.
surowica do badań serologicznych.
2. Mleko
2. Mleko
Badania bakteriologiczne;
Badania bakteriologiczne;
Badania serologiczne.
Badania serologiczne.
3. Punkcje
3. Punkcje
Możemy pobrać:
Możemy pobrać:
Płyn mózgowo-rdzeniowy,
Płyn mózgowo-rdzeniowy,
Płyn wysiękowy, przesiekowy.
Płyn wysiękowy, przesiekowy.
4. Nasienie, mocz, kał
4. Nasienie, mocz, kał
Badania bakteriologiczne,
Badania bakteriologiczne,
Badania serologiczne,
Badania serologiczne,
Badania pasożytnicze,
Badania pasożytnicze,
Badania wirusologiczne.
Badania wirusologiczne.
5. Wydzieliny surowicze, śluzowe,
ropne
wymazy,
rozmazy,
zeskrobiny.
Materiał pobrany pośmiertnie:
małe zwierzęta- całe zwłoki lub narządy
duże zwierzęta- narządy zawsze pobrane w czasie sekcji
(wycinki, preparaty odciskowe ,wysięk)
do badań wirusologicznych- termos z lodem
do badań serologicznych- 10% formalina (kreda)
Inne materiały:
Pasza,
Ściółka,
Woda,
gryzonie, stawonogi, ptaki.
Próby do badań bakteriologicznych pobieramy w miarę
Próby do badań bakteriologicznych pobieramy w miarę
możliwości przed podaniem chemioterapeutyków – gdy
możliwości przed podaniem chemioterapeutyków – gdy
to niemożliwe do pisma przewodniego dołączamy opis
to niemożliwe do pisma przewodniego dołączamy opis
podjętych działań terapeutycznych.
podjętych działań terapeutycznych.
Należy zwrócić uwagę na sterylność przy pobieraniu
Należy zwrócić uwagę na sterylność przy pobieraniu
prób.
prób.
Sposób przesyłania materiału do
Sposób przesyłania materiału do
laboratorium
laboratorium
Opakowania:
Opakowania:
Probówki, ependorfy, strzykawki, pojemniki,
Probówki, ependorfy, strzykawki, pojemniki,
słoiki ,woreczki, płytki , szkiełko- suche ,
słoiki ,woreczki, płytki , szkiełko- suche ,
sterylne, oznakowane,
sterylne, oznakowane,
Materiał pobrany do badań wirusologicznych-
Materiał pobrany do badań wirusologicznych-
pobrany sterylnie, płyny z dodatkiem
pobrany sterylnie, płyny z dodatkiem
antybiotyków.
antybiotyków.
PISMO PRZEWODNIE
adres wysyłającego
adres właściciela
dane zwierzęcia
kierunek badania
dane z wywiadu
opis kliniczny i sekcyjny
METODY BEZPOŚREDNIEGO
METODY BEZPOŚREDNIEGO
WYKRYWANIA ZARAZKA
WYKRYWANIA ZARAZKA
BADANIE BAKTERIOLOGICZNE I
BADANIE BAKTERIOLOGICZNE I
MYKOLOGICZNE
MYKOLOGICZNE
BADANIE WIRUSOLOGICZNE
BADANIE WIRUSOLOGICZNE
BADANIE BIOLOGICZNO –
BADANIE BIOLOGICZNO –
MOLEKULARNE
MOLEKULARNE
BADANIE
BADANIE
BAKTERIOLOGICZNE I
BAKTERIOLOGICZNE I
MYKOLOGICZNE
MYKOLOGICZNE
Badanie mikroskopowe
Badanie mikroskopowe
- wykonanie rozmazu (ropa, tkanki, wykrztusiny)
- wykonanie rozmazu (ropa, tkanki, wykrztusiny)
- wymazu z odbytu, gardła, worka spojówkowego i
- wymazu z odbytu, gardła, worka spojówkowego i
innych błon śluzowych, skóry
innych błon śluzowych, skóry
- preparatu odciskowego z narządów
- preparatu odciskowego z narządów
wewnętrznych,
wewnętrznych,
- zawiesina (mleko, krew, mocz – wirowanie
- zawiesina (mleko, krew, mocz – wirowanie
materiału, badanie osadu)
materiału, badanie osadu)
- rozcieranie narządów wewnętrznych, tkanek,
- rozcieranie narządów wewnętrznych, tkanek,
całych zwierząt (pszczoły)
całych zwierząt (pszczoły)
utrwalenie (wysuszenie, ogrzanie, aceton);
utrwalenie (wysuszenie, ogrzanie, aceton);
cele
cele
utrwalenia: przytwierdzenie materiału
utrwalenia: przytwierdzenie materiału
(bakterii)do podłoża, zabicie żywych
(bakterii)do podłoża, zabicie żywych
komórek (materiał zakaźny), odsłonięcie
komórek (materiał zakaźny), odsłonięcie
aktywnych miejsc do barwienia na
aktywnych miejsc do barwienia na
komórkach bakterii
komórkach bakterii
-
barwienie metodą Gramma, Ziehl-
barwienie metodą Gramma, Ziehl-
Nielsena, Lofflera (metachrom.), Neissera
Nielsena, Lofflera (metachrom.), Neissera
(ziarenka), Fleminga (otoczki), Mellera
(ziarenka), Fleminga (otoczki), Mellera
Barwienie pozytywne
Barwienie pozytywne
: barwniki kwaśne (eozyna,
: barwniki kwaśne (eozyna,
kwaśna fuksyna), barwniki zasadowe (fiolet
kwaśna fuksyna), barwniki zasadowe (fiolet
krystaliczny, zieleń malachitowa, fuksyna
krystaliczny, zieleń malachitowa, fuksyna
zasadowa, błękit metylowy)
zasadowa, błękit metylowy)
Barwienie negatywne
Barwienie negatywne
: barwienie tła (rzęski, otoczki)
: barwienie tła (rzęski, otoczki)
Barwienie pozytywne przyżyciowe
Barwienie pozytywne przyżyciowe
: proste (jeden
: proste (jeden
barwnik np. błękit metylowy, czerwień obojętna),
barwnik np. błękit metylowy, czerwień obojętna),
złożone (więcej barwników stosowanych po kolei
złożone (więcej barwników stosowanych po kolei
lub w mieszaninie), metachromazja (jeden barwnik
lub w mieszaninie), metachromazja (jeden barwnik
– różne barwy komórek w preparacie np.
– różne barwy komórek w preparacie np.
Corynebacterium)
Corynebacterium)
Stosowanie bejcy
Stosowanie bejcy
(utrwalenie połączenia barwnika z
(utrwalenie połączenia barwnika z
komórką, mamy bejce proste i złożone)
komórką, mamy bejce proste i złożone)
Badanie hodowlane
Badanie hodowlane
Podłożami lub pożywkami nazywamy płynne (bulion,
Podłożami lub pożywkami nazywamy płynne (bulion,
mleko), półpłynne (bulion + agar) lub stałe
mleko), półpłynne (bulion + agar) lub stałe
(żelatynowe, agarowe, ścięta surowica, jajowe)
(żelatynowe, agarowe, ścięta surowica, jajowe)
mieszaniny różnych związków chemicznych, na
mieszaniny różnych związków chemicznych, na
których rozmnażają się bakterie lub grzyby
których rozmnażają się bakterie lub grzyby
Wyróżniamy podłoża:
Wyróżniamy podłoża:
ze względu na zawartość: syntetyczne,
ze względu na zawartość: syntetyczne,
półsyntetyczne, naturalne (surowica, płyny
półsyntetyczne, naturalne (surowica, płyny
ustrojowe
ustrojowe
ze względu na konsystencję: stałe, półpłynne, płynne
ze względu na konsystencję: stałe, półpłynne, płynne
ze względu na ilość i jakość składników odżywczych:
ze względu na ilość i jakość składników odżywczych:
proste lub podstawowe
proste lub podstawowe
– bulion zwykły, bulion odżywczy,
– bulion zwykły, bulion odżywczy,
agar odżywczy, żelatyna odżywcza;
agar odżywczy, żelatyna odżywcza;
wzbogacone
wzbogacone
– agar z krwią – bakterie hemolityczne,
– agar z krwią – bakterie hemolityczne,
agar cukrowy, agar drożdżowy dla Paenibacillus larvae,
agar cukrowy, agar drożdżowy dla Paenibacillus larvae,
surowica, żółtko;
surowica, żółtko;
wybiórczo – namnażające
wybiórczo – namnażające
– Mc Concey, Chapman,
– Mc Concey, Chapman,
Saburauda – zawierające składniki wzmagające (żółć)
Saburauda – zawierające składniki wzmagające (żółć)
lub hamujące wzrost bakterii (zieleń brylantowa),
lub hamujące wzrost bakterii (zieleń brylantowa),
Chapman (NaCl), Saburaud (aktidion lub
Chapman (NaCl), Saburaud (aktidion lub
chloramfenikol);
chloramfenikol);
wybiórczo – różnicujące z szeregiem cukrowym
wybiórczo – różnicujące z szeregiem cukrowym
(podłoże
(podłoże
odżywcze, substrat cukry, wskaźnik pH, gazy-CO2);
odżywcze, substrat cukry, wskaźnik pH, gazy-CO2);
specjalne
specjalne
– agar czekoladowy, Wrzoska
– agar czekoladowy, Wrzoska
BADANIE
BADANIE
WIRUSOLOGICZNE
WIRUSOLOGICZNE
Mikroskopia – mikroskop elektronowy lub
Mikroskopia – mikroskop elektronowy lub
skaningowy (rozpoznawanie kształtu:
skaningowy (rozpoznawanie kształtu:
kulisty, kubiczny, cylindryczny, cegiełkowy)
kulisty, kubiczny, cylindryczny, cegiełkowy)
Hodowlana – izolacja wirusa: zarodki
Hodowlana – izolacja wirusa: zarodki
kurze, pierwotne hodowle komórkowe,
kurze, pierwotne hodowle komórkowe,
ciągłe hodowle komórkowe CPE,
ciągłe hodowle komórkowe CPE,
diploidalne hodowle komórkowe – z płodów
diploidalne hodowle komórkowe – z płodów
do produkcji szczepionek, zawiesiny
do produkcji szczepionek, zawiesiny
komórek, hodowle narządowe
komórek, hodowle narządowe
Metody immunokoniugacyjne: IF
Metody immunokoniugacyjne: IF
bezpośrednia, test ELISA
bezpośrednia, test ELISA
Metody serologiczne
Metody serologiczne
Odczyn immunofluorescencji bezpośredniej
Odczyn immunofluorescencji bezpośredniej
( DIF )
( DIF )
odczyn pozwalający na wykazanie antygenu w
odczyn pozwalający na wykazanie antygenu w
badanym materiale
badanym materiale
na szkiełko z materiałem badanym nawarstwia
na szkiełko z materiałem badanym nawarstwia
się swoistą surowicę znakowaną fluoresceiną
się swoistą surowicę znakowaną fluoresceiną
Po inkubacji i odpłukaniu niezwiązanych
Po inkubacji i odpłukaniu niezwiązanych
przeciwciał jasno zielono-żółta fluorescencja
przeciwciał jasno zielono-żółta fluorescencja
wskazuje na obecność szukanego antygenu =
wskazuje na obecność szukanego antygenu =
wynik dodatni
wynik dodatni
Metody biologii
Metody biologii
molekularnej
molekularnej
Polimerazowa reakcja łańcuchowa
Polimerazowa reakcja łańcuchowa
( PCR )
( PCR )
- Test o wysokiej czułości, szybki i bardzo
- Test o wysokiej czułości, szybki i bardzo
specyficzny, opiera się na znajomości
specyficzny, opiera się na znajomości
sekwencji nukleotydów w wirusowym
sekwencji nukleotydów w wirusowym
DNA i RNA, bakterii i grzybów
DNA i RNA, bakterii i grzybów
- Do jego przeprowadzenia wymagana
- Do jego przeprowadzenia wymagana
jest jednoniciowa matryca DNA ,
jest jednoniciowa matryca DNA ,
startery ( primery )
startery ( primery )
polega na amplifikacji jednej kopii fragmentu
polega na amplifikacji jednej kopii fragmentu
DNA
DNA
Konserwatywne fragmenty matrycy są
Konserwatywne fragmenty matrycy są
miejscem przyłączenia primerów, które
miejscem przyłączenia primerów, które
uruchamiają polimeryzację
uruchamiają polimeryzację
Polimeryzację przeprowadza enzym
Polimeryzację przeprowadza enzym
polimeraza dosyntetyzowując fragment DNA
polimeraza dosyntetyzowując fragment DNA
pojedynczej nici z miksu nukleotydów w
pojedynczej nici z miksu nukleotydów w
środowisku bufora i obecności jonów magnezu
środowisku bufora i obecności jonów magnezu
Elektroforeza i wizualizacja w UV
Elektroforeza i wizualizacja w UV
Metoda ta jest stosowana do szybkiego
Metoda ta jest stosowana do szybkiego
wykrywania drobnoustrojów, których hodowla
wykrywania drobnoustrojów, których hodowla
in vitro jest trudna lub długotrwała, pozwala
in vitro jest trudna lub długotrwała, pozwala
na zidentyfikowanie czynnika etiologicznego
na zidentyfikowanie czynnika etiologicznego
choroby jeszcze przed pojawieniem się
choroby jeszcze przed pojawieniem się
swoistej odpowiedzi immunologicznej i
swoistej odpowiedzi immunologicznej i
stwierdzenia jej odczynami serologicznymi,
stwierdzenia jej odczynami serologicznymi,
umożliwia wykrycie materiału genetycznego
umożliwia wykrycie materiału genetycznego
zarazka w materiale biologicznym jak i w
zarazka w materiale biologicznym jak i w
czystych hodowlach, nawet wtedy gdy próbka
czystych hodowlach, nawet wtedy gdy próbka
jest bardzo mała lub w stanie rozkładu
jest bardzo mała lub w stanie rozkładu
PCR służy do wykrywania materiału
PCR służy do wykrywania materiału
genetycznego zarazków w narządach
genetycznego zarazków w narządach
wewnętrznych, skórze, krwi…
wewnętrznych, skórze, krwi…
RT PCR
RT PCR
Służy do wykrywania genomu RNA
Służy do wykrywania genomu RNA
wirusów
wirusów
Do uzyskania cDNA służącego jako
Do uzyskania cDNA służącego jako
matryca do właściwej reakcji PCR
matryca do właściwej reakcji PCR
polimeryzacja poprzedzona jest etapem
polimeryzacja poprzedzona jest etapem
odwrotnej transkrypcji
odwrotnej transkrypcji