P O D S T A W Y D Z I E D Z I C Z E N I A
Budowa i rola
3 kwasów nukleinowych CH
W roku 1869 w Budowa kwasu deoksyrybonukleinowego (DNA)
wyizolowano nieznaną
wczeĘniej substancj Struktura chemiczna
organiczną. Nazwano ją Kwasy nukleinowe są zwykle d"ugimi, nierozga"zionymi poli-
nukleiną, poniewaŻ jej merami. Ich podstawową jednostką budulcową jest nukleotyd.
ęród"em by"y W sk"ad nukleotydu DNA wchodzą:
jądra leukocytów " jedna z czterech organicznych zasad azotowych:
("ac. nucleus jądro). adenina (A), guanina (G), cytozyna (C), tymina (T),
Substancja ta okaza"a si " cukier piciowglowy deoksyryboza,
niejednorodna, jej sk"ad " reszta fosforanowa.
uda"o si ustali dopiero Poszczególne nukleotydy "ączą si ze sobą w ten sposób, Że
po wielu latach badał. reszta fosforanowa jednego nukleotydu tworzy wiązanie
W 1889 roku z cząsteczką cukru kolejnego tak powstaje d"uga cząstecz-
wyizolowano jej ka zbudowana z wielu nukleotydów, czyli "ałcuch polinu-
sk"adnik o charakterze kleotydowy.
kwasowym i nazwano go
NH2 O NH2
O
kwasem nukleinowym.
CH3 N N N
Na początku XX stulecia N HN HN
ustalono, Że
N N
O N O N N H2N N
w komórkach wystpują
H H
H H
dwie odmiany kwasów
cytozyna tymina adenina guanina
cytozyna tymina adenina guanina
(C) (T) (A) (G)
(C) (T) (A) (G)
nukleinowych: kwas
deoksyrybonukleinowy
Rys. 14. Zasady azotowe.
(DNA) i rybonukleinowy
WĘród zasad azotowych wyróŻnia si jednopierĘcieniowe zasady
(RNA).
pirymidynowe (cytozyna i tymina) oraz dwupierĘcieniowe zasady
purynowe (adenina i guanina).
5
HOCH2 O OH
4 1
H H
H H
3 2
OH H
Rys. 15. Deoksyryboza.
27
NH2
N
Rys. 16. Nukleozyd DNA deoksyadenozyna.
N
N Po"ączenie zasady azotowej z cząsteczką cukru nosi na-
N
zw nukleozydu. W zaleŻnoĘci od rodzaju zasady azoto-
HOCH2 O
wej, w cząsteczce DNA wyróŻnia si cztery typy deoksy-
nukleozydów. Są to: deoksyadenozyna, deoksyguanozyna,
H H
H H deoksycytydyna, deoksytymidyna.
OH H
Rys. 17. Reszta fosforanowa(V).
O
Reszty fosforanowe(V) nadają cząsteczkom kwasów nu-
O P O
kleinowych w"aĘciwoĘci kwasowe, a takŻe ujemny "adu-
nek elektryczny (kwasy odszczepiają kationy wodoru H+,
O
co sprawia, Że reszta kwasowa staje si anionem).
NH2
N
N
Rys. 18. Nukleotyd DNA fosforan(V) deoksyadenozyny.
N
O N
Nukleotyd powstaje przez przy"ączenie do nukleozydu
O P O CH2 O
reszty fosforanowej(V).
O
H H
H H
OH H
Budowa przestrzenna
Kompletny przestrzenny model budowy czą-
steczki DNA opracowali dopiero w latach
1951 1953 James Watson oraz Francis Crick
(fot. 6), za co w 1962 r. otrzymali Nagrod No-
bla. Skonstruowali oni model zgodny z danymi
uzyskanymi z analizy zdj rentgenowskich
DNA. Odkrycie struktury DNA pozwoli"o na
wyjaĘnienie jego znanych juŻ wówczas w"a-
ĘciwoĘci, m.in. zdolnoĘci do replikacji (samo-
powielania) i przenoszenia informacji gene-
tycznej.
Cząsteczka DNA sk"ada si z dwóch "ałcu-
chów polinukleotydowych (rys. 19 a) skrco-
nych Ęrubowo (helikalnie) wokó" wspólnej osi
Fot. 6. James Watson i Francis Crick.
(rys. 19 b). Struktura ta nosi nazw podwójnej
helisy i utrzymuje si dziki licznym wiązaniom wodorowym midzy zasadami azo-
towymi wchodzącymi w sk"ad obu "ałcuchów. Cząsteczki deoksyrybozy oraz reszty
28
fosforanowe(V) tworzą zewntrzną stron helisy, a zasady azotowe są skierowane do
jej wntrza. Budowa zasad, podobnie jak ich wzajemne u"oŻenie, sprzyjają tworze-
niu si wiązał wodorowych wy"ącznie midzy odpowiednimi, tzn. komplementarny-
mi zasadami azotowymi (A i T oraz C i G), przy czym:
" midzy adeniną a tyminą powstają dwa wiązania wodorowe,
" midzy cytozyną a guaniną powstają trzy wiązania wodorowe.
Z komplementarnoĘci zasad A i T oraz C i G wynika, Że stosunek molowy adeniny do
tyminy oraz cytozyny do guaniny w DNA dowolnego pochodzenia wynosi zawsze
1: 1 (regu"a Chargaffa). Ten wysoce swoisty sposób "ączenia si zasad azotowych
sprawia, Że oba "ałcuchy polinukleotydowe DNA są wzajemnie komplementarne,
tzn. pasują do siebie jak klucz do zamka.
3
a b 3 5
5
P T A P
P C G P
A T
G C 3,4 nm
P A T P
T A
C G
P C G P
P G C P
reszta fosforanowa(V)
P
P G C P zasada azotowa
5
deoksyryboza
3 5
3
Rys. 19. Budowa cząsteczki DNA: a sposób po"ączenia "ałcuchów polinukleotydowych,
b podwójna helisa.
Orientacja komplementarnych "ałcuchów DNA
Kołce "ałcucha polinukleotydowego nie są jednakowe. Na jednym z nich, w pozycji 5
(tzn. przy piątym atomie wgla deoksyrybozy), znajduje si reszta fosforanowa, natomiast
na drugim, w pozycji 3 (tzn. przy trzecim atomie wgla deoksyrybozy), wystpuje grupa
hydroksylowa OH. Cecha ta sta"a si podstawą do rozróŻniania obu kołców kaŻdego
"ałcucha DNA i nazwania ich odpowiednio kołcem 5 i kołcem 3 (rys. 20). Opisana
orientacja (polarnoĘ) "ałcucha polinukleotydowego wynika ze specyfiki tworzenia wią-
zał midzy kolejnymi nukleotydami, a w"aĘciwie midzy naleŻącymi do nich resztami
fosforanowymi(V) i cząsteczkami cukru. Fosforan(V) przy wglu 5 deoksyrybozy jedne-
go nukleotydu "ączy si jednoczeĘnie z deoksyrybozą nastpnego nukleotydu przy jej
wglu 3 itd. W rezultacie grupy hydroksylowe leŻące przy wglach 5 i 3 cząsteczki
29
NH2
N
O
O N
5
koniec 5 O P O CH2 O
O
H H
H 3 H
O
H CH3
HN
O
O P O O N
5
O CH2 O
H H
H 3 H
NH2
H
N
Reszta fosforanowa
O
"ączy grup
3 hydroksylową
O P O O N
jednej deoksyrybozy
5
z grupą 5 hydroksylową
O CH2 O
sąsiedniej
H H
H 3 H
koniec 3 OH H
Rys. 20. Fragment pojedynczego "ałcucha polinukleotydowego DNA.
kaŻdej deoksyrybozy zostają wykorzystane do wytworzenia wiązania z resztą fosforano-
wą(V) naleŻącą do tego samego oraz sąsiedniego nukleotydu.
W cząsteczce DNA naprzeciw kołca 3 jednego "ałcucha podwójnej helisy leŻy ko-
niec 5 komplementarnego "ałcucha polinukleotydowego, dlatego okreĘla si je jako
przeciwnie zorientowane (przeciwbieŻne) p. rys. 19.
w DNA noĘnikiem informacji genetycznej
DNA zawiera informacj genetyczną, czyli swoisty zapis okreĘlający struktur zakodowa-
nych bia"ek, a wic liczb, rodzaj oraz kolejnoĘ aminokwasów wchodzących w ich sk"ad.
KolejnoĘ (sekwencja) nukleotydów w DNA decyduje o kolejnoĘci ami-
c
nokwasów w "ałcuchu bia"ka.
Trudno sobie wyobrazi, w jaki sposób sekwencja zaledwie czterech róŻnych typów
nukleotydów moŻe by noĘnikiem informacji, ale nawet tekst tego podrcznika da"o-
by si zapisa alfabetem Morse a, w którym przecieŻ wystpują zaledwie dwa rodzaje
znaków: kropka i kreska. Alfabet s"uŻący kodowaniu informacji w cząsteczkach kwa-
sów nukleinowych jest wic bogatszy w porównaniu z alfabetem Morse a, cho znacz-
nie uboŻszy od alfabetu "aciłskiego. Z dwudziestu kilku liter tego alfabetu moŻna z"o-
Ży tekst podrcznika, gazety, scenariusza filmu, ksiąŻki telefonicznej czy tomiku
poezji. Litery są zawsze takie same, a o rodzaju zawartej w tekĘcie informacji decydu-
je kolejnoĘ, w jakiej zosta"y uŻyte. Podobnie sekwencja zasad azotowych wchodzą-
cych w sk"ad nukleotydów budujących fragment cząsteczki DNA decyduje o treĘci za-
wartej w nim informacji, czyli o budowie i w"aĘciwoĘciach okreĘlonego bia"ka.
30
w Wystpowanie DNA
W komórkach eukariotycznych DNA wystpuje g"ównie w jądrze komórkowym (jego
niewielkie iloĘci zawarte w mitochondriach i chloroplastach kodują zaledwie oko"o
10% bia"ek tych organelli).
genom wirusa
jądro komórkowe
genofor
mitochondrium
chloroplasty
plazmidy
Rys. 21. Wystpowanie DNA: a w komórce prokariotycznej, b w roĘlinnej komórce euka-
riotycznej, c w pojedynczej cząstce wirusa.
Ca"oĘ DNA zawierającego kompletną informacj genetyczną organizmu lub wirusa nosi na-
zw genomu. Genomy wirusów, komórek prokariotycznych i komórek eukariotycznych znacz-
nie róŻnią si wielkoĘcią. Do najmniejszych naleŻą genomy wirusów.
Cząsteczki DNA są zwykle bardzo d"ugie. Na przyk"ad w jądrze komórki cz"owieka
"ączna ich d"ugoĘ siga 2 m. Sk"ada si na nią niemal 6 mld nukleotydów. D"ugie
cząsteczki DNA mieszczą si w jądrze o niewielkiej Ęrednicy (są upakowane ) dzi-
ki oddzia"ywaniom ze swoistymi bia"kami.
W komórkach prokariotycznych DNA wystpuje zwykle w postaci kolistej cząsteczki
(tzw. genoforu) zanurzonej w cytoplazmie. Niektóre bakterie zawierają ponadto nie-
wielkie cząsteczki DNA zwane plazmidami. Nie są one niezbdne do funkcjonowa-
nia komórki, czsto jednak zawierają geny warunkujące opornoĘ na antybiotyki, stąd
ich uŻytecznoĘ w pewnych Ęrodowiskach Życia bakterii.
Kwas deoksyrybonukleinowy stanowi takŻe istotny sk"adnik niektórych wirusów. Wy-
stpuje on tam w postaci pojedynczej cząsteczki chronionej przez bia"kową otoczk.
w Replikacja DNA
Ogólny przebieg replikacji
KomplementarnoĘ obu nici DNA jest warunkiem jego unikatowej w"aĘciwoĘci
zdolnoĘci do powielania si (replikacji). Jest to proces zachodzący przed podzia"em
komórki, w którego wyniku z jednej cząsteczki DNA powstają dwie identyczne z nią
cząsteczki potomne (rys. 22).
Do rozpoczcia replikacji niezbdne jest lokalne rozdzielenie dwóch nici macierzystej
cząsteczki DNA. Powstają w ten sposób tzw. wide"ki replikacyjne. Nastpnie do kaŻdej
z nici przy"ączają si komplementarne nukleotydy, co ostatecznie prowadzi do wytwo-
rzenia dwóch identycznych cząsteczek DNA. W sk"ad kaŻdej z nich wchodzi jedna ni
stara , tj. pochodząca z cząsteczki macierzystej, oraz jedna ni nowo zsyntetyzowana,
dlatego replikacj okreĘla si jako pó"zachowawczą, czyli semikonserwatywną.
Enzymem katalizującym reakcje przy"ączania si nukleotydów jest polimeraza DNA
(replikaza), cho tak naprawd nie jest to proces polimeryzacji, lecz polikondensacji,
31
3 5
ni macierzysta ni macierzysta
T A
A T
G C
A T
T A
3
C G
nowa ni
A
5
polimeraza DNA
polimeraza D
meraza DNA
meraza D
T
nowa ni
A T A T
wide"ki replikacyjne
G C
G C
C G
C G
T A
T A
A T
A T
T A
T A
A T
A T
Rys. 22. Replikacja DNA.
3 5 3 G C 5
G C
poniewaŻ "ączenie nukleotydów nie polega na wysyceniu podwójnych wiązał, ale na
wydzieleniu cząsteczek wody z grup hydroksylowych.
Polimeraza DNA u organizmów prokariotycznych wykazuje równieŻ w"aĘciwoĘci na-
prawcze, dziki którym rozpoznaje, wycina i zastpuje prawid"owym nukleotyd b"d-
nie wbudowany do nowo syntetyzowanej nici DNA. W komórkach eukariotycznych
mechanizmy naprawiające b"dy replikacji są o wiele bardziej skomplikowane.
Wytworzenie po"ączeł midzy nukleotydami wymaga dostarczenia niezbdnej iloĘci
energii. Do replikacji są wic wykorzystywane nukleotydy zawierające zamiast jed-
nej, trzy reszty fosforanowe. W czasie reakcji nastpuje rozerwanie dwóch wysoko-
energetycznych wiązał "ączących reszty fosforanowe(V), a w rezultacie uwolnienie
potrzebnej energii (rys. 23).
C P P P
A P P P
P G P G
energia
C P P P
P T P T
P
P G P G C
polimeraza DNA
P P
P C G P C G
P P
P G C P G C
reszta fosforanowa(V) zasada azotowa deoksyryboza
P
Rys. 23. Mechanizm syntezy komplementarnego "ałcucha DNA.
32
RóŻnice w syntezie komplementarnych "ałcuchów DNA
W procesie replikacji polimeraza DNA moŻe przy"ącza wolne nukleotydy jedynie
do kołca 3 "ałcucha polinukleotydowego, tzn. do kołca zawierającego wolną gru-
p hydroksylową synteza przebiega wic w kierunku od 5 do 3 nowo syntetyzo-
wanej nici. Jak juŻ wspomniano, kołce nici DNA nie są jednakowe, tzn. jeden z nich
to 3 , drugi 5 . Z tego powodu wyd"uŻanie nowych nici DNA odbywa si w prze-
ciwnych kierunkach (rys. 24). Początek ich syntezy jest uwarunkowany wytworze-
niem krótkiego, kilkunukleotydowego odcinka startera RNA. Jedna z nowych nici
jest syntetyzowana w sposób ciąg"y ku rozwierającym si wide"kom replikacyjnym
przez przy"ączanie nukleotydów do pojedynczego startera RNA. PoniewaŻ druga ni
jest przeciwbieŻna w stosunku do pierwszej, jej synteza musi takŻe nastpowa w kie-
runku przeciwnym. Jest to moŻliwe dopiero wówczas, gdy na jej matrycy powstanie
wolne miejsce, umoŻliwiające replikacj krótkiego fragmentu nici. Z tego powodu ni
ta jest syntetyzowana z wielu kolejnych miejsc startu i powstaje z po"ączenia wielu
krótkich odcinków, nazwanych od nazwiska ich odkrywcy fragmentami Okazaki. Jej
synteza odbywa si w kierunku przeciwnym do kierunku przesuwania si wide"ek re-
plikacyjnych. Po przejĘciu wide"ek replikacyjnych wzd"uŻ ca"ego replikowanego od-
cinka DNA nastpuje wycinanie RNA starterowego, uzupe"nienie powsta"ych przerw
odpowiednimi nukleotydami DNA oraz po"ączenie fragmentów Okazaki w ciąg"ą ni
dziki dzia"aniu enzymu ligazy DNA.
3 5
5 3
polimeraza DNA
fragmenty
ni macierzysta
ni macierzysta
Okazaki
nowa ni
nowa ni
starter RNA
starter RNA
3
5
5 3 5 3
Rys. 24. RóŻnice w syntezie komplementarnych "ałcuchów DNA.
Synteza obu "ałcuchów polinukleotydowych w nowej cząsteczce DNA przebiega w przeciw-
nych kierunkach. Jeden z nich jest syntetyzowany w sposób ciąg"y, drugi fragmentarycznie.
Przebieg replikacji w komórkach prokariotycznych i eukariotycznych
Replikacja rozpoczyna si w ĘciĘle okreĘlonych miejscach zwanych miejscami inicjacji
replikacji. Są to odcinki DNA, do których przy"ączają si enzymy uczestniczące
w tym procesie, m.in. polimeraza DNA. W komórkach prokariotycznych wystpuje
pojedyncze miejsce inicjacji replikacji, w komórkach eukariotycznych jest ich wiele
(rys. 25). W wyniku przesuwania si wide"ek replikacyjnych w dwóch przeciwnych
33
a b
wide"ki replikacyjne
wide"ki
replikacyjne
ni macierzysta
ni potomna
Rys. 25. Przebieg replikacji DNA: a w komórce prokariotycznej, b w komórce eukariotycznej.
Cząsteczki DNA w komórkach eukariotycznych są znacznie d"uŻsze niŻ w komórkach proka-
riotycznych. Zapoczątkowanie replikacji w wielu miejscach cząsteczki DNA umoŻliwia znacz-
ne skrócenie tego procesu.
kierunkach powstaje, a nastpnie zwiksza swoje rozmiary tzw. oczko. Ca"y proces
kołczy si z chwilą powstania dwóch cząsteczek DNA, co w komórce eukariotycz-
nej wymaga po"ączenia si ze sobą wszystkich oczek .
w Budowa kwasu rybonukleinowego (RNA)
Jednostką budulcową RNA, podobnie jak DNA, jest nukleotyd.
W sk"ad nukleotydu RNA wchodzą:
" jedna z organicznych zasad azotowych: adenina (A), guanina (G), cytozyna (C), uracyl (U).
" cukier piciowglowy ryboza,
" reszta fosforanowa(V).
O
uracyl
HN
Rys. 26. Nukleotyd RNA fosforan(V) urydyny.
O N
O
Nukleotydy RNA róŻnią si od nukleotydów DNA
5
rodzajem cukru prostego (zamiast deoksyrybozy
O P O CH2 O
wystpuje ryboza) oraz zestawem zasad azoto-
4 1
O
H H wych (zamiast tyminy wystpuje uracyl).
H H
3 2
OH OH ryboza
34
w Rodzaje kwasów rybonukleinowych
Znane są trzy rodzaje RNA, róŻniące si midzy sobą liczbą oraz sekwencją budują-
cych je nukleotydów. Są to:
" informacyjny RNA mRNA (ang. messenger RNA),
" rybosomowy RNA rRNA (ang. rybosomal RNA),
" transportujący RNA tRNA (ang. transfer RNA).
Wszystkie rodzaje RNA uczestniczą w procesie biosyntezy bia"ek. RNA moŻe teŻ sta-
nowi materia" genetyczny; dotyczy to wikszoĘci wirusów atakujących komórki ro-
Ęlin i niektórych wirusów atakujących komórki zwierząt (np. HIV).
Stwierdzono, Że niektóre cząsteczki RNA, tzw. rybozymy, wykazują w"aĘciwoĘci en-
zymatyczne i katalizują niektóre etapy istotnych biologicznie reakcji (np. wytworze-
nie wiązania peptydowego midzy aminokwasami w powstającym "ałcuchu bia"ka).
UwaŻa si zresztą, Że to RNA by" pierwszym organicznym katalizatorem reakcji bio-
chemicznych w okresie kszta"towania si Życia na Ziemi (str. 170). Dopiero póęniej po-
jawi"y si bia"ka, które z czasem prawie ca"kowicie zastąpi"y RNA w roli katalizatora.
w Proces syntezy RNA (transkrypcja)
Struktura wszystkich rodzajów RNA jest zapisana w DNA. Przepisywanie informacji
z DNA na kaŻdy rodzaj cząsteczek RNA nosi nazw transkrypcji (rys. 27). Proces ten
wymaga okresowego rozwinicia helisy DNA. Transkrypcji ulega tylko jeden "ał-
cuch DNA (tzw. "ałcuch matrycowy). TakŻe w przebiegu tego procesu obowiązuje
poznana wczeĘniej regu"a komplementarnoĘci zasad azotowych, zgodnie z którą
w tym wypadku naprzeciw odpowiednich nukleotydów "ałcucha DNA uk"adają si
komplementarne nukleotydy RNA (wystpujący w RNA uracyl tworzy komplemen-
tarną par z adeniną). Po od"ączeniu nowo zsyntetyzowanego "ałcucha RNA czą-
steczka DNA odtwarza swoją struktur.
Transkrypcja wymaga obecnoĘci polimerazy RNA. Oprócz w"aĘciwoĘci polimery-
zacyjnych ma on zdolnoĘ rozpoznawania na DNA odpowiedniego uk"adu nukle-
otydów, od którego rozpoczyna proces transkrypcji (miejsce inicjacji transkrypcji).
5
mRNA
matrycowy "ałcuch DNA
polimeraza RNA
A A
U U
DNA
5
3
kierunek transkrypcji
5
3
rozplatanie splatanie
DNA DNA
Rys. 27. Przebieg transkrypcji.
KolejnoĘ nukleotydów w cząsteczce DNA determinuje kolejnoĘ nastpujących po sobie nu-
kleotydów w nowo zsyntetyzowanym "ałcuchu RNA.
A
C
T
G
C
G
T
A
A
T
C
T
G
A
G
A
C
U
G
G
A
C
C
G
A
A
U
T
U
A
T
A
G
T
U
C
T
C
U
A
G
C
G
G
U
A
C
A
A
G
A
A
U
C
C
T
A
G
G
G
C
A
A
T
C
T
G
A
C
A
35
Terminacja (zakołczenie) transkrypcji nastpuje po napotkaniu na nici DNA swoistej
sekwencji nukleotydów, która u"atwia od"ączenie si powsta"ego RNA od matrycy.
Biorąc pod uwag, Że DNA komórki moŻe zawiera wiele tysicy genów (np. u cz"o-
wieka ponad 30 000), naleŻy uzna, Że rozpoznanie, gdzie si zaczyna i gdzie koł-
czy poszukiwany gen, nie naleŻy do "atwych zadał, poniewaŻ polimeraza RNA roz-
poczyna syntez "ałcucha bez udzia"u odcinka starterowego.
Energia potrzebna w czasie transkrypcji pochodzi, podobnie jak w wypadku repli-
kacji, z rozpadu wiązał wysokoenergetycznych dodatkowo ufosforylowanych nu-
kleotydów.
w Modyfikacje mRNA w komórkach eukariotycznych
Mimo ogólnego podobiełstwa mechanizmów syntezy mRNA w komórkach proka-
riotycznych i eukariotycznych, odkryto wystpowanie istotnych róŻnic. Wynikają
one przede wszystkim z odmiennej organizacji genów w obu typach komórek. W ko-
mórkach prokariotycznych geny są ciąg"e, natomiast w komórkach eukariotycznych
stanowią rodzaj mozaiki. W ich sk"ad wchodzą sekwencje kodujące, czyli eksony,
zawierające informacj o sekwencji aminokwasów w kodowanym bia"ku, przedzie-
lone sekwencjami niekodującymi, czyli intronami, które nie zawierają takiej infor-
macji. Poszczególne geny róŻnią si liczbą sk"adających si na nie intronów i ekso-
nów. Co wicej, "ączna d"ugoĘ sekwencji niekodujących moŻe stanowi nawet
75% ca"ego genu, czyli znacznie przekracza d"ugoĘ odcinków kodujących.
W komórce prokariotycznej powsta"y mRNA jest praktycznie od razu gotowy do udzia-
"u w biosyntezie bia"ka, natomiast w komórce eukariotycznej wymaga znacznych prze-
kszta"ceł. Zachodzą one, podobnie jak proces transkrypcji, na obszarze jądra komór-
kowego. W trakcie transkrypcji nastpuje przepisanie obu typów sekwencji, czyli
eksonów i intronów, w wyniku czego powstaje cząsteczka RNA nazywana prekursoro-
wym mRNA lub pre-mRNA (rys. 28). Cząsteczka pre-mRNA przekszta"ca si w funkcjo-
nalny mRNA, tzn. zawierający ciąg"ą informacj o strukturze kodowanego bia"ka,
w procesie sk"adania (ang. splicing). Polega on na precyzyjnym wycinaniu i usuwaniu
fragmentów niekodujących (intronów) oraz sklejaniu ze sobą w jedną ca"oĘ sekwen-
cji kodujących (eksonów). Poza wycinaniem intronów obserwuje si równieŻ zasadni-
czą modyfikacj budowy obu wolnych kołców powstającego mRNA, co m.in. znacz-
nie zwiksza jego trwa"oĘ. Tak przygotowana cząsteczka opuszcza jądro komórkowe
i dostaje si do cytoplazmy komórki, gdzie przy"ączy si do rybosomów, inicjując pro-
ces biosyntezy bia"ka.
introny eksony
odcinek DNA
(gen)
transkrypcja
pre-mRNA
wycinanie intronów
i "ączenie eksonów
mRNA
Rys. 28. Transkrypcja i sk"adanie RNA w komórce eukariotycznej.
36
w Znaczenie róŻnych rodzajów RNA w biosyntezie bia"ek
Rybosomowy RNA (rRNA) stanowi jeden ze sk"adników rybosomów organelli
uczestniczących w syntezie bia"ek. Liczba rybosomów w komórce zaleŻy od zapo-
trzebowania na bia"ko (jedna komórka
podjednostka
eukariotyczna zawiera przecitnie kilka
wiksza
milionów rybosomów). Rybosomy ko-
mórki eukariotycznej znajdują si
przede wszystkim w cytoplazmie, ale
równieŻ w jądrze komórkowym, mito-
chondriach i chloroplastach. Komórka
prokariotyczna zawiera tylko rybosomy
cytoplazmatyczne. Rybosomy mają po-
kompletny rybosom
sta kulistych organelli podzielonych
(widok z boku)
podjednostka
na dwie nierówne czĘci nazywane
mniejsza
podjednostkami (rys. 29). Powstają w ją-
drze komórkowym (dok"adnie: w jąder- Rys. 29. Budowa rybosomu (rysunek sporzą-
dzony na podstawie obrazów z mikroskopu
ku). Podjednostki rybosomu "ączą si ze
elektronowego).
sobą tylko w obecnoĘci mRNA.
Transportujący RNA (tRNA) przenosi aminokwasy do miejsc syntezy bia"ek.
Wystpuje w postaci niewielkich cząsteczek przyjmujących charakterystyczną form
przestrzenną porównywaną do odwróconej litery L (rys. 30a). Biorąc pod uwag
rozmieszczenie fragmentów kluczowych dla ich funkcji, przy pewnej dozie fantazji
moŻna przyją, Że przypominają kszta"tem liĘ koniczyny (rys. 30b).
OH
3
A
a b
miejsce przy"ączenia
C
aminokwasu
5
C
5
A
3
G C
C G
ptla 3
G C ptla 3
ptla 1
G U
A U
U A
U A U
ptla 1
C
G
D A
G A C A C
A
C U C GAU
D
G
C U G U G
G
T C
G A G C
A
C Y
G
G G
U
A
G
C G G
C G
A U
C G
ptla 2
A
Y
C A
ptla 2
U Y
G
A
A
antykodon
antykodon
Rys. 30. Model budowy cząsteczki tRNA: a struktura trójwymiarowa, b struktura dwuwy-
miarowa (D, Y, Y nukleotydy zmodyfikowane).
Do szczególnych miejsc cząsteczki tRNA naleŻą: miejsce przy"ączenia aminokwasu o sta"ej dla
wszystkich tRNA niesparowanej sekwencji nukleotydów CCA, antykodon (trzy nukleotydy od-
powiedzialne za rozpoznanie podczas syntezy bia"ka trzech komplementarnych nukleotydów
na nici mRNA).
37
W komórce istnieje oko"o 50 60 rodzajów tRNA. Pojedyncza cząsteczka tRNA roz-
poznaje, wiąŻe i dostarcza do miejsca syntezy bia"ka (do rybosomów) tylko jeden ro-
dzaj aminokwasu. Nastpnie "ączy si z rybosomem oraz odpowiednim miejscem na
nici mRNA, co umoŻliwia precyzyjne wstawienie transportowanego aminokwasu
w tworzony "ałcuch bia"ka.
Informacyjny RNA (mRNA) przenosi informacj genetyczną zawartą w DNA
z miejsca jej przechowywania (jądro komórkowe) do miejsca syntezy bia"ek
(cytoplazma), gdzie nastpnie wchodzi w kontakt z rybosomami i s"uŻy jako matry-
ca do wytwarzania bia"ek.
w Proces odwrotnej transkrypcji
Pojcie transkrypcji odnosi si do przepisywania informacji genetycznej z DNA na
RNA. Jednak w 1964 r., podczas badał nad wirusami onkogennymi, których materia-
"em genetycznym jest RNA, wykazano, Że zachodzi takŻe proces odwrotny do typo-
wej transkrypcji. Polega on na wytwarzaniu cząsteczki DNA na podstawie matrycy,
którą stanowi RNA (rys. 31) . SzeĘ lat póęniej odkryto w wirusach enzym katalizują-
cy t reakcj. Nazwano go odwrotną transkryptazą, a wirusy zawierające ten enzym
retrowirusami. NaleŻy do nich m.in. HIV, wywo"ujący zespó" nabytego upoĘledze-
nia odpornoĘci (AIDS).
RNA wirusa hybryda RNA/DNA
jądro komórki
odwrotna wytrawienie dobudowanie włączenie DNA
transkrypcja nici RNA komplementarnej do genomu
nici DNA komórki
Rys. 31. Przebieg odwrotnej transkrypcji wirusowego RNA.
Po wnikniciu materia"u genetycznego wirusa do komórki gospodarza odwrotna transkrypta-
za katalizuje proces syntezy pojedynczej nici DNA komplementarnej wobec RNA wirusa. Na-
stpnie zostaje dobudowana druga ni DNA, komplementarna do wytworzonej poprzednio.
Powsta"a cząsteczka DNA ulega w"ączeniu do DNA komórki gospodarza, a zawarta w niej in-
formacja genetyczna zostaje wykorzystana do syntezy sk"adników wirusów potomnych (wiru-
sowego RNA i bia"ek).
Proces syntezy DNA na matrycy RNA, czyli odwrotną transkrypcj, odkryto póęniej
równieŻ w niektórych komórkach eukariotycznych.
PomyĘl, odpowiedz
1. Scharakteryzuj budow DNA, uwzgldniając:
a) budow pojedynczego nuleotydu,
b) sposób "ączenia nukleotydów w "ałcuch polinukleotydowy,
c) przestrzenną struktur podwójnej helisy.
38
2. WyjaĘnij, na czym polega róŻna orientacja "ałcuchów polinukleotydowych
DNA.
3. WskaŻ miejsca wystpowania DNA w komórce prokariotycznej i eukariotycznej.
4. Omów przebieg replikacji DNA. WyjaĘnij, co oznacza stwierdzenie, Że replika-
cja ma charakter semikonserwatywny.
5. Scharakteryzuj budow chemiczną i przestrzenną RNA.
6. Przedstaw przebieg syntezy RNA.
7. WyjaĘnij istot zachodzących w komórkach eukariotycznych potranskrypcyj-
nych modyfikacji mRNA.
8. OkreĘl znaczenie róŻnych rodzajów RNA w biosyntezie bia"ka.
9. WyjaĘnij, na czym polega proces odwrotnej tanskrypcji. Podaj przyk"ady wiru-
sów, u których on wystpuje.
wiczenia, zadania
1. Porównaj budow i funkcje kwasów nukleinowych, uzupe"niając tabel.
Elementy porównywane DNA RNA
Podstawowa jednostka budulcowa
Rodzaj cukru
Zasady azotowe
Reszta kwasu nieorganicznego
Funkcje
2. Oblicz procentową zawartoĘ adeniny w DNA organizmu, wiedząc, Że cytozy-
na stanowi 18% wszystkich zasad azotowych tego DNA.
3. Po analizie sekwencji nukleotydów budujących jeden z "ałcuchów polinukleoty-
dowych DNA uzupe"nij schemat o "ałcuch komplementarny do zaprezentowanego.
GGGA T CATC C T T A CG
4. Podaj sekwencj nukleotydów mRNA syntetyzowanego wed"ug przedstawio-
nego poniŻej odcinka DNA, wiedząc, Że ni kodującą zaznaczono kolorem
czerwonym.
AT GCCGAAG T A T
TA CGGCTTC A T A
5. Podaj antykodony kolejnych cząsteczek tRNA, które bdą uczestniczy w bio-
syntezie bia"ek zachodzącej zgodnie z przedstawioną poniŻej sekwencją nukle-
otydów w odcinku mRNA.
UA CGUUCACUC AGUA
39
Podsumuj S OWNI K
L EKCJI
Podstawową jednostką budulcową wszystkich typów
Odwrotna transkryptaza
kwasów nukleinowych jest ............................ . Do jego
enzym, który katalizuje
sk"adników naleŻą: piciowglowy cukier, ......................
tworzenie kopii DNA na
oraz jedna z organicznych zasad ............................ . Po-
matrycy RNA.
szczególne ............................ "ączą si ze sobą w "ał-
Retrowirusy grupa
cuch polinukleotydowy. Cząsteczka RNA ma posta po-
wirusów, do której naleŻy
jedynczego "ałcucha polinukleotydowego, a cząsteczk
m.in. HIV. Ich nazwa
wywodzi si od
DNA budują dwa "ałcuchy, tworząc struktur zwaną
odwrotnego przep"ywu
............................ . DNA jest noĘnikiem informacji gene-
informacji, tj. od RNA do
tycznej w komórkach wszystkich organizmów prokario-
DNA, w czym uczestniczy
tycznych i eukariotycznych. W komórce eukariotycznej
odwrotna transkryptaza.
jest zlokalizowany g"ównie w ........................ oraz cz-
Ęciowo na obszarze ......................... i ............................ .
W komórce prokariotycznej wystpuje w postaci genofo-
ru oraz niewielkich, kolistych cząsteczek zwanych
............................, zawierających zwykle geny opornoĘci
na antybiotyki. Proces podwojenia cząsteczki DNA za-
chodzi przed podzia"em komórki i nosi nazw
........................... . Na matrycy DNA, w procesie zwanym
.......................... zostają wytworzone róŻne rodzaje RNA,
tj. .........................., .......................... i ......................... .
Biologiczna funkcja RNA w komórce jest związana
z przebiegiem ............................ . Potranskrypcyjne prze-
kszta"cenia mRNA komórek eukariotycznych są konse-
kwencją nieciąg"ej struktury genów, tj. istnienia odcin-
ków kodujących, zwanych ..........................., oraz
oddzielających je odcinków niekodujących, zwanych
........................... .
Przepisywanie informacji genetycznej z RNA na DNA,
czyli proces ..........................., odkryto podczas badał
nad ........................... .
Wyszukiwarka
Podobne podstrony:
38 BUDOWA I ROLA UKŁADU SZKIELETOWEGO CZŁOWIEKA6 BUDOWA I FUNKCJE KWASÓW NUKLEINOWYCHmarta malecka tomasz krajewski rhszkolenia rola rekrutacji w budowaniu?ektywnych zespolowbudowa lunety?lowniczejKw 1 (2)Budowa robotow dla poczatkujacych budrobMakroskopowa budowa mięśniarola konstytucji w państwieKwasy nukleinoweBudowanie wizerunku firmy poprzez architekturęRola laboratoriów w świetle wymagań systemów zarządzania jakosciąrola rosji w europierola kuratora sadowego w resocjalizacji nieletnichŚlusarczyk Cz Rola Internetu w edukacji osób niepełnosprawnychBudowa Linuxa rfc1350budowa i działanie układów rozrządu silników spalinowychrola poety i poezji w świetle wybranych tekstów romantyzmu (2)kw spiswięcej podobnych podstron