AIDS - diagnostyka immunoenzymatyczna i molekularna
Okienko serologiczne - okres od wniknięcia wirusa do wytworzenia przeciwciał.
p24 - najważniejszy antygen we wczesnej diagnostyce
Rodzaje badań:
badania przesiewowe: ELISA, HIV-DUO
badania potwierdzające: Western blot
badania dzieci matek seropozytywnych
badania monitorujące przebieg zakażenia lub skuteczność terapii
Techniki badań:
wykrywanie przeciwciał
wykrywanie antygenu p24
wykrywanie wirusowego RNA
hodowla wirusa
Wykrywanie antygenów i przeciwciał
Metoda ELISA
technika mikropłytek - płytki opłaszczone:
p-ciałami - gdy szukamy antygenów
antygenami - gdy szukamy p-ciał
obecnie stosuje się testy III generacji - rekombinowane antygeny i syntetyczne peptydy o antygenowości białek wirusowych
Schemat:
zamiast enzymu można użyć związku o właściwościach fluorescencyjnych
Metoda HIV-DUO
pozwala na oznaczenie obecności przeciwciał przeciwko wirusowi i obecności antygenu p24 (co umożliwia skrócenie okienka serologicznego)
Western blot
na pasek nitrocelulozowy naniesione są (fabrycznie) antygeny wirusowe
pasek umieszcza się w surowicy
obecne w surowicy przeciwciała wiążą się z antygenami
związane przeciwciała wykrywa się np. metodą immunoenzymatyczną
wynik testu jest (+) gdy obecne są przeciwciała przeciwko co najmniej 3 białkom produkowanym przez 2 geny lub gdy obecne są przeciwciała przeciwko produktom genów env, pol i gag
Przeciwciała należy oznaczać w odstępach 2-4 tygodniowych. 4x wzrost miana świadczy o ostrym zakażeniu.
Testy przesiewowe
test ELISA
test HIV-DUO
(+) wynik testu przesiewowego → powtórka testu przesiewowego
ponowny wynik (+) → potwierdzenie testem Western Blot
U dzieci kobiet seropozytywnych przeciwciała w surowicy mogą pochodzić od matki - należy założyć hodowlę komórkową limfocytów → po 2 tygodniach szukamy w nadsączu antygenów p24.
Wynik wątpliwy ((+) wynik testu przesiewowego i (-) WB) - powtórka testu po 3-4 miesiącach.
Hodowla komórkowa wirusa
hoduje się komórki krwi obwodowej
w płynie hodowlanym oznacza się HIV-RNA, rewertazę i antygen p24
zastosowanie:
u dziecka matki seropozytywnej
po ekspozycji zawodowej
Techniki biologii molekularnej
stosowane w okresie okienka serologicznego
metody:
PCR - reakcja łańcuchowej polimerazy
NASBA - zależna od sekwencji amplifikacja kwasu nukleinowego
bDNA - metoda rozgałęziania DNA
NASBA
stosuje się w przypadku poszukiwania RNA
polega na syntezie nici DNA na matrycy pierwotnej nici RNA, matrycowe RNA ulega rozłożeniu przez nukleazy, powstałe DNA jest matrycą do syntezy kolejnej nici DNA → powstaje dwuniciowy DNA → na matrycy DNA powstaje RNA
bDNA
polega na amplifikacji sond przyłączonych do określonych miejsc w kwasie nukleinowym
PCR
stosowana, gdy (+) wynik ELISA lub HIV-DUO i (-) WB
metoda ta umożliwia poszukiwanie DNA/RNA wirusowego
warunkiem jest znajomość sekwencji nukleotydów poszukiwanego kwasu
używa się kilkunukleotydowych sekwencji - primerów (starterów) - komplementarnych do fragmentu poszukiwanego kwasu
w przypadku obecności poszukiwanego kwasu następuje związanie primera z komplementarnym odcinkiem, co zapoczątkowuje polimeryzację DNA
Schemat:
DNA |
← DNA ← odwrotna transkryptaza ← RNA |
||
↓ |
|
||
denaturacja w 90oC |
|
||
↓ |
|
||
dodanie starterów i renaturacja (przez 2 minuty) |
|
30x powtórzenie cyklu → powielenie materiału genetycznego około 1 mld. razy |
|
↓ |
|
||
związanie starterów |
|
||
↓ |
|
||
polimeraza DNA syntezuje na bazie starterów komplementarne nici z nukleotydów obecnych w roztworze |
Do powielonych nici dodaje się znakowane sondy z enzymem i wykrywa je metodami immunoenzymatycznymi.
Zastosowanie PCR:
HIV
HBV
HCV
CMV
Cytometria przepływowa
stosowana np. do oznaczania populacji limfocytów T (CD3+): TH (CD4+) i TC (CD8+)
2/3
AB
AG
AB
AG
płukanie
AB
E
przeciwciało z enzymem
substrat zmieniający kolor pod wpływem enzymu
odczyt fotometryczny