Biochemia 6, TŻ UR, II rok, Biochemia


BIOCHEMIA

Wykład 6

Regulacja ekspresji genów - poziom I

Biosynteza białka enzymu - włączona lub wyłączona

Chymotrypsyna jest aktywowana proteolizą.

Enzymatycznie wydzielana jako proenzymy - forma nieaktywna.

Chymotrypsynogen jest syntezowany w trzustce i wydzielany do światła jelita cienkiego (nieaktywny), w którym znajduje się trypsyna, która wycina jednostki ( 2 aminokwasy - R15-116). Ze względu na mostki siarczkowe utrzymuje się struktura białka. Po działaniu trypsyny powstaje Chymotrypsyna π , która ma zdolność autokatalizy. Dwie jej cząsteczki ( Jedna - enzym, Druga - substrat) biorą udział w kolejnym wycięciu kolejnych 2 aminokwasów - T147-N148) i wtedy powstaje Chymotrypsyna aktywna.

Proteoliza ograniczona - z wielkiego białka wycinane są TYLKO specyficzne odcinki.

Inhibicja allosteryczna - W centrum allosterycznym przyłączane są związki o charakterze efektorów, powodują zmiany w kształcie centrum aktywnego. Wynikiem tego mogą być dwojakie działania - inhibicja bądź aktywacja.

II mechanizm:

Sprzężenie zwrotne: zw. A -(enzym1)-> zw. B -(enzym2)-> zw.C -(enzym3)-> …. ( jest to tzw. Ścieżka metaboliczna) W pewnym momencie produkt staje się inhibitorem, dla kolejnego związku. Przy pewnym stężeniu produkt ostatniej rekacji reaguje z enzymem grupy 1 i ją blokuje, lub drastycznie zwalnia.

KLASYFIKACJA ENZYMÓW

6 klas głównych ( x1 od 1 do 6 - zmienność na tej pozycji ; x2 - x4 od 1 do 99)

(EC. x1, x2, x3, x4)

Każda aktywność enzymu może być scharakteryzowana przez 6 głównych klas.

Nr enzymu ( szereg liczb) -> E.C.

EC.

1 - OKSYDOREDUKTAZY ( przenoszenie protonów i elektronów + tlen)

2 - TRANSFERAZY ( przenoszenie grup - reszt)

3 - HYDROLAZY ( reakcje hydrolizy)

4 - LIAZY ( rozpad wiązań chemicznych bez udziału wody)

5 - LIGAZY/SYNTETAZY ( wytwarzanie nowych wiązań udziałem ATP)

6 - IZOMERAZY ( przegrupowanie wewnątrz komówkowe)

Z wyjątkiem grupy 3 ( białka proste) są to enzymy zbudowane z białek złożonych. Wymagają współpracy koenzymu/gr. Prostetycznej (niebiałkowej).

KOENZYMY OKSYDOREDUKTAZ

Przyłączają się do centrum aktywnego enzymów klasy 1 ( przyłączają się luźno)

NADP+ - funkcja równoważnika redukcyjnego ( jako NAPDH jest donorem wodoru)

Na `ringu' fenolowym zachodzi przyjmowanie protonów i oddawanie elektronów. ( zmiana postaci `ringu' na chinonową)

x-H2 + NAD+ X + NADH + H+

y-H2 + FAD y + FADH2 ( zredukowana postać)

substraty odwodornione -> utlenione i przenoszony H+ na dinukleotydy.

- Reduktazy/oksydoreduktazy ( 2 funkcje enzymów flawinowych). Są to enzymy, które odbierają wodór ze zredukowanych NADH, same się redukując.

NADH + H+ +FAD NAD+(utleniony) + FADH2

- Oksydazy np. oksydaza glukozowa ( jest syntezowana w kom. Mikroorganizmów, powstaje z reszty laktozowej(niestabilna) i FADH2, a H przekazuje na ten atom i powstaje FAD i H2O2 .

β-D-glukoza + O2 + FAD kwas D-glukonowy + H2O2 (rozkładany przez katalazę i peroksydazę)

glukoza + O2 -(oksydaza glukozowa)-> glukonolakton + H2O2

glukonolakton + H2O kwas D-glukonowy

H2O2 -(katalaza, peroksydaza)-> H2O + ½ O2

Glukoza + O2 kw. glukozowy (układ tych enzymów + katalizatory)

Zastosowanie enzymów glu-kat :

  1. glukoniany szeregu metali - najbardziej przyswajalna forma tych minerałów (przemysł farmaceutyczny)

  2. reakcje Maillarda - eliminowane przez enzymy - usunięcie glukozy

  3. soki wchodzą w reakcje z O2 (gdy chcemy odtlenić środowisko w którym jest glukoza)

Gdy usuwamy katalazę i dodajemy peroksydazę:

H2O2 + (ODA)red -(peroksydaza)-> H2O + (ODA)utl

(ODA)utl - wchodzi w reakcję(barwną) z β-D-glukozą. Reakcja używana w biosensorach - urządzenia do szybkiej analizy glukozy (diabetycy)

UBICHINON (koenzym Q)

Akceptor H+ w łańcuchu przenoszenia. Gr. Prostetyczna silnie związana z białkiem Zbudowany z pierścienia chinowego, podstawników i ogona. Rdzeń chinonowy + boczny łańcuch IZOPENTENOLOWY.

FADH2 + CoQ utl FAD + CoQ red

CoQ red - przejmuje protony I elektrony na pierścien chinonowy.

Charakterystyczny związek dla łańcucha oddechowego ( mitochondria) ostatni etap spalania substancji.

PLASTOCHINON - analog ubichinonu, występuje tylko w chloroplastach ,przenoszenie protonów i elektronów w procesie fotosyntezy. Tylko rośliny go posiadają.

CoQ red + 2cyt b (Fe3+) CoQ utl + 2H+ + 2cyt b (Fe2+)

Protony się kumulują - impulsowe przenoszenie przez błony mitochondriów - synteza ATP, bądź ciepła.

Cytochrom b ( grupa prostetyczna hemu) - żelazo przyjmuje/oddaje elektrony.

KWAS LIPONOWY - grupa prostetyczna enzymów, bierze udział w procesach oksydacyjnej dekarboskylazy ( skrócenie łańcucha o 1 atom C i utlenienie go do CO2).

W formie zredukowanej COOH - tworzy wiązanie peptydowe z grupą epsilon-aminową lizyny ( nie jest koenzymem)

Grupy SH - czynią związek podatny na tworzenie mostka disiarczkowego wewnątrz cząsteczek.

KOENZYMY PROSTETYCZNE transferaz, liaz, izomeraz i ligaz.

AMP przenoszone jest (aminoacylowa reszta) powstaje aminoacylo-AMP produkt difosforanowa ; przeniesienie reszty adenozynowej synteza S-adenozyno-metioniny.

Metionina + ATP adenozynometionina + p + p~ (hydroliza do p)

SAM - donor grup metylowych.

CoASH - współdziała z enzymami przenoszącymi gr acylowe

THF + ATP + HCOOH N10- formyloCo-THF + ADP + P

Kwas foliowy przenosi reszty metylowe, hydroksylowe i C=NH.

Biotyna (konieczna do reakcji karboksylacji/ dekarboksylacji) - enzym karboksybiotyna - enzym

Fosforan pirydoksaminy fosforan pirydoksalu

Bierze udział podczas racemizacji/transaminacji/dekarboksylacji aminokwasów.

Kw. askorbinowy (-2H)kw. dehydroaskorbinowy

Konieczna w procesie hydroksylacji proliny (biosynteza białek kolagenowych)

Skóra : światło + 7-dehydrocholesterol cholekalcyferol D3

Wątroba: cholekalcyferol 25-hydroksycholekalcyferol

Nerki: 25-hydroksycholekalcyferol 1,2-dihydroksycholekalcyferol (kalcytriol)

Kalcytriol - podwyższa stężenie Ca2+ w osoczu; pobudza resorpcję Ca i P przez kości i absorbcję Ca2+ z diety w jelicie.

Witamina C + glutation redukują ult. Formę α-tokoferol do pierwotnej zredukowanej postaci.

D3 + glutation potrzebne dla osób po bajpasach.



Wyszukiwarka

Podobne podstrony:
Biochemia 13, TŻ UR, II rok, Biochemia
Biochemia 1, TŻ UR, II rok, Biochemia
Biochemia 12, TŻ UR, II rok, Biochemia
Biochemia 4, TŻ UR, II rok, Biochemia
sprawozdanie oznaczanie sacharydów, TŻ UR, II rok, Analiza i ocena jakości żywności
sprawko oznaczanie zawartości białka, TŻ UR, II rok, Analiza i ocena jakości żywności
mikrooo - egzamin, TŻ UR, II rok, Mikrobiologia żywności, Egzamin
exam z analizy pyt, TŻ UR, II rok, Analiza i ocena jakości żywności
TEST 3, TŻ UR, II rok, Analiza i ocena jakości żywności
26. Aminokwasy i peptydy, Technologia Żywnośći UR, II rok, biochemia
pytania na kolokwium, Technologia Żywnośći UR, II rok, biochemia, Biochemia (Explano88)
wszystkie pytania, Technologia Żywnośći UR, II rok, biochemia
Metody oznaczania bialek, Technologia Żywnośći UR, II rok, biochemia
Ergonomia, Technologia Żywnośći UR, II rok, ERGONOMIA
MELATONINA, II rok, II rok CM UMK, Giełdy, od Joe, biochemia, BIOCHEMIA, GIEŁDY - EGZAMIN, Dodatkowe
6 integracja metabolizmu, Płyta farmacja Poznań, II rok, biochemia
BIOCHEMIA- pojęcia, Studia, II rok, II rok, III semestr, Biochemia

więcej podobnych podstron