MiP wyk. I 3.10.2012
Temat: Terminologia ogólna.
Mikrobiologia ogólna - zajmuje się charakterystyką ogólnych pojęć z dziedziny mikrobiologii.
Mikrobiologia lekarska - zajmuje się mikroorganizmami chorobotwórczymi dla człowieka
( diagnostyka, profilaktyka, walka z drobnoustrojami ch., zjawiska występujące w ustroju po infekcji).
Mikrobiologia weterynaryjna - jak wyżej, tylko u zwierząt.
Mikrobiologia rolnicza - jak wyżej, tylko u roślin.
Mikrobiologia sanitarna - bada zagadnienia czystości wody, powietrza, pomieszczeń, urządzeń.
Mikrobiologia przemysłowa - wykorzystuje określone gatunki mikroorganizmów w różnorakich branżach przemysłowych (np. w przemyśle spożywczym: produkcja żywności w oparciu o prowadzone przez mikroorganizmy procesy fermentacji beztlenowej i tlenowej: produkcja wina, piwa, kwasu mlekowego, serów, chleba, ciast.
Temat: Wprowadzenie bo bakteriologii.
Bakterie:
- mikroorganizmy jednokomórkowe posiadające ścianę komórkową ( prócz mykoplazmów)
- brak jądra kom.
- DNA zlokalizowane w cytoplazmie
- posiadają 1 (rzadko 2) chromosomy
- mogą zawierać DNA plazmidowe
- szybki wzrost i metabolizm
- rozmnażanie przez podział komórki (bezpłciowo)
- zdolność do horyzontalnego transferu genów (nabywania DNA od innych mikroorganizmów i włączania go do własnego genomu)
- wielkość: 0,2 do kilkudziesięciu μm (mikrometra)
- średnica: 1-2 μm
- kształt: kulisty (ziarniaki, ziarenkowce) owalny, cylindryczny (pałeczki, laseczki) lub spiralny (krętki, przecinkowce, śrubowce)
Antoj van Leeuwenhoek (1623 - 1723) :
- twórca I mikroskopu
- opisał różne rodzaje bakterii i określił ich wielkość
- odkrycie bakterii
- obalenie teorii samorództwa
Louis Pasteur (1822 - 1895) - zasady Pasteura i eksperyment Pasteura.
- przeprowadzenie I udanego testu pasteryzacji (1862r.)
- pierwsze zastosowanie szczepionki przeciw wściekliźnie (1885r.)
4. Pasteryzacja - technika konserwacji przy pomocy odpowiednio dobranego podgrzewania produktów spożywczych, tak aby zniszczyć lub zahamować wzrost drobnoustrojów chorobotwórczych lub enzymów przy jednoczesnym zachowaniu smaku produktów i nie obniżeniu ich wartości odżywczej. Główną zasadą pasteryzacji jest przedłużenie trwałości produktów poprzez unieszkodliwienie form wegetatywnych mikroorganizmów. Proces ten nie niszczy jednak form przetrwalnikowych i większości wirusów.
Bakterie mają temperaturę optymalnego wzrostu.
Ludzkie patogeny rosną w II strefie.
Temperatura ok. 71 - 72 st. C przez 15 - 20 sekund, zabija wszystkie żywe patogeny ( ale nie wszystkie spory).
Złoty wiek mikrobiologii - XIX:
- pasteryzacja (po obserwacji fermentacji)
- powstanie technik aseptycznych (Lister)
- bakteryjna teoria powstawania chorób (Robert Koch)
- szczepienia (E. Jenner: krowianka)
- początek rozwoju immunologii
Bakterioskopia.
Kształt bakterii obserwuje się zwykle po ich wybarwieniu.
Hans Christian Gram (1843 - 1938) - duński farmakolog i lekarz. W 1884r. Opublikował autorską metodę barwienia bakterii.
I : Nałóż materiał na szkiełko, utrwal ciepłem, barw barwnikiem zasadowym (fiolet
gencjany), opłucz.
II : Polej roztworem jodu (płyn Lugola), opłucz.
III : Zmyj alkoholem lub acetonem.
Gram + : niebieska
IV : Dodaj czerwonej safraniny
Gram - : czerwono - różowa
Mechanizm barwienia metodą Grama - barwienie fioletem krystalicznym.
Budowa komórki bakteryjnej:
osłona komórkowa (warstwa powierzchniowa) - składa się ze ściany komórkowej i leżącej pod nią błony cytoplazmatycznej
a) ściana kom. G+ - sztywna ściana, która zapewnia ochronę i nadaje kształt komórce (nie występuje u mykoplazmów)
- głównym składnikiem ściany kom. jest peptydoglikan mureina, która występuje zarówno u G+, jak i u G- (obficiej u G+), mureina składa się z łańcuchów polisacharydowych połączonych ze sobą krótkimi peptydami; do peptydoglikanu przyłączone są kwasy tejchojowe zbudowane z polimerów fosforanów glicerolu bądź rybitolu i ułożone w poprzek mureiny
- ze wszystkimi ścianami kom. bakteryjnej związane są autolizyny - enzymy rozpuszczające warstwę peptydoglikanową; aktywność ta ma zasadnicze znaczenie dla wzrostu ściany kom., tworzenia przegród i osiągania zdolności do transformacji
b) błona cytoplazmatyczna - fizyczna i metaboliczna bariera między wnętrzem
komórki bakteryjnej, a środowiskiem zewnętrznym
selektywna przepuszczalność
bakteryjny system transportu elektronów jako główny system energetyczny
mezosomy są złożonymi wpukleniami błony cytoplazmatycznej, ale nie u wszystkich bakterii
ściana bakterii G- : cieńsza od G+, z dwucząsteczkową warstwą peptydoglikanu, nie zawiera kwasów tejchojowych, zawiera mniej mureiny
- dodatkowa błona zewnętrzna leży ponad warstwą peptydoglikanu
- błona wewnętrzna składa się z podwójnej warstwy białek i lipidów lipopolisacharydów (LPS: endotoksyna); białka to m.in. poryny tworzące kanały przezbłonowe, które biorą udział w transporcie jonów i składników hydrofilowych z otoczenia komórki do przestrzeni okołoplazmatycznej
- część polisacharydowa LPS ma właściwości antygenowe, jest oznaczona jako antygen O
- część lipidowa jest ciepłotrwała i odpowiada za biologiczne działanie endotoksyny
- usunięcie ściany kom., która ochrania delikatną błonę cytoplazmatyczną oraz utrzymuje wysokie stężenie wewnątrzkomórkowe metabolitów, prowadzi do lizy bakterii
- złożoność ściany kom. bakterii G- prowadzi do wrodzonej odporności na
rozkład enzymatyczny
Funkcje ściany kom. bakterii:
ochrona przed ciśnieniem osmotycznym
protekcja przed środowiskiem zewnętrznym (w tym gospodarza)
może decydować o wirulencji (zjadliwości)
jest celem dla antybiotyków: penicylin, wankomycyny, bacytracyny
d) otoczka śluzowa
- zbudowana ze złożonych wielocukrów
- wyst. U G+ i G-
- chroni przed fagocytozą i wysychaniem
- niektóre zjadliwe bakterie (np. laseczka wąglika - Bacillus anthracis) mają otoczkę polipeptydową zbudowaną z kwasu D - glutaminowego. D - aminokwasy są odporne na działanie enzymów proteolitycznych, tym samym taka otoczka zabezpiecza przed fagocytozą
e) ściana kom. bakterii kwasoopornych (prątków)
cienka warstwa mureiny
warstwa polipeptydów i wolnych kwasów mykolowych
warstwa arabinogalaktanu
warstwa składająca się z glikolipidów i wosków
f) kwasy nukleinowe = nukleoid = chromosom bakteryjny
pojedyncza, obrączkowata struktura bez otoczki
DNA to cel dla np. metronidazolu i kwasu nalidyksynowego
Vibrio ma 2 chromosomy, reszta 1
genom podlega rekombinacji czyli wymianie z innymi bakteriami, zapewniającej zmienność genetyczną, zróżnicowanie i przekazywanie cech, np. odporności na leki
u wielu bakterii niewielka ilość DNA pozostaje poza chromosomem: plazmidy kodują zmienną liczbę genów i często odpowiadają za procesy związane ze zjadliwością
genom bakteryjny to chromosom bakteryjny o różnej wielkości w zależności od gatunku bakterii oraz obecności wbudowanych elementów ruchowych - genetycznych (plazmidy, transpozony, bakteriofagi, które zawierają pozachromosalny DNA), nie jest osłonięty żadną błoną
znajduje się tutaj informacja genetyczna dot. podstawowych funkcji życiowych komórki
bakteria z reguły haploidalna (1 chromosom)
g) rybosomy
pełnią podobne funkcje jak u ludzi (translacja)
współczynnik sedymentacji: 70S (jednostek Svedberga)
są liczne
cel wielu antybiotyków: aminoglikozydów, tetracyklin, chloramfenikol, streptomycyny, czyli chemioterapeutyków, które hamują syntezę białek, blokując niektóre procesy metaboliczne na rybosomach
h) fimbrie (pili) - białkowe nici, które pokrywają całą powierzchnię bakterii G- : odgrywają pewną rolę w przyleganiu bakterii do powierzchni błon śluzowych - I etap kolonizacji i zakażenia gospodarza;
fimbrie płciowe (F) biorą udział w koniugacji bakterii
rzęski
- składa się wyłącznie z białka (flageliny) i porusza się ruchem śrubowym wokół ciałka podstawowego
- zapewniają bakterii zdolność ruchu
- występowanie i sposób ułożenia rzęsek jest cechą o znaczeniu taksonomicznym :
a) monotrychalne - mają tylko jedną rzęskę
b) lofotrychalne - rzęski skupione na 1. lub 2. biegunach komórki
c) perytrychalne - rzęski na całej powierzchni kom.
j) cytoplazma (protoplazma)
stanowi hydroszkielet bakterii
wodny koloid, w którym zanurzony jest nukleoid, ciałka wtrętowe (ziarnistości), rybosomy
zawiera wodę, nieorganiczne jony, substancje zapasowe, białka
toczą się tu różne ważne życiowo funkcje komórki bakteryjnej
Budowa bakterii - 1. Pile, 2. Plazmid, 3. Rybosomy, 4. Cytoplazma, 5. Błona zewnętrzna, 6. Ściana komórkowa, 7. Otoczka, 8. Nukleoid,
9. Wić
Zapotrzebowanie bakterii na składniki odżywcze.
Węgiel jest niezbędny do wzrostu wszystkich bakterii!
a) autotrofy - źródłem węgla są substancje nieorganiczne - CO2 (odpowiednik roślin)
b) heterotrofy - źródłem węgla są sub. organiczne (aminokwasy, peptydy, cukry, lipidy) odpowiednik zwierząt
c) chemolitotrofy - źródłem węgla są związki organiczne, a energii proste związki nieorganiczne
d) chemoorganotrofy - tak jak heterotrofy
Sposób oddychania i tolerancja tlenu:
a) bezwzględne tlenowce - wzrost w środowisku bogatym w składniki odżywcze (w tym tlen); ograniczony dostęp tlenu hamuje wzrost; zapotrzebowanie na tlen: 21% O2, np. prątek gruźlicy, laseczka wąglika
b) bezwzględne beztlenowce - rozwijający się w warunkach beztlenowych; zapotrzebowanie
na tlen: mniej niż 0,5 O2, np. laseczki gram dodatnie
c) względne beztlenowce - w obecności tlenu wytwarza ATP poprzez oddychanie tlenowe, ale w przypadku jego braku potrafi pozyskiwać energię na drodze fermentacji; zapotrzebowanie na tlen: 0,5 - 1% O2, np. gronkowce, paciorkowce, pałeczki jelitowe
bakterie mikroaerofilne (aerotolerancyjne) - do życia wymagają tlenu występującego w stężeniu mniejszym niż w ziemskiej atmosferze, tj. ok. 20%; mogą przeżyć, ale nie rosnąć, np. Helicobacter pylori
e)bakterie kapnofilne - pobierają dwutlenek węgla z powietrza) do wzrostu potrzebują warunków microaerofilowych i tlenowych np. Haemophilis influenzal
Wpływ czynników fizycznych na wzrost bakterii:
a) temperatura
- psychrofilne - temp. poniżej 15°C
- mezofilne - temp. optymalna 30 °C do 40 °C
- termofilne - powyżej 20°C
b) pH
c) ciśnienie osmotyczne
Przetrwalniki (spory)
- dot. tylko rodzajów Bacillus sp., Clostridium sp.
- drobnoustroje wytwarzające spory to laseczki
- są to niektóre metaboliczne struktury oporne na niekorzystne warunki środowiska
Adnotacja odnośnie tematu (tego nie było na wykładzie :) na podstawie G. Virella; Borowskiego
Podział drobnoustrojów:
a) komensalne - kolonizują zwykle powierzchnię ciała nie wyrządzając żadnej szkody; często określa się je jako prawidłową florę organizmu, np. pałeczka E. Coli
b) patogenne - działają szkodliwie na organizm gospodarza albo przez bezpośrednią inwazję i uszkodzenie tkanek (np. Shigella sp.) albo wytwarzając szkodliwe produkty toksyczne (np. Clostridium sp.)
c) oportunistyczne - zwykle wyst. w środowisku, ale także są składnikami prawidłowej flory organizmu. Dla zdrowych osób są nieszkodliwe, mogą powodować jednak ciężkie schorzenia u chorych z upośledzoną odpornością lub jeżeli przedostają się do przestrzeni, gdzie prawidłowo nie występują (np. na skutek zabiegu chirurgicznego)
d) wywołujące choroby odzwierzące (zoonozy) - wywołują choroby u kręgowców innych niż ludzie, ale można się nimi zarazić na skutek kontaktu z zakażonymi zwierzętami lub produktami pochodzenia zwierzęcego
Zjadliwość drobnoustrojów - względna zdolność do wywołania choroby. Czynniki, które składają się na patogenne działanie drobnoustrojów są nazywane czynnikami zjadliwości:
a) adhezyny (czynniki kolonizacji) - białka związane z zewnętrznymi warstwami
bakterii. Adhezyny determinują przyleganie do komórek błon śluzowych, co jest
niezbędnym etapem kolonizacji ustroju gospodarza.
b) otoczki - zbudowane zwykle z polisacharydów, hamują fagocytozę lub chronią
bakterię przed strawieniem po wchłonięciu jej przez komórkę fagocytarną
c) endotoksyny - chemicznie składające się z cząsteczek lipidu i polisacharydu
są składnikiem ściany kom. bakterii G-. Endotoksyny są uwalniane w chwili
śmierci komórki i mogą być przyczyną wstrząsu septycznego.
d) egzotoksyny - toksyczne białka wydzielane przez bakterie. Często jako jedyny
czynnik zjadliwości danego drobnoustroju mogą być odpowiedzialne za główne
objawy kliniczne zakażenia (np. enterotoksyny wywołują biegunkę, neurotoksyny
porażenie)
e) egzoenzymy - są uważane za czynniki zjadliwości wtedy, gdy rozkładają materiał komórkowy lub niszczą antybiotyki
Postulaty Kocha - w XIXw. R. Koch opracował metodologiczne zasady ustalania
chorób wywołanych przez drobnoustroje:
I. Dany drobnoustrój występuje w każdym przypadku badanej choroby w warunkach które mogą odpowiadać za zmiany patologiczne i przebieg kliniczny choroby.
II. Dany drobnoustrój nie występuje w żadnej innej chorobie jako przypadkowy i niepatogenny pasożyt.
III. Dany drobnoustrój po wyizolowaniu z organizmu gospodarza i namnożeniu w czystej hodowli może wywołać tę samą chorobę u innego gospodarza.
Bakterie są większe i bardziej złożone od wirusów. Są organizmami żywymi należącymi do Królestwa Prokariota, które obejmuje bakterie i sinice. Bakterie zawierają DNA i RNA, rozmnażają się w procesie bezpłciowym, określanym jako podział prosty. Większość bakterii patogennych jest zdolna do niezależnego wzrostu, czyli można je hodować na sztucznych pożywkach.