Rodzaje RNA
Rodzaj | Występowaniea | Długośćb | Rodzaje w komórce | Budowa | Rola |
---|---|---|---|---|---|
hnRNA (heterogenny RNA) |
jądro | od 100 do 1 mln | setki –tysiące | pojedynczy łańcuch polirybonukleotydowy o różnej długości, częściowo skompleksowany z białkami w różnego rodzaju ziarnistości i włókna (m.in. tzw. informosomy) | poddany obróbce (cięciu) daje mRNA i wędruje do cytoplazmy |
mRNA (informacyjny, matrycowy RNA) |
cytoplazma | setki– tysiące | matryca w procesie syntezy polipeptydów (białek) | ||
rRNA (rybosomowy RNA) |
jądro, jąderka, rybosomy |
120– 4500 | 3d lub 4e (patrz niżej) | struktura przestrzenna skomplikowana: obszary dwuniciowej spirali oraz obszary łańcuchów jednoniciowych | aktywny udział w procesie syntezy białek |
tRNA (przekaźnikowy, transportujący RNA) | cytoplazmac | 75–85 | ok. 30–60 | krótki łańcuch zwinięty tak, że odcinki dwuniciowe splecione w helisę są oddzielone jednoniciowymi pętlami (w rzucie przypomina liść koniczyny, patrz rys.) | przenośnik aminokwasów w procesie syntezy białek |
snRNA (mały jądrowy RNA)f |
jądro, jąderko, cytoplazma |
60–400 | dziesiątki? | krótkie odcinki RNA, przypuszczalnie jednoniciowe | udział w składaniu rybosomów, obróbce RNA |
miRNA (mikroRNA) |
ok. 22 | setki? | krótkie odcinki jednoniciowego RNA | regulacja? walka z wirusami? | |
Wirusowy IRNA |
niektóre wirusy |
kilka tys. | przeważnie jedeng | jednoniciowy, rzadziej dwuniciowy, w znacznym stopniu zwinięty w kształt kłębka | nośnik informacji, matryca do syntezy białek |
a Dotyczy eukariontów; b wyrażona jako liczba zasad (nukleotydów); c także cytoplazma w chloroplastach i mitochondriach; d u prokariontów; e u eukariontów; f w jądrze; w jąderku występuje snoRNA — mały jąderkowy RNA, a w cytoplazmie sncRNA — mały cytoplazmatyczny RNA; g dotyczy oczywiście tylko komórek zakażonych. |
Główne etapy przetwarzania informacji genetycznej
Wyszczególnienie | Etap przetwarzania informacji genetycznej |
---|---|
replikacja | |
Istota procesu |
powielenie DNA |
DNA → DNA | |
Matryca | dwuniciowy DNA |
Produkt | dwuniciowy DNAb |
Zasadnicze etapy |
inicjacja (rozpoczęcie), elongacja (wydłużanie łańcucha DNA), terminacja (zakończenie) |
Czego dotyczy |
zasadniczo dotyczy całości DNA |
Czas zachodzenia |
przed podziałem komórki |
Miejsce zachodzenia |
jądro komórkowe (u bakterii — nukleoid) |
a Tzw. nić sensowna; b zarówno matrycowa, jak i potomna podwójna helisa zawierają po jednej nici z wyjściowego DNA i po jednej nici nowej (jest to tzw. zasada replikacji semikonserwatywnej). |
Przebieg replikacji, transkrypcji i translacji
Proces | Etap | Ważniejsze enzymy |
---|---|---|
Replikacja | rozplatanie podwójnej nici DNA (wpierw odwinięcie jej z nukleosomów) — jest nić wiodąca i opóźniona | helikaza, topoizomeraza I i II |
przyłączenie starterów (krótkie odcinki RNA) do opóźnionej nici DNA co 1000–2000 (100–200) par zasad | prymaza lub polimeraza DNA α | |
dodawanie nukleotydów do starterów (kierunek 5´ → 3´ na obu niciach: wiodącej i opóźnionej), sprawdzanie poprawności replikacji i ewentualna korekta błędów | polimeraza DNA III (dimer) lub osobne polimerazy DNA ( δ i ε) na każdej z nici | |
usunięcie starterów i wypełnienie luk po nich | polimeraza DNA I | |
łączenie z sobą odcinków nici opóźnionej | ligaza DNA | |
dodanie wielu kopii określonej sekwencji na końcu liniowego DNA (tzn. w telomerze chromosomu) | telomeraza | |
Przemiany poreplikacyjne |
metylacja zasad azotowych w specyficznych miejscach (co pozwala m.in. odróżnić własny DNA od obcego) | metylotransferaza |
wytwarzanie odpowiedniej struktury (np. nukleosomy) | ? | |
Transkrypcja | odszukanie sekwencji promotorowej i rozplecenie nici | polimeraza RNA lub polimerazy RNA I, II i III (oddzielne dla różnych rodzajów RNA) i dodatkowe czynniki białkowe |
odszukanie pozycji startowej w DNA | ||
przesuwanie się wzdłuż nici DNA, synteza nici RNA | ||
dotarcie do sekwencji terminatorowej i zakończenie syntezy łańcucha RNA, oddzielenie RNA od DNA | ||
Przemiany potranskrypcyjne (dojrzewanie RNA) | zabezpieczanie końca 5´ specjalnym nukleotydemb | guanylilotransferaza |
usuwanie końcowych nukleotydów i cięcie nici RNA | RNazy: endo- i egzonukleazy | |
dodanie ok. 250 reszt adenozynowych do końca 3´c | polimeraza poli(A) (PAP) | |
wycinanie intronów i łączenie egzonów (tzw. splicing) | kompleksy białek i snRNA | |
modyfikacja zasad lub reszt cukrowych (np. metylacja) | metylotransferaza | |
redagowanie RNA: zmiana pojedynczych zasad | deaminazy | |
Translacja | wiązanie aminokwasów z odpowiednimi tRNA | syntetazy aminoacylo-tRNA |
związanie rybosomu z mRNA (blisko kodonu START) oraz inicjatorowym tRNA (zawiera resztę metioniny) | składniki rybosomu, czynniki białkowe IF1–IF3 | |
przyłączenie kolejnego aminoacylo-tRNA do rybosomu | różne czynniki białkowe | |
dołączenie aminokwasu do powstającego polipeptydu | peptydylotransferaza | |
przesunięcie peptydylo-tRNA i mRNA (o 1 kodon) | translokaza | |
uwolnienie polipeptydu i mRNA (na kodonie STOP) | m.in. peptydylotransferaza | |
Przemiany potranslacyjne (dojrzewanie białka) |
tworzenie mostków dwusiarczkowych | różne enzymy |
rozcinanie łańcuchów polipeptydowych | peptydazy | |
odcinanie aminokwasów końcowych | amino- i karboksypeptydazy | |
odcinanie peptydów sygnałowych | peptydaza sygnałowa | |
zwijanie białka do określonej konformacji | chaperony (czaperony)d | |
glikozylacja, hydroksylacja, acetylacja, fosforylacja | różne enzymy | |
Uwaga: wymieniono główne etapy charakterystyczne dla wszystkich organizmów; kursywą — dane dotyczą tylko eukariontów. b jest to 7-metyloguanozyna (tzw. kapowanie); c tzw. poliadenylacja, stanowi sygnał do skierowania mRNA do cytoplazmy; d „białka opiekuńcze”, zaliczane do tzw. białek szoku cieplnego. |