ANOMOKS NH+4+NO-2N2+2H2O Produktami pośrednimi są NO i hydrazyna. enzym:oksyreduktaza hydroksyloaminy, BrocadiaANATOKSYNA-neurotoksyna wytw przez sinice.ARCHEA-ściana z pseudomureiną,wiąz eterowe w lipidach bł. BACTERIA-ściana z mureną,LPS w błonie zewn,inicjacyjny tRNA z formylometioniną.one tylko:chemilitoauto,wiazanie azotu,fotosynt anoksy.ązaniami jonowymi z kw mikolo.1.barw miesz fuksyny zas i fenolu na gorąco.2.odbar 3%HCl w 95% etanolu(mikr kwasochł nie ulegają odbarw.3.dobarw bł metyl.Wyniki:pratki kwasoodp-czerwone,inne nieb. BIOFILM-3D kolonia bakterii zawartych w macierzy zewnątrzkom polimerów wyk zdolność adhezji do wilgotnych pow stałych oraz do siebie nawzajem Staphylococcus epidermidis,Pseudomonas aeruginosa,E.coli,. CYANOBAKTERIA-jednoko, kolonijne lub nitkowate,fotolitoauto oksygenowe,dwa fotosystemy (PSII i PSI),donor e H2O,chlorofil a,większość ma tylakoidy,ściana gram-,LPS w bł zewn, DOM-staje się niedostepna dla zooplanktonu,znaczna częśc produkcji fitoplanktonu trafia do środ w postacirozpuszcz materi org DOM,może być wyk jedynie przez b heterotrof(wtórni producenci), stają się upostaciowioną mat org POM, może ona zostać zjedzona przez np. wiciowce.FISH- -swoista sonda oligonukleotydowa+barwnik fluores,sonda komplementarna do sekw popisowej,zawartej w 16S rRNA,która jest char dla danego taksonu, próbkę tratuje się odczynnikami,aby błony uległy permeabilizacji-stały się przp dla sond,gotowy prep możemy ogl pod mikr fluores.Zastosowanie:w diagn medycznej,szybka identyf patogena,BADANIA: różnorod zespołów mikroorg,określanie ich liczebn,lokalizacja poszcz mikroom w zespole..HETEROCYSTY-przeksz kom wyst u sinic Nostocales i Stignematales, odp za proces asymilacji azotu z atm, silnie zgrubiałe ściany, uwsteczniony ukld fotosy (tlen nie jest wytw), Zaw nitrogenazę(wiązanie azotu w war beztl.KWASY MIKOLOWE- tylko u Actinobacteria, w ścianie b gram+,są związane z mureną. Zawierają długołańcuchowe węglowodory kalifat,są odp za kwasoodp prątków. KWASY TEJCHOLOWE-kwaśne polisachar przyłączone do kw muraminowego (mureny) w ścianch kom bak gram+ p.Strepto pyogenes(Firmicutes) MUTUALIZM- uzależnia istnienie obu populacji,np.symbionty metanotrof-małże(w skrzelach), Riftia pachyptila i jej endosymbionty utleniające H2S.PLAZMID-cząsteczka DNA występująca w komórce poza chromosomem i zdolna do autonomicznej (niezależnej) replikacji.Nie niosą genów metabolizmu podstawowego, a więc nie są komórce niezbędne do przeżycia. Mogą być przek za pom transdukcji,koniugacji,transformacjiSYNTROFIA-proces, w którym dwa lub wiecej mikroorg różnych gat ściśle ze sobą współprac w pros kat beztl,by rozłożyć na mniejsze cząstki sus,które mogłyby być rozł przez jeden.PROTOKOOPERACJA-symbioza korzystna,ale nie obligatoryjna,np.Azotobacter i Cellulomonas, C rozkuł celuloze do glukozy,A korzysta z niej w zamian daje związany azot.SZCZEPIONKA PODJEDNOSTKOWA-stosuje się w niej jako antygen białko patogena wytw z wyk techn rekombin DNA,szczepionka nowej generacji,antygen danego patogenu na większym nośniku,np. szczepionka WZW B. SZLAK SERYNOWY- u metylotrofów względnych,dzieki transferazie hydroksymetylowej formaldehyd włączony do glicyny i pows seryna a ona do fosfoendopirogronianu (wlączona zostaje cz CO2) powstaje szczawiooctan, który stanowi p wyjscia cyklu Krebsa.REKOMBINACJA ZLOKALIZOWANA-wymaga obecności krótkich spec sekwencji homolog wyst w 2 różnych cz DNA,oprócz nich jest wymagana jest ob. Okr enzymu typu topoizomerazy, przykład: włączanie kaset genowych przez integrony.BAKTERIE GLEBOWE-Oscilatoria,sinice(fotolitoautotrof,tlenowiec, Azotobakter(Proteobacteria) chemoorgano,tlenowiec,-Clostridium,chemoorgano,beztlen. INTEGRONY-elementy genetyczne,które mogą wyłapywać kasety genowe.Integron 0 zawieragen integrafy,enzymu przepr rekom zlokalizowaną i spec sekw DNA, w którą integraza może wstawić kasety genowe oraz promotor,dzieki niemu ekspresja genów w kasetach.PRODUKCJA JOGURTU- Bakterie przetwarzają cukier (laktozę) w kwas mlekowy, który powoduje denaturację zawartego w mleku białka, Streptococcus thermophilus oraz Lactobacillus bulgaricus.OTOCZKI- cienka warstwa otaczająca ścianą,, niełatwo przepuszczalna z polisacharydów.funkcje:ochrona przed wysychaniem,ochrona patogenów przed fagocytozą, przed bakteriofagami, adhezja do podłoży stałych. RUCH-rzęski-struktura półsztywna,ruch obrotowy,białka Mot w ciele podstawowym,białka Fli przekaźnikiem.pusta w środku rurka.Aparat rzęskowy-odbiera sygnały w chemotaksji.SZLAK ACETYLO-COA- u archeanów metanogennych,b homoacetogennych i większości b autotroficznych redukujących siarczany.metoda wytw zw org z CO2. TRANSFER HORYZONTALNY genów- polega na stabilnym przeniesieniu informacji genetycznej z jednego organizmu do drugiego, gdzie przekazane geny podlegają utrwaleniu w genomie.3 rodzaje: 1. Transformacja - pobieranie DNA przez bakterie ze środowiska, dzielimy ją na naturalną i sztuczną,2. Transdukcja - przekazywanie genów przez bakteriofagi do komórki bakteryjnej,3. Koniugacja - przekazywanie genów przez bezpośredni kontakt komórek. TOKSYNA BŁONICZA (toksyna błonicy) pałeczki Corynebacterium diphteriae. Jej działanie prowadzi do wytworzenia błon rzekomych ściśle związanych ze skórą. Toksyny wnikają do krwioobiegu i wykazują powinowactwo do nerek, serca, wątroby i OUN.POLICHYDROMAŚLAN-wytwarzanie bioder masy plastycznej, wyrób toreb. KW GLUTAMINOWY-wyk do prod aminokw, wyk w postaci solo sodowej Jako przyprawa smakowa. MECHANIZMY OBRONNE-przykr się białkami gosp,nierozpoznanie np. Strept pyogenes; unikanie fagocytozy-otoczki(S.pneumoniae). ODDYCHANIE AZOTANOWE(denitryfikacja)-Pseudomonas, Bacillus NO32- +2e+2H+H2O+NO2-. Nitryfikacja(utlenianie amoniaku): 1.amoniakhydroksyloamina (enzym monooksygenaza amoniak) NH3+O2+2e+H+NH2OH+H2O.2.hydroksyloaazotyn NH2OH+0,5O2+H2ONO2-+H2O+H+(oksyredukt hydroksyloam). GENOM BAKTERI: brak intronów,miejsca OriT,chromosomy i plazmidy, 1gen+1białko,haploidalny,brak TATA.ENZYMY RESTRYKCYJNE-niszczące obcy DNA przed się do kom poprzez rozpozna i przecięcie spec sekw DNA. CZYNNIKI WIRULENCJI: ułatwienie kolonizacji i inwazji, umożliwianie zdobycia pokarmy (np. syderofory żelazo).METYLOTROFIA-wyk zw C1 innych niż CO2 jako wegiel i en, np. METANOTROFY-monooksygenaza metanowa, atom tlenu w cz metanumetanolaldechyd mrmrówczanCo2. Wyk szlak serynowy i RMP.ODDYCHANIE ŻELAZOWE-Geobacter(Proteobact).RUCHOME EL GEN: 1bedace replikonami:plazmidy,profagi.2.nie bedace:sekwencje inercyjne,transpozytony,kasety i wysp genowe..CZĄSTKI TRANSDUKUJ-kapsydy fagowe zaw DNA bakt, powst w kom dawcy w czasie transdukcji..HIPERTERMOFILE-1.bialka-zwiększenie stab dzieki wiazaniom jonowym miedzy aminokw, ułożenie hydrofobowe w srodku.2.błony-dużo nierozp kw tł, oporne na denat.3.DNA rożne,np.dodatnie superskręty. EAKTYWNE FORMY TLENU(enzymy): dysmutaza ponadtlenkowa, talaza,peroksydaza. UBSTANCJE ZAPASOWE: Celuloza(Rhizobum)-liniowy polimer glukozy,b.rozkł: ellulomonas,B.Subtilis.Skrobia(Enterobacteriae)D-glukan.Glikogen(Clostridium) mylopektyny i amyloza. OBIEG SIARKI: Oddychanie siarczanowe (dysymil Re siarczanów) siarczany VIceptory el dla desulfo)siarkowodór,siarczki. Asymilacyjna: siarczanyzw.org. FOTOLITOAUTOTROFY siarkowodorsiarkatiosiarczanysiarczany (VI) i to są Sulfo np. Bakterie purpurowe siarkowe-wyk siarkowodor jak akceptor e w proc fotosyntezy,bakteriochlorofil,karotenoidy.