PEPTYDY-GENERAL, CHEMIA UŁ, 3 rok, Biochemia


Tabela 1. Reprezentatywne aminokwasy i ich reszty aminoacylowe

0x01 graphic

0x01 graphic

0x01 graphic

0x01 graphic

K. karboksylowy

[R=CH3 -

k. octowy; acetic acid]

Grupa acylowa; acyl

[R=CH3 - acetyl]

K. aminokarboksylowy

Grupa aminoacylowa; aminoacyl

0x01 graphic

0x01 graphic

0x01 graphic

0x01 graphic

Glicyna

Glicyl

Alanina

Alanyl

0x01 graphic

0x01 graphic

0x01 graphic

0x01 graphic

K. asparginowy

aspartyl

Aspargina

Asparaginyl

Tabela 9. Symbole reszt i pochodnych aminokwasowych

STRUKTURA

SKRÓT

NAZWA

0x01 graphic

Tfa-Gly

N -trifluoroacetyloglicyna

0x01 graphic

Gly-OEt

ester etylowy glicyny

0x01 graphic

EtMe-Gly

N-etylo-N-metylo-glicyna

0x01 graphic

Asp-NH2

izoasparagina

0x01 graphic

0x01 graphic

S-benzylocysteina

0x01 graphic

0x01 graphic

0x01 graphic

0x01 graphic

Ester α-benzylowy-β-tert-butylowy

kwasu N-benzyloksy-karbonylo-

asparaginowego

0x01 graphic

0x01 graphic

0x01 graphic

0x01 graphic

N-α-acetylolizyna

0x01 graphic

0x01 graphic

N-ε-acetylolizyna

0x01 graphic

0x01 graphic

PEPTYDY

0x01 graphic

Alanylo-

-serylo-

-aspartylo-

-fenyloalanylo-

-glicyna

Nomenklatura aminokwasów

Aminokwas

Aminokwas

N-końcowy

(wg. Bayleya)

C-końcowy

początkowy

(wg. Fromageouta)

końcowy

Zapisy sekwencji peptydu

Greenstein & Winitz

H2+-Ala-Ser-Asp-Phe-Gly-OH

0x01 graphic

H2+-Ala-Ser-Asp-Phe-Gly-O-

H2+-Ala-Ser-Asp-Phe-Gly-O-

0x01 graphic

H-Ala-Ser-Asp-Phe-Gly-O-

H-Ala-Ser-Asp-Phe-Gly-OH

ZAPISY SEKWENCJI

0x01 graphic

0x01 graphic

Boc-Ala-Ser(But)-Asp(OBut)-Phe-Gly

WIĄZANIE PEPTYDOWE

0x01 graphic

PEPTYDY

STRUKTURA PIERWSZORZĘDOWA PEPTYDU ≡

LICZBA I SEKWENCJA AK W PEPTYDZIE

Ala-Ser-Asp-Phe-Gly

Sekwencja pentapeptydu

-Ala-Ser-Asp-Phe-Gly-

Sekwencja pięciu AK w pentapeptydzie

Ala-Ser-(Tyr, Phe, Arg, Pro)-Phe-Gly

Sekwencja (AK) nie znana

PRZEDSTAWIANIE WIĄZAŃ α-, γ- & ω-PEPTYDOWYCH

GLUTAMYLOLIZYNA

0x01 graphic

0x01 graphic

0x01 graphic

0x01 graphic

γ-Glutamylo-Nε-lizyna

0x01 graphic

0x01 graphic

0x01 graphic

0x01 graphic

lub

0x01 graphic

Glutamylolizyna

α-Glutamylo-Nε-lizyna

WIĄZANIA α-PEPTYDOWE & γ-PEPTYDOWE

0x01 graphic

Glutation (zredukowany)

0x01 graphic

lub

0x01 graphic

PODZIAŁ PEPTYDÓW ZE WZGLĘDU NA STRUKTURĘ

ZALEŻNIE OD RODZAJU WIĄZAŃ:

  1. PEPTYDY HOMOMERYCZNE

- zawierają głównie wiązania peptydowe - złożone wyłącznie z aminokwasów

2. PEPTYDY HETEROMOMERYCZNE

- zawierają dodatkowe elementy strukturalne (np. hydroksykwasy, reszty kwasów tłuszczowych, itp.) -

oprócz wiązań peptydowych zawierają w. estrowe, tioestrowe, disiarczkowe

2.1. DEPSIPEPTYDY (zawierające w. estrowe)

2.2. PEPTOLIDY (zawierające hydroksykwasy)

2.3. PEPTOIDY (lipo-, gliko-, fosfo- i chromopeptydy)

STRUKTURA PEPTYDÓW HOMEOMERYCZNYCH

PEPTYDY HOMODETYCZNO-HOMOMERYCZNE

PEPTYDY HETERODETYCZNO-HOMOMERYCZNE

PEPTYDY HOMODETYCZNO-HOMOMERYCZNE

1. Peptyd liniowy

0x01 graphic

2. Peptyd rozgałęziony

0x01 graphic

0x01 graphic

3. Peptydy cykliczne

3. Peptydy cykliczne nie-rozgałęzione

3. Peptydy cykliczne rozgałęzione

0x01 graphic

0x01 graphic

PEPTYDY HETERODETYCZNO-HOMOMERYCZNE

1. O-Peptyd liniowy

2. S-Peptyd liniowy

0x01 graphic

0x01 graphic

3. Peptyd cykliczny (disulfid)

4. Peptyd cykliczny rozgałęziony

(lakton peptydu)

0x01 graphic

0x01 graphic

ZAPIS SEKWENCJI CYKLOPEPTYDU HOMEOMERYCZNEGO TYPU HOMODETYCZNEGO

1.

0x01 graphic

2a.

0x01 graphic

2b.

0x01 graphic

0x01 graphic

0x01 graphic

PODZIAŁ PEPTYDÓW ZE WZGLĘDU NA EFEKT FIZJOLOGICZNY

Hormony peptydowe

Trzustki (insulina, glukagon);

Tarczycy (andrenokortykotropina);

Przytarczki ( tyrokalcytonina);

Przewodu żołądkowo-jelitowego - niegruczołowe hormony peptydowe (gastryna);

Neuropeptydy

Neurotransmitery;

Neuromodulatory;

Endogenne peptydy opiatowe

NAZEWNICTWO POCHODNYCH PEPTYDÓW

Angiotensyna II

Asp1-Arg2-Val3-Tyr4-Ile5-His6-Pro7-Phe8

1. Wymiana reszty aminokwasowej

Asp1-Arg2-Val3-Phe4-Ile5-His6-Pro7-Phe8

[Phe4]angiotensyna II

Asp1-Lys2-Val3-Tyr4-Ile5-His6-Pro7-Phe8

[Lys2]angiotensyna II

2. Przedłużenie łańcucha peptydu

Arg-Asp1-Arg2-Val3-Tyr4-Ile5-His6-Pro7-Phe8

Arg-angiotensyna II;

Arginyloangiotensyna II

Asp1-Arg2-Val3-Tyr4-Ile5-His6-Pro7-Phe8-Met

Angiotensylo-Met;

Angiotensylo-metionina

3. Włączenie dodatkowej reszty aminokwasowej (endo)

Asp1-Arg2-Gly2a-Val3-Tyr4-Ile5-His6-Pro7-Phe8

Endo-Gly2a-angiotensyna II;

Endo-2a-glicyloangiotensyna II;

4. Opuszczenie reszty aminokwasowej (dez)

Asp1-Arg2-Val3-Ile5-His6-Pro7-Phe8

Dez-Tyr4-angiotensyna II;

Dez-4-tyrozyna-angiotensyna II

5. Sekwencje cząstkowe

Arg2-Val3-Tyr4-Ile5-His6-Pro7

Angiotensyna II-

-(2-7)-heksapeptyd

6. Podstawienie w łańcuchach bocznych

0x01 graphic

Cβ1-Gly-angiotensyna II;

Cβ1-Glicyloangiotensyna II

Asp1-Lys2-Val3-Phe4-Ile5-His6-Pro7-Phe8

[Lys2]angiotensyna II

0x01 graphic

Nε2-Val-[Lys2]angiotensyna II;

Nε2-walilo-[Lys2]angiotensyna II

11



Wyszukiwarka

Podobne podstrony:
PEPTYDY-ANALIZA, CHEMIA UŁ, 3 rok, Biochemia
równowagi protolityczne aminokwasów, CHEMIA UŁ, 3 rok, Biochemia
AK-REACTIVITY, CHEMIA UŁ, 3 rok, Biochemia
AK-BIOSYNTEZA, CHEMIA UŁ, 3 rok, Biochemia
sciaga I koło, CHEMIA UŁ, 4 rok, Krystalografia
krystalografia kolokwium I LAB, CHEMIA UŁ, 4 rok, Krystalografia
Kryształki lab ściąga, CHEMIA UŁ, 4 rok, Krystalografia
spektroskopia ściągi, CHEMIA UŁ, 4 rok, Spektroskopia
Spektroskopia LAB kolokwium, CHEMIA UŁ, 4 rok, Spektroskopia
Peptydy i białka, STOMATOLOGIA, II ROK, Biochemia, zbiorcze
1a i 1b, CHEMIA UŁ, 2 rok, Analiza instrumentalna
wyklad 1 1 2008, CHEMIA UŁ, 3 rok, Fizyczna, różne
Tabelka LabolatoriumI, ANALITYKA CHEMICZNA- UŁ, Rok I, CHEMIA OGÓLNA I, I- laboratorium
Deklaracja jezyki, Studia - Chemia kosmetyczna UŁ, I rok
Przykładowe egzaminy, Studia - Chemia kosmetyczna UŁ, I rok, II semestr, MATEMATYKA wykłady
26. Aminokwasy i peptydy, Technologia Żywnośći UR, II rok, biochemia
Zajęcia 3, Studia - Chemia kosmetyczna UŁ, I rok, II semestr, CHEMIA OGÓLNA II konwersatorium
PEPTYDY-GENERAL, biochemia, kolokwium - wyklad
Sprawozdanie Nr. 8 (ilościowa), AGH WIMiC, Rok II, Chemia Nieograniczna ROK II, Laboratoria

więcej podobnych podstron