Mutacje genowe ⇒ zmiany w sekwencji nukleotydów w genie
Mutacje samorzutne (spontaniczne)
skutek błędów w procesie replikacji DNA, rzadziej samorzutnych modyfikacji chemicznych zasad w DNA
Mutacje indukowane
skutek działania mutagennych czynników chemicznych lub fizycznych (powstających w wyniku przemian metabolicznych w komórkach lub pochodzących ze środowiska zewnętrznego)
Mutacje genowe indukowane
Najsilniej działające czynniki mutagenne :
promieniowanie jonizujące (np. Roentegna) ⇒ powoduje zmiany struktury zasad lub rozrywanie mostków wodorowych między zasadami w DNA
promieniowanie nadfioletowe (UV) ⇒ intensywnie pochłaniane przez DNA, indukuje zmiany w zasadach pirymidynowych, na przykład ich dimeryzację
hydroksyloamina (NH2OH) wywołuje zmianę cytozyny na pochodną uracylu, co prowadzi do tranzycji C→T
kwas azotawy (HNO2) ⇒ powoduje deaminację zasad w DNA i RNA
Mutacje genowe indukowane
Najsilniej działające czynniki mutagenne :
♣ związki alkilujące ⇒ dzięki posiadanym grupom etylowym, metylowym lub bardziej złożonym, powodują alkilację metylowanie lub etylowanie) zasad w kwasach nukleinowych
♣ barwniki akrydynowe (np.proflawina, oranż akrydynowy, akryflawina) ⇒ wnikają między zasady w łańcuchu DNA powodując deformację podwójnej helisy DNA
♣ analogi zasad (np.5-bromouracyl- analog tyminy oraz 2- aminopuryna - analog adeniny) ⇒ mogą być wbudowywane w DNA
Mutacje genowe w komórkach rozrodczych :
- trwałe zmiany przekazywane z pokolenia na pokolenie
Mutacje genowe w komórkach somatycznych :
mogą dotyczyć wszystkich komórek dorosłego organizmu lub tylko pewnych jego części
nie dziedziczą się
Cechy mutacji genowych spontanicznych
odwracalność - allel, który powstał dzięki mutacji genu, może zmutować wstecznie do formy wyjściowej tego genu
u
A → a
←
v
Powtarzalność - określona mutacja może powtórzyć się w podobny sposób, dając zbliżone lub takie same skutki fenotypowe
Cechy mutacji genowych spontanicznych
Podatność genów na mutacje :
♣ geny labilne
♣ geny stabilne
Częstość mutacji :
♣ gorące miejsca (ang. hot spots) – sekwencje dwunukleotydowe CG, zwane wyspami CpG
♣ wpływ czynników dziedzicznych
Mutacje genowe - zmiany sekwencji nukleotydów
1. tranzycja - zamiana jednej zasady na drugą purynową lub pirymidynowej na inną pirymidynową (zamiany par zasad (A/T↔G/C)
2. transwersja - zamiana zasady purynowej na pirymidynową
i odwrotnie pirymidynowej na purynową:
A/T↔C/G
↓↑
T/A↔G/C
3. delecja - wypadnięcie (utrata) jednej lub kilku par nukleotydów,
4. insercja - wstawienie jednej lub kilku par nukleotydów
Mutacje genowe
Mutacje genowe mogą być także następstwem zakłóceń w splicingu, czyli tzw. obróbce mRNA nazwanej dojrzewaniem mRNA lub składaniem genów
Ciche podstawienia (substitution at silent site) – nie powodują zmiany składu aminokwasów w białku
są wykorzystywane w analizie polimorfizmu DNA - RFLP (restriction fragment length polymorphism=polimorfizm fragmentów restrykcyjnych)
Mechanizmy naprawy uszkodzeń DNA
Enzymatyczne procesy naprawy :
naprawa bezpośrednia - wycinanie nukleotydu (usuwane są duże uszkodzenia) bądź zasady uszkodzonej przez promieniowanie jonizujące i czynniki alkilujące
naprawa pośrednia (post replikacyjna) - naprawa w nici potomnej
Zmiany na poziomie polipeptydu - typy mutacji
1.mutacje typu zmiany sensu → na skutek tranzycji lub transwersji → zamiana kodonu dla określonego aminokwasu na kodon dla innego aminokwasu
2. mutacje typu nonsens → zamiana kodonu sensownego na jeden z trzech kodonów nonsensownych (STOP)
3. mutacje zmiany ramki odczytu → na skutek delecji lub insercji jednej lub kilku par nukleotydów (liczba par nie może być podzielna przez 3) → przesunięcie ramki odczytu
Zmiany na poziomie polipeptydu - typy mutacji
4. mutacje typu insercja lub delecja aminkwasu
- delecja trzech nukleotydów (lub wielokrotności cyfry 3) łańcuchu DNA powoduje utratę jednego lub kilku aminkowasów w białku kodowanym przez dany gen
5. mutacje podczas obróbki post transkrypcyjnej (splicing) mRNA - powstaje
nieprawidłowy mRNA
Mutacja typu zmiany sensu
Przykłady :
- tranzycja (substytucja) A → G w 383 nukleotydzie genu podjednostki CD18 beta2-integryny 2 ⇒ zamiana kodonu GAC dla kwasu asparaginowego na kodon GGC dla glicyny ⇒ BLAD (Bovine Leukocyte Adhesion Deficiency)
- tranzycja A → G w kodonie 2015 dla histydyny (CAT) ⇒ zamiana na kodon (CGT) dla argininy w genie LYST (zespół Chediak-Higashi’ego) u bydła
Mutacja typu nonsens
Przykłady :
- tranzycja cytozyny na tyminę w 86 kodonie genu syntetazy arginino-bursztynianowej ⇒ zamiana kodonu CGA dla argininy na kodon TGA (STOP) ⇒ citrulinemia
- tranzycja cytozyny na tyminę w 405 kodonie genu syntazy monofosoforanu urydyny ⇒ zamiana kodonu CGA dla argininy na kodon TGA (STOP) ⇒ DUMPS (deficiency uridine monophosphate synthase) u bydła
Mutacja - zmiana ramki odczytu
Delecja nukleotydu [∇]– zmiana aminokwasów od miejsca mutacji
96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107
allel E+ GCA GTC ATG CTG CTG CTG GAG GCC GGT GTC CTG GCC
allel Ed - - - - - - - - - - C - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
allel e - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - ∇GT TCC TGG CCA
allel E+ ala val met leu leu leu glu ala gly val leu ala
allel Ed - - - - - - - - - pro - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
allel e - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - val ser trp pro
Mutacje typu zmiany sensu i zmiany ramki odczytu w locus E u bydła
zamiana aminokwasu
zmiana aminokwasów od miejsca delecji
Mutacja typu insercja/delecja aminokwsu
Mutacja F508 w eksonie 10 genu CFTR (mukowiscydoza)
Prawidłowy allel
kodon 506 507 508 509 510
DNA ATC ATC TTT GGT GTT
aminokwas ile ile phe gly val
Zmutowany allel
kodon 506 507 508 509 510
DNA ATC AT- - -T GGT GTT
aminokwas ile ile gly val
Mutacja podczas obróbki potranskrypcyjnej
mutacja genu kolagenu typ VI - zespół Ullricha (dystrofia mięśniowa)
I – substytucja G →A w poz. –1 nt w intronie 23 – delecja eksonu 24
II – substytucja A →G w poz. – 2 nt w intronie 17 – delecja eksonu 18
Fenotypowy efekt mutacji genowych
1. Morfologiczne - zmiany zewnętrznych cech organizmu (np. wielopalczastość, umaszczenie zwierząt, skrócenie kręgosłupa, bezogoniastość)
2. Biochemiczne - utrata lub modyfikacja zdolności organizmu do wytworzenia specyficznego białka, najczęściej enzymu koniecznego do normalnego przebiegu jakiegoś procesu
3. Letalne (morfologiczne lub biochemiczne)- śmierć osobnika lub utrata / zmiana podstawowej funkcji organizmu w okresie zarodkowym lub w okresie późniejszym
Mutacje genowe - skutki hodowlane
1. Allele wielokrotne, determinują ważne cechy :
grupy krwi - kontrola pochodzenia
polimorficzne białka - kontrola pochodzenia
umaszczenie zwierząt - zwierzęta futerkowe
2. Geny główne :
gen hormonu wzrostu - wydajność mięsna, mleczna
gen hipertrofii mięśniowej - wydajność mięsna
gen płodności - plenność [liczba jagniąt w miocie]
3. Geny wywołujące choroby genetyczne i wady wrodzone
Geny główne
Mutacja skutek rasa
nt821(del11) kodon STOP błękitne belgijskie
Asturiana
nt419(del7-ins10) kodon STOP Maine-Anjou
Tranzycja C →T kodon STOP Charolaise
w 610 nt [Q204X]
Transwersja G →T kodon STOP Maine-Anjou
w 676nt [E226X]
Tranzycja G →A cysteina →tyrozynę Piedmontese,
w 938nt [C313Y] Gasconne
Hipertrofia mięśniowa – mutacja w genie miostatyny
Geny wywołujące choroby genetyczne i wady wrodzone
Geny letalne, semiletalne i subwitalne :
• geny letalne - powodują śmierć ponad 90% osobników, w których genotypach wystąpią w dawce aktywnej (np. homozygota recesywna)
• geny semiletalne - powodują w aktywnej dawce śmierć od 50% do 90% osobników
• geny subwitalne - obniżają wydolność fizjologiczną i mogą powodować śmierć od 10% do 50% osobników
Metody molekularnej diagnostyki chorób genetycznych
PCR – polimerazowa reakcja łańcuchowa
metody z zastosowaniem enzymów restrykcyjnych - RFLP - Restriction Fragment Length Polymorphism
hybrydyzacja DNA-DNA
sekwencjonowanie DNA
cytogenetyczne metody stosowane w diagnostyce nowotworów
Antagonistyczna plejotropia - dobre i złe działanie
- Anemia sierpowata – heterozygoty mają większą odporność na malarię
- Choroba Tay-Sachsa – heterozygoty mają większą odporność na gruźlicę
- Cystic fibrosis [mukowiscydoza] – heterozygoty są prawdopodobnie odporne na cholerę
Mutacje w mtDNA
Heteroplazmia – równoczesne występowanie zmutowanego i prawidłowego mtDNA
mt DNA przekazywany wyłącznie przez matkę potomstwu obojga płci
LHON (zespół Lebera) :dziedziczna neuropatia nerwu wzrokowego, utrata wzroku
MELAS: kwasica mleczanowa,miopatia, napady udaropodobne, drgawki,otępienie umysłowe
NARP (zespół Leigha) : neuropatia obwodowa, ataksja, zwyrodnienie siatkówki
MERRF: padaczka miokloniczna,miopatia, otępienie umysłowe