O4_Genetyka biol-geo.
1. Poniżej narysowana jest pojedyncza nić DNA;
a) dopisz nić do niej komplementarną, oznacz jej orientację
b) dla zaznaczonych zasad napisz wszystkie możliwe tranzycje i transwersje
c) narysuj nić z delecją 4 i 6 par zasad; która mutacja zmieni ramkę odczytu zakładając, że pierwsza pozycja kodonu to A przy końcu 5'?
......5'-ATTCGTACGATCGATCTGACTGACAGT-3'........
2. Porównujesz sekwencję jednej nici DNA fragmentu pewnego genu wyizolowanego z laboratoryjnego szczepu drożdży z sekwencjami homologicznego fragmentu potomków tych drożdży. Z potomków izolowano DNA, po 100, 200, 300, 400, ..., 1000 pokoleniach. Nazwij, jakie mutacje zachodziły pomiędzy poszczególnymi punktami czasowymi.
a) pokolenie 0: A T T G C T A T A C G A
b) pokolenie100: A T T G C A A T A C G A
c) pokolenie 200: A T T G C C A A T A C G A
d) pokolenie 300 A T T G C C A C G A
e) pokolenie 400 A T C G C C A C G A
f) pokolenie 500 A T C A C C G C G A
g) pokolenie 600 A T C A C C G C G A
i) pokolenie 700 A T C A C C G A G C
3. Etapy klonowania in vivo w plazmidzie bakteryjnym
4. Planowanie ciecia restrykcyjnego: Enzymy dostępne w ZGE
Nazwa l. miejsc miejsce
EcoRI 1 2124
EcoRV 1 2118
HindIII 3 808 995 2112
KpnI 2 1122 2076
NotI 1 2160
PstI 2 1183 2130
PvuII 2 1950 2398
SacI 1 2178
SalI 1 2097
ScaI 1 3947
SmaI 1 2136
SwaI 1 4423
XbaI 1 2154
XhoI 1 2091
O4_Genetyka biol-geo.
ZADANIE DOMOWE
(plan w punktach na kartce)
1. Eksperyment: Od dziesięciu lat zajmujesz się hodowlą i genetyką motyli - cytrynków. Sześć lat temu w Twojej hodowli po raz pierwszy pojawił się biały motyl. Motyl ten był potomkiem pary motyli blisko ze sobą spokrewnionych.
Postanowiłeś ostatnio bliżej przyjrzeć się genowi odpowiadającemu za ubarwienie motylich skrzydeł. Chcesz:
- dowiedzieć się gdzie gen ten leży w genomie motyla
- poznać jego sekwencję
- dowiedzieć się, jaka mutacja spowodowała zanik żółtego ubarwienia
- wyizolować i zbadać białko, kodowane przez ten gen.
Niestety nie znasz sekwencji szukanego genu. Co gorsza, nie zsekwencjonowano dotychczas genomu cytrynków. Na szczęście doskonale orientujesz się w genetyce mendlowskiej i jesteś sprytna/y. Przeprowadziłaś tysiące krzyżówek, które pozwoliły Ci zauważyć, że:
- mutacja powodująca zanik żółtego ubarwienia jest recesywna
- Twój ulubiony gen (YFG) zawsze!!! dziedziczy się wspólnie z genem CYN odpowiedzialnym za ubarwienie oczu motylich. Wnioskujesz stąd, że YFG i CYN leżą bardzo blisko siebie na tym samym chromosomie.
Masz dużo szczęścia, ponieważ sekwencja genu CYN jest znana i dostępna w internetowych bazach danych.
Na 05 - Znajomość technik: ELEKTROFOREZA Southern Blot Sekwencjonowanie
Zadanie domowe:…..
04_Genetyka dla biol-geo. g.molekularna cz.II