background image

Obliczenia stężenia 

DNA i RNA w 

wyizolowanej próbie na 

podstawie pomiaru 

spektofotometrycznego

background image

Spektrofotometria, jest to technika 

pomiarowa polegająca na ilościowym 
pomiarze transmisji lub odbicia 
światła przez próbkę.

background image
background image

Po skończonej izolacji kwasów 

nukleinowych istotna jest wiedza 

o tym, jakie jest stężenie i 

czystość materiału przed 

wykonaniem jakichkolwiek badań.

background image

W pomiarach spektroskopowych zasadnicze znaczenie ma znajomość stężeń molowych kwasów

nukleinowych. Stężenie można otrzymać z pomiaru absorpcji przy długości fali

λ = 260 nm (maksymalna absorpcja promieniowania nadfioletowego przez DNA), jeżeli znamy 

molowy

współczynnik ekstynkcji ε

background image

Z poniższego wzoru obliczamy 
stężenie 

background image

Metody szczegółowych 

obliczeń

background image

Po kalibracji aparatury badanie

stężenia DNA w roztworze oznacza się przez pomiar absorpcji przy 

długości fali λ = 260 nm,

określanej często jako OD

background image

Następnie odczytuje się 

adsorpcję przy 280 i 320 nm 

lub tworzy się widmo w 

zakresie 200 – 350 nm.

background image

Idealny roztwór do pomiarów spektrofotometrycznych

DNA to bufor o niskim stężeniu jonów, np. bufor TE. 

background image

Długość  fali 

(nm)

substancje absorbujące

230

EDTA, polisacharydy, etanol

260

DNA, RNA

270

fenol

280

białka

320

drobiny komórkowe

background image

Widmo adsorpcji DNA w świetle UV

background image

 Jeżeli A

260

 równa się 1 to 

stężenie dwuniciowego

DNA (dsDNA) wynosi około 

50 µg/ml, natomiast 

jednoniciowego DNA 

(ssDNA) 33 µg/ml, RNA - 40 

µg/ml, a

oligonukleotydów 30 µg/ml. 

background image

Preparat DNA uznaje się za czysty 

jeżeli

A

260

/A

280

 wynosi 1,8-2,0. Kiedy próbka 

DNA jest zanieczyszczona RNA to 

wartość A

260

/A

280

 jest

bliższa 2,0 , natomiast w razie gdyby 

próbka zanieczyszczona była białkami 

to wartość A

260

/A

280

 jest niższa od

1,8.

background image

Obecnie większość laboratoriów 

dysponuje systemami typu 

NanoDrop (Thermo Scientific), 

które mierzą parametry w kropli 

<1,5μl i automatycznie przeliczają 

absorbancję na stężenie i czystość 

białkową oraz organiczną. 

Wyznaczają także wykres 

absorbancji, bardzo pomocny przy 

ustalaniu źródła 

zanieczyszczeń kwasów 

nukleinowych.

background image

Document Outline